Проностическая и прогностическая ценность ЕМТ при локализованном раке легкого (TWISTlung)

Одной из важнейших проблем в изучении онкогенеза является всестороннее понимание сложности генома опухоли. Молекулярные подтипы могут быть идентифицированы посредством крупномасштабного молекулярного скрининга или анализа экспрессии генов, а молекулярные сигнатуры признаются важным источником стратификации заболевания.

Исследователи сосредоточатся на пациентах с НМРЛ с локализованными заболеваниями, включенных в проект сбора тканей ONCOHEGP (OncoHEGP, Ministrye de la Recherche № DC 2009-950). Исследователи ранее показали, что при раке с мутацией EGFR реактивация TWIST1 была обратимо связана с ЕМТ и выживаемостью. Чтобы пойти дальше, исследователи планируют исследовать ЕМТ у большой когорты пациентов с раком легких, чтобы определить прогностические и прогностические маркеры долгосрочной выживаемости.

Исследователи будут интегрировать мутацию и изменения количества копий в анализ экспрессии генов EMT и в количественную оценку miR, связанную с EMT. Фенотип опухоли, сигнатуры miR, статус мутации помогут классифицировать пациентов по выживаемости.

Клинические данные будут оцениваться благодаря базе данных epithor. Epithor является официально признанной клинической базой данных, аккредитованной французскими органами здравоохранения (Haute Autorité de Santé) и поддерживаемой Национальным институтом рака (Institut National du Cancer).

Характеристика и оценка EMT будут выполняться с использованием 10 маркеров с помощью количественной ПЦР, скрининга мутаций и CNV с помощью целевого анализа NGS, сигнатуры miR с помощью MIRSeq и количественной ПЦР.