Pronostisk og prediktiv verdi av EMT ved lokalisert lungekreft (TWISTlung)

Et kritisk problem i å studere onkogenese er den omfattende forståelsen av tumorgenomkompleksitet. Molekylære subtyper kan identifiseres gjennom storskala molekylære screeninger eller genekspresjonsanalyser og molekylære signaturer er anerkjent som en relevant kilde til sykdomsstratifisering.

Etterforskerne vil fokusere på NSCLC-pasienter med lokaliserte sykdommer inkludert i ONCOHEGP-vevsinnsamlingsprosjektet (OncoHEGP, Ministere de la Recherche n° DC 2009-950). Etterforskerne hadde tidligere vist at i EGFR-mutert kreft var reaktivering av TWIST1 reversibelt knyttet til EMT og til overlevelse. For å gå videre, planlegger etterforskerne å undersøke EMT i en stor gruppe pasienter med lungekreft for å identifisere prognostiske og prediktive markører for langsiktig overlevelse.

Etterforskerne vil integrere mutasjons- og kopieringsendringer til EMT-genekspresjonsanalyser og til EMT-relatert miR-kvantifisering. Tumorfenotype, miR-signaturer, mutasjonsstatus vil bidra til å klassifisere pasienter i henhold til overlevelse.

Kliniske data vil bli vurdert takket være epitordatabasen. Epithor er en statlig anerkjent klinisk database, akkreditert av de franske helsemyndighetene (Haute Autorité de Santé) og støttes av National Cancer Institute (Institut National du Cancer).

EMT-karakterisering og scoring vil bli gjort ved å bruke 10 markører ved qPCR, mutasjons- og CNV-screeninger ved målrettet NGS-analyse, miRs-signatur av MIRSeq og qPCR.