Proteogenomisk övervakning och bedömning av levertransplantationsmottagare ("Mini-Liver")

Med tillkomsten av mer känsliga molekylära tekniker har biomarkörer för avstötning av njurtransplantat föreslagits som är potentiellt mycket mer känsliga, specifika och snabbt testbara än konventionella prediktorer för transplantatfunktion såsom GFR eller vävnadsbiopsier. Några av de tidiga biomarkörerna under denna utveckling var de cytotoxiska T-cell (CTL) transkripten som perforin, granzym B och fas ligand 11-13 för akut avstötning. När det gäller CAN/IFTA och CKD är de molekylära mekanismerna och testbara biomarkörerna också oklara. Ett fåtal studier har rapporterat inblandning av TGF-beta, extracellulära matrisproteiner som fibronektin och trombopondin och vävnadshämmare av metalloproteiner (TIMPs) som uppreglerade hos patienter med kronisk allograftnefropati (CAN/IFTA). De flesta av dessa studier gjordes i njurtransplantationsbiopsier och utmaningen att testa deras uttryck och korrelation i PBL som ett minimalt invasivt verktyg togs endast upp i ett fåtal studier. En annan begränsning av dessa första studier var bristen på förmågan att profilera gener globalt. För detta ändamål har tillkomsten av DNA-mikroarrayer åstadkommit ett kvantsprång i förmågan att profilera tusentals gener samtidigt. Hittills har mikroarrayanalys rapporterats i njurtransplantationsstudier som implicerar gensignaturer för akut avstötning i transplantationsbiopsier såväl som för första gången av oss i perifert blod. Såvitt vi vet har endast två studier försökt profilera CAN/IFTA i perifert blod. En nyligen genomförd studie försökte validera tre gener som härrörde från en mikroarrayanalys av njurbiopsier med RT-qPCR. Alla tre generna uttrycktes signifikant differentiellt i urin men inte i PBL. En annan studie med mikroarrayer visade att bland en panel av 49 gener från perifert blod som påstods särskilja "operativ tolerans" vid njuravstötning, kunde 33 gener också urskilja "kronisk avstötning" med 86% specificitet.

De flesta studier i litteraturen, inklusive vår egen, såväl som våra nyare opublicerade studier av genuttryck av perifert blod av AR och CAN/IFTA avslöjar tydliga molekylära signaturer för båda dessa former av transplantationsresultat. Sammanfattningsvis etablerar dessa data ett första bevis på att genuttrycksprofilering av perifert blod kan användas för att utveckla markörer för njurallotransplantatavstötning och kronisk njurskada.