Протеогеномный мониторинг и оценка реципиентов трансплантата печени ("Mini-Liver")

С появлением более чувствительных молекулярных методов были предложены биомаркеры отторжения почечного трансплантата, которые потенциально гораздо более чувствительны, специфичны и поддаются быстрому тестированию, чем обычные предикторы функции трансплантата, такие как СКФ или биопсия тканей. Некоторыми из ранних биомаркеров в ходе этой эволюции были транскрипты цитотоксических Т-клеток (CTL), такие как перфорин, гранзим B и лиганд fas 11-13 для острого отторжения. В случае CAN/IFTA и CKD молекулярные механизмы и тестируемые биомаркеры также остаются неясными. В нескольких исследованиях сообщалось об участии TGF-бета, белков внеклеточного матрикса, таких как фибронектин и тромбопондин, и тканевых ингибиторов металлопротеинов (TIMP), которые активируются у пациентов с хронической аллотрансплантатной нефропатией (CAN/IFTA). Большинство этих исследований было проведено с биопсией почечного трансплантата, и только в нескольких исследованиях решалась задача тестирования их экспрессии и корреляции в PBL как минимально инвазивного инструмента. Еще одним ограничением этих первых исследований было отсутствие возможности для глобального профилирования генов. С этой целью появление ДНК-микрочипов привело к качественному скачку в возможности одновременного профилирования тысяч генов. До сих пор в исследованиях по трансплантации почки сообщалось об анализе микрочипов, включающем сигнатуры генов для острого отторжения в биоптатах трансплантата, а также впервые нами в периферической крови. Насколько нам известно, только два исследования пытались определить профиль CAN/IFTA в периферической крови. В недавнем исследовании была предпринята попытка проверить три гена, которые были получены в результате микрочипового анализа биоптатов почек с использованием RT-qPCR. Все три гена значительно по-разному экспрессировались в моче, но не в PBL. Другое исследование с использованием микрочипов показало, что среди группы из 49 генов периферической крови, которые должны были различать «операционную толерантность» при отторжении почек, 33 гена также могут различать «хроническое отторжение» со специфичностью 86%.

Большинство исследований в литературе, включая наши собственные, а также наши более поздние неопубликованные исследования экспрессии генов AR и CAN/IFTA в периферической крови, выявляют четкие молекулярные сигнатуры для обеих этих форм исходов трансплантации. Таким образом, эти данные устанавливают первое доказательство концепции того, что профилирование экспрессии генов периферической крови может быть использовано для разработки маркеров отторжения почечного аллотрансплантата и хронического повреждения почек.