Valeur pronostique et prédictive de l'EMT dans le cancer localisé du poumon (TWISTlung)

Une question critique dans l'étude de l'oncogenèse est la compréhension globale de la complexité du génome tumoral. Les sous-types moléculaires peuvent être identifiés par des criblages moléculaires à grande échelle ou des analyses d'expression génique et les signatures moléculaires sont reconnues comme une source pertinente de stratification de la maladie.

Les investigateurs se concentreront sur les patients NSCLC avec des maladies localisées inclus dans le projet de collecte de tissus de l'ONCOHEGP (OncoHEGP, Ministère de la Recherche n° DC 2009-950). Les chercheurs avaient précédemment montré que dans le cancer muté par l'EGFR, la réactivation de TWIST1 était liée de manière réversible à l'EMT et à la survie. Pour aller plus loin, les chercheurs envisagent d'étudier l'EMT dans une large cohorte de patients atteints d'un cancer du poumon afin d'identifier des marqueurs pronostiques et prédictifs de la survie à long terme.

Les chercheurs intégreront les mutations et les modifications du nombre de copies aux analyses de l'expression génique EMT et à la quantification miR liée à l'EMT. Le phénotype tumoral, les signatures miR, le statut mutationnel aideront à classer les patients en fonction de leur survie.

Les données cliniques seront évaluées grâce à la base de données epithor. Epithor est une base de données clinique reconnue par le gouvernement, accréditée par la Haute Autorité de Santé et soutenue par l'Institut National du Cancer.

La caractérisation et la notation EMT seront effectuées à l'aide de 10 marqueurs par qPCR, de dépistages de mutation et de CNV par analyse NGS ciblée, de signature miRs par MIRSeq et qPCR.