Évaluer le microbiome intestinal chez les patients atteints de reflux gastro-œsophagien érosif et chez les témoins sains asymptomatiques
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
Contexte : La physiopathologie du reflux gastro-oesophagien (RGO) implique plusieurs mécanismes. La dysbiose intestinale peut influencer les facteurs impliqués dans la physiopathologie du reflux gastro-œsophagien, tels que les modifications des schémas moteurs gastro-intestinaux et l'augmentation de la pression intra-abdominale due à l'augmentation de la fermentation des glucides non digestibles. Cependant, peu d'études se sont concentrées sur l'évaluation du microbiome intestinal dans le RGO. Dans cette étude, nous avons étudié les microbiomes intestinaux, chez les personnes atteintes de reflux gastro-œsophagien et chez les personnes en bonne santé, à l'aide de techniques métagénomiques.
Méthodes : Nous avons réalisé une étude comprenant des échantillons fécaux de 22 adultes, âgés de 18 à 60 ans : 11 atteints d'œsophagite érosive (huit hommes et trois femmes) et 11 témoins sains (dix hommes et une femme). L'ADN du microbiome a été extrait d'échantillons de selles et une amplification par réaction en chaîne par polymérase a été réalisée à l'aide d'amorces pour la région V4 du gène de l'ARNr 16S (acide ribonucléique ribosomal 16S). Les amplicons ont été séquencés à l'aide de la plateforme Ion Torrent™ Personal Genome Machine™ et les données ont été analysées à l'aide du logiciel QIIME™ version 1.8 (Quantitative Insights Into Microbial Ecology).
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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São Paulo, Brésil, 04014-020
- Hospital das Clinicas da FMUSP
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- un diagnostic confirmé de RGO érosif par des critères cliniques et endoscopiques
- qui n'ont pas pris d'oméprazole ou de tout autre médicament modifiant le pH gastrique dans les trente jours précédant la réalisation des tests de diagnostic du RGO et des autres tests inclus dans le protocole.
Critère d'exclusion:
- Utilisation d'antimicrobiens ou de probiotiques au cours des trois derniers mois
- Présence de gastrite atrophique sévère et/ou étendue confirmée histologiquement
- Comorbidités pouvant interférer avec la motilité du tractus gastro-intestinal (diabète sucré, antécédent d'AVC, maladies neurologiques)
- Utilisation de médicaments pouvant interférer avec la motilité du tractus gastro-intestinal ou la salivation (inhibiteurs calciques, nitrates, anticholinergiques, œstrogènes)
- Hernie hiatale volumineuse (supérieure ou égale à 5 cm)
- Œsophagite érosive de grade C ou D de Los Angeles
- Voyages longue distance au cours des 3 derniers mois (en dehors de la région sud-est du pays)
- Patientes enceintes ou allaitantes
- Antécédents de chirurgie du tube digestif supérieur
- Obésité (indice de masse corporelle égal ou supérieur à 30 kg/m2)
- Patient avec un syndrome de consommation ou de malnutrition
- Tabagisme au cours des 30 derniers jours / Consommation d'alcool (plus de 20 g par jour, au cours des 30 derniers jours)
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Autre
- Perspectives temporelles: Rétrospective
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Déterminer le microbiome
Délai: 2017-2018
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Dans cette étude, nous avons étudié les microbiomes intestinaux, chez les personnes atteintes de reflux gastro-œsophagien et chez les personnes en bonne santé, à l'aide de techniques métagénomiques.
Pour analyser et comparer différents échantillons, nous avons utilisé deux types d'indices de diversité : alpha (α) et bêta (β).
L'abondance relative des échantillons a été calculée à l'aide du test non paramétrique de Mann-Whitney.
Des graphiques et des tableaux de boîtes à moustaches ont été générés pour comparer les groupes.
Tous les tests effectués ont pris en compte un α bidirectionnel de 0,05 et un intervalle de confiance (IC) de 95 %.
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2017-2018
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Maladies du système digestif
- Maladies gastro-intestinales
- Maladies de l'estomac
- Gastro-entérite
- Maladies intestinales
- Troubles de la motricité oesophagienne
- Troubles de la déglutition
- Maladies de l'oesophage
- Ulcère peptique
- Maladies duodénales
- Reflux gastro-oesophagien
- Oesophagite, peptique
- Oesophagite
Autres numéros d'identification d'étude
- 53677316.7.0000.0068
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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