Evaluer tarmmikrobiomet hos pasienter med erosiv gastroøsofageal reflukssykdom og i asymptomatiske friske kontroller
Studieoversikt
Status
Detaljert beskrivelse
Bakgrunn: Patofysiologien til gastroøsofageal reflukssykdom (GERD) involverer flere mekanismer. Intestinal dysbiose kan påvirke faktorer involvert i patofysiologien til gastroøsofageal reflukssykdom, slik som endringer i gastrointestinale motoriske mønstre og økt intraabdominalt trykk på grunn av økt fermentering av ikke-fordøyelige karbohydrater. Imidlertid har få studier fokusert på vurdering av tarmmikrobiom i GERD. I denne studien undersøkte vi intestinale mikrobiomer, hos individer med gastroøsofageal reflukssykdom og friske individer, ved bruk av metagenomiske teknikker.
Metoder: Vi utførte en studie som omfattet fekale prøver av 22 voksne i alderen 18-60 år: 11 med erosiv øsofagitt (åtte menn og tre kvinner) og 11 friske kontroller (ti menn og en kvinne). Mikrobiom-DNA ble ekstrahert fra avføringsprøver, og polymerasekjedereaksjonamplifisering ble utført ved bruk av primere for V4-regionen til 16S rRNA-genet (16S ribosomal ribonukleinsyre). Amplikonene ble sekvensert ved bruk av Ion Torrent™ Personal Genome Machine™-plattformen, og data ble analysert ved bruk av QIIME™ programvareversjon 1.8 (Quantitative Insights Into Microbial Ecology).
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
São Paulo, Brasil, 04014-020
- Hospital das Clínicas da FMUSP
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- en bekreftet diagnose av erosiv GERD gjennom kliniske og endoskopiske kriterier
- som ikke har tatt omeprazol eller noe annet medikament som endrer mage-pH i løpet av de tretti dagene før fullføringen av diagnostiske tester for GERD og andre tester inkludert i protokollen.
Ekskluderingskriterier:
- Bruk av antimikrobielle midler eller probiotika de siste tre månedene
- Tilstedeværelse av alvorlig og/eller omfattende atrofisk gastritt bekreftet histologisk
- Komorbiditeter som kan forstyrre motiliteten i mage-tarmkanalen (diabetes mellitus, tidligere slag, nevrologiske sykdommer)
- Bruk av legemidler som kan forstyrre motiliteten i mage-tarmkanalen eller spytt (kalsiumkanalblokkere, nitrater, antikolinergika, østrogener)
- Voluminøs hiatal brokk (større enn eller lik 5 cm)
- Los Angeles grad C eller D erosiv øsofagitt
- Langdistansereiser de siste 3 månedene (utenfor den sørøstlige regionen av landet)
- Gravide eller ammende pasienter
- Tidligere kirurgi i øvre fordøyelseskanal
- Overvekt (kroppsmasseindeks lik eller større enn 30 kg/m2)
- Pasient med konsumptivt syndrom eller underernæring
- Tobakksbruk de siste 30 dagene / Alkoholbruk (mer enn 20 g per dag, de siste 30 dagene)
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Annen
- Tidsperspektiver: Retrospektiv
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Bestem mikrobiomet
Tidsramme: 2017-2018
|
I denne studien undersøkte vi intestinale mikrobiomer, hos individer med gastroøsofageal reflukssykdom og friske individer, ved bruk av metagenomiske teknikker.
For å analysere og sammenligne ulike prøver brukte vi to typer diversitetsindekser: alfa (α) og beta (β).
Den relative mengden av prøvene ble beregnet ved å bruke den ikke-parametriske Mann-Whitney-testen.
Boxplot-grafer og tabeller ble generert for å sammenligne grupper.
Alle tester som ble utført tok hensyn til en toveis α på 0,05 og et konfidensintervall (CI) på 95 %.
|
2017-2018
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 53677316.7.0000.0068
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .