Maksansiirron saajien proteogenominen seuranta ja arviointi ("Mini-Liver")

Herkempien molekyylitekniikoiden myötä on ehdotettu munuaissiirteen hylkimisen biomarkkereita, jotka ovat mahdollisesti paljon herkempiä, spesifisempiä ja nopeasti testattavia kuin tavanomaiset siirteen toiminnan ennustajat, kuten GFR tai kudosbiopsiat. Jotkut tämän evoluution varhaisista biomarkkereista olivat sytotoksiset T-solut (CTL) -transkriptit, kuten perforiini, grantsyymi B ja fas-ligandi 11-13 akuutin hyljinnän vuoksi. Myös CAN/IFTA:n ja CKD:n tapauksessa molekyylimekanismit ja testattavat biomarkkerit jäävät epäselväksi. Muutamat tutkimukset ovat raportoineet TGF-beetan, solunulkoisten matriisiproteiinien, kuten fibronektiinin ja trombopondiinin, sekä metalloproteiinien kudosestäjät (TIMP) lisääntyneen potilailla, joilla on krooninen allograftinefropatia (CAN/IFTA). Suurin osa näistä tutkimuksista tehtiin munuaissiirtobiopsioissa, ja haasteeseen testata niiden ilmentymistä ja korrelaatiota PBL:ssä minimaalisesti invasiivisena työkaluna käsiteltiin vain muutamissa tutkimuksissa. Toinen näiden ensimmäisten tutkimusten rajoitus oli voiman puute profiloida geenejä maailmanlaajuisesti. Tätä tarkoitusta varten DNA-mikrosirujen tulo on saanut aikaan suuren harppauksen kyvyssä profiloida tuhansia geenejä samanaikaisesti. Tähän mennessä on raportoitu microarray-analyysiä munuaissiirtotutkimuksissa, jotka viittaavat akuuttiin hylkimisreaktioon liittyviin geenikirjoihin elinsiirtobiopsioissa sekä ensimmäistä kertaa ääreisveressä. Tietojemme mukaan vain kaksi tutkimusta on yrittänyt profiloida CAN/IFTA:ta perifeerisestä verestä. Äskettäisessä tutkimuksessa yritettiin validoida kolme geeniä, jotka oli johdettu munuaisbiopsioiden mikrosiruanalyysistä RT-qPCR:llä. Kaikki kolme geeniä ilmentyivät merkittävästi eri tavalla virtsassa, mutta eivät PBL:ssä. Toinen tutkimus, jossa käytettiin mikrosiruja, osoitti, että 49 perifeerisen veren geenin joukosta, joiden oli tarkoitus erottaa "toiminnallinen toleranssi" munuaisten hylkimisreaktiossa, 33 geeniä pystyi myös erottamaan "kroonisen hylkimisen" 86 %:n spesifisyydellä.

Suurin osa kirjallisuuden tutkimuksista, mukaan lukien omamme, sekä uudemmat julkaisemattomat perifeerisen veren geenin ilmentymistutkimuksemme AR:sta ja CAN/IFTA:sta paljastavat selkeät molekyyliset allekirjoitukset molemmille näille elinsiirron tuloksille. Yhteenvetona nämä tiedot muodostavat ensimmäisen todisteen siitä, että perifeerisen veren geeniekspression profilointia voidaan käyttää munuaissiirteen hylkimisreaktion ja kroonisen munuaisvaurion merkkiaineiden kehittämiseen.