Proteogenomické monitorování a hodnocení příjemců transplantace jater ("Mini-Liver")

S příchodem citlivějších molekulárních technik byly navrženy biomarkery odmítnutí transplantátu ledviny, které jsou potenciálně mnohem citlivější, specifičtější a rychle testovatelné než konvenční prediktory funkce štěpu, jako je GFR nebo tkáňové biopsie. Některé z časných biomarkerů během tohoto vývoje byly transkripty cytotoxických T-buněk (CTL), jako je perforin, granzym B a fas ligand 11-13 pro akutní odmítnutí. V případě CAN/IFTA a CKD zůstávají molekulární mechanismy a testovatelné biomarkery také nejasné. Několik studií uvádí, že u pacientů s chronickou aloštěpovou nefropatií (CAN/IFTA) dochází k nadměrné regulaci TGF-beta, proteinů extracelulární matrix, jako je fibronektin a trombopondin a tkáňových inhibitorů metaloproteinů (TIMP). Většina těchto studií byla provedena na biopsiích transplantovaných ledvin a výzvou testování jejich exprese a korelace v PBL jako minimálně invazivního nástroje se zabývalo pouze několik studií. Dalším omezením těchto prvních studií byl nedostatek schopnosti profilovat geny globálně. Za tímto účelem příchod DNA mikročipů přinesl kvantový skok ve schopnosti profilovat tisíce genů současně. Doposud byla ve studiích transplantace ledvin popsána analýza mikročipů, která implikuje genové podpisy pro akutní odmítnutí v biopsiích transplantátu a také poprvé u nás v periferní krvi. Pokud je nám známo, pouze dvě studie se pokusily profilovat CAN/IFTA v periferní krvi. Nedávná studie se pokusila ověřit tři geny, které byly odvozeny z mikročipové analýzy biopsií ledvin pomocí RT-qPCR. Všechny tři geny byly významně odlišně exprimovány v moči, ale ne v PBL. Další studie využívající microarrays ukázala, že mezi panelem 49 genů periferní krve, které měly rozlišovat „provozní toleranci“ při odmítnutí ledvin, 33 genů také dokázalo rozlišit „chronické odmítnutí“ s 86% specificitou.

Většina studií v literatuře, včetně naší vlastní, stejně jako naše novější nepublikované studie genové exprese periferní krve AR a CAN/IFTA odhalují jasné molekulární podpisy pro obě tyto formy výsledků transplantace. Stručně řečeno, tato data představují první důkaz konceptu, že profilování genové exprese periferní krve může být použito k vývoji markerů odmítnutí aloštěpu ledviny a chronického poškození ledvin.