Arvioi suoliston mikrobiomi potilailla, joilla on eroosiivinen gastroesofageaalinen refluksitauti ja oireettomat terveet kontrollit
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tausta: Gastroesofageaalisen refluksitaudin (GERD) patofysiologiaan liittyy useita mekanismeja. Suoliston dysbioosi voi vaikuttaa gastroesofageaalisen refluksitaudin patofysiologiaan liittyviin tekijöihin, kuten ruoansulatuskanavan motoristen rakenteiden muutoksiin ja lisääntyneeseen vatsansisäiseen paineeseen sulamattomien hiilihydraattien lisääntyneen fermentaation vuoksi. Harvat tutkimukset ovat kuitenkin keskittyneet suoliston mikrobiomin arviointiin GERD:ssä. Tässä tutkimuksessa tutkimme suoliston mikrobiomeja, gastroesofageaalista refluksitautia sairastavilla ja terveillä henkilöillä metagenomisia tekniikoita käyttäen.
Menetelmät: Suoritimme tutkimuksen, joka sisälsi ulostenäytteet 22 aikuisesta, iältään 18-60 vuotta: 11:stä erosiivista esofagiittia (kahdeksan miestä ja kolme naista) ja 11 tervettä kontrollia (10 miestä ja yksi nainen). Mikrobiomi-DNA uutettiin ulostenäytteistä ja polymeraasiketjureaktion monistus suoritettiin käyttämällä alukkeita 16S-rRNA-geenin V4-alueelle (16S-ribosomaalinen ribonukleiinihappo). Amplikonit sekvensoitiin käyttämällä Ion Torrent™ Personal Genome Machine™ -alustaa, ja tiedot analysoitiin käyttämällä QIIME™-ohjelmistoversiota 1.8 (Quantitative Insights Into Microbial Ecology).
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
São Paulo, Brasilia, 04014-020
- Hospital das Clínicas da FMUSP
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- erosiivisen GERD:n vahvistettu diagnoosi kliinisillä ja endoskooppisilla kriteereillä
- jotka eivät ole käyttäneet omepratsolia tai muuta mahalaukun pH:ta muuttavaa lääkettä 30 päivän aikana ennen GERD-diagnostisten testien ja muiden protokollaan sisältyvien testien suorittamista.
Poissulkemiskriteerit:
- Mikrobilääkkeiden tai probioottien käyttö viimeisen kolmen kuukauden aikana
- Vaikean ja/tai laajan atrofisen gastriitin esiintyminen vahvistettu histologisesti
- Samanaikaiset sairaudet, jotka voivat häiritä maha-suolikanavan motiliteettia (diabetes mellitus, aikaisempi aivohalvaus, neurologiset sairaudet)
- Sellaisten lääkkeiden käyttö, jotka voivat häiritä maha-suolikanavan motiliteettia tai syljeneritystä (kalsiumkanavasalpaajat, nitraatit, antikolinergit, estrogeenit)
- Tilava hiataltyrä (suurempi tai yhtä suuri kuin 5 cm)
- Los Angelesin C- tai D-luokan erosiivinen esofagiitti
- Pitkät matkat viimeisen 3 kuukauden aikana (maan kaakkoisalueen ulkopuolella)
- Raskaana olevat tai imettävät potilaat
- Aiempi ylemmän ruoansulatuskanavan leikkauksen historia
- Liikalihavuus (painoindeksi 30 kg/m2 tai suurempi)
- Potilas, jolla on kulutusoireyhtymä tai aliravitsemus
- Tupakan käyttö viimeisten 30 päivän aikana / Alkoholin käyttö (yli 20 g päivässä, viimeisen 30 päivän aikana)
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Muut
- Aikanäkymät: Takautuva
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Määritä mikrobiomi
Aikaikkuna: 2017-2018
|
Tässä tutkimuksessa tutkimme suoliston mikrobiomeja, gastroesofageaalista refluksitautia sairastavilla ja terveillä henkilöillä metagenomisia tekniikoita käyttäen.
Eri näytteiden analysoinnissa ja vertailussa käytimme kahdenlaisia diversiteettiindeksejä: alfa (α) ja beta (β).
Näytteiden suhteellinen runsaus laskettiin käyttämällä ei-parametrista Mann-Whitney-testiä.
Ryhmien vertailua varten luotiin Boxplot-kaavioita ja -taulukoita.
Kaikki suoritetut testit ottivat huomioon kaksisuuntaisen α:n 0,05 ja luottamusvälin (CI) 95 %.
|
2017-2018
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 53677316.7.0000.0068
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .