Proteogenomisk overvågning og vurdering af levertransplantationsmodtagere ("Mini-Liver")

Med fremkomsten af ​​mere følsomme molekylære teknikker er biomarkører for nyretransplantationsafstødning blevet foreslået, som potentielt er meget mere følsomme, specifikke og hurtigt testbare end konventionelle prædiktorer for graftfunktion såsom GFR eller vævsbiopsier. Nogle af de tidlige biomarkører under denne udvikling var de cytotoksiske T-celle (CTL) transkripter som perforin, granzym B og fas ligand 11-13 til akut afstødning. I tilfælde af CAN/IFTA og CKD forbliver de molekylære mekanismer og testbare biomarkører også uklare. Nogle få undersøgelser har rapporteret involvering af TGF-beta, ekstracellulære matrixproteiner som fibronectin og thrombopondin og vævsinhibitorer af metalloproteiner (TIMP'er) som værende opreguleret hos patienter med kronisk allograft nefropati (CAN/IFTA). De fleste af disse undersøgelser blev udført i nyretransplantationsbiopsier, og udfordringen med at teste deres udtryk og korrelation i PBL som et minimalt invasivt værktøj blev kun behandlet i nogle få undersøgelser. En anden begrænsning ved disse første undersøgelser var manglen på evnen til at profilere gener globalt. Til dette formål har fremkomsten af ​​DNA-mikroarrays medført et kvantespring i evnen til at profilere tusindvis af gener samtidigt. Hidtil er mikroarray-analyse blevet rapporteret i nyretransplantationsundersøgelser, der implicerer gensignaturer for akut afstødning i transplantationsbiopsier såvel som for første gang af os i perifert blod. Så vidt vi ved, har kun to undersøgelser forsøgt at profilere CAN/IFTA i perifert blod. En nylig undersøgelse forsøgte at validere tre gener, der var afledt af en mikroarray-analyse af nyrebiopsier ved hjælp af RT-qPCR. Alle tre gener blev signifikant differentielt udtrykt i urin, men ikke i PBL. En anden undersøgelse, der brugte mikroarrays, viste, at blandt et panel af 49 gener fra perifert blod, der påstås at skelne mellem "operationel tolerance" ved nyreafstødning, kunne 33 gener også skelne "kronisk afstødning" med 86% specificitet.

De fleste undersøgelser i litteraturen, inklusive vores egen, såvel som vores nyere upublicerede genekspressionsundersøgelser af perifert blod af AR og CAN/IFTA afslører klare molekylære signaturer for begge disse former for transplantationsresultater. Sammenfattende etablerer disse data et første bevis på, at genekspressionsprofilering af perifert blod kan bruges til at udvikle markører for nyre-allotransplantatafstødning og kronisk nyreskade.