Oppdagelse av oppløselige biomarkører for kreft i bukspyttkjertelen ved å bruke innovativ metode som inkluderer alle pasienter (PanEXPEL2)

Kliniske og patologiske data vil bli prospektivt samlet for å oppnå 2 undergrupper: PDAC og ikke-PDAC i henhold til den endelige biopsidiagnosen. En kombinert kvantitativ analyse av proteinene og deres peptider i CytoLyt® vil bli utført. ROC-kurver, AUC, sensitivitet, spesifisitet, positiv prediktiv verdi og negativ prediktiv verdi knyttet til biomarkører vil bli beregnet for å isolere kombinasjoner av diagnostiske biomarkører. Kandidatbiomarkører vil bli validert ved immunhistokjemi og multippel reaksjonsovervåking. Prognostiske biomarkører vil bli evaluert ved å generere 1-års samlede overlevelseskurver og Cox-regresjon.

Den nåværende forskningen, basert på dagens praksis, bruker en ny og helhetlig tilnærming - PANEXPEL-metodikk - for å etablere et nytt repertoar av biomarkører for kreft i bukspyttkjertelen. Vi har til hensikt å gi en omfattende proteomisk og metabolomisk biomarkørsignatur som vil være målbar i pasientens blod ved bruk av vanlige kliniske metoder. Potensialet for oversettelse "fra benkside til seng" er spesielt høyt på grunn av involvering av kliniske team. Vi forventer å foreslå en kombinert, robust protein/metabolitt biomarkørsignatur som raskt kan testes i klinikkene.

Nødvendige biologiske ressurser: Biologiske ressurser vil inkludere Cytolyt® og blodprøver, ledsaget av et signert gratis og informert samtykke for hver inkluderte pasient.

1. CytoLyt®-væske vil først bli behandlet av patologiavdelingen ved CHU for rutinemessig PDAC-diagnose. I hovedsak blir prøvene filtrert, vevsfragmenter og celler oppbevares for analyse mens gjennomstrømming holdes til diagnosen er bekreftet. Når dette er fullført, vil prøvene bli overført til laboratoriet hvor proteinene som finnes i CytoLytR-væsken vil bli utfelt og deretter solubilisert. Proteinekstraktene lagres ved -80°C i påvente av proteomisk analyse. Den gjenværende CytoLytR-væskesupernatanten lagres også ved -80°C for å brukes til metabolomikk.
2. Blodprøve vil bli tatt fra hver pasient som gjennomgikk diagnostisk biopsi. Tørrrør for serumanalyse 5 ml vil bli samlet inn ved inklusjon under rutinemessig blodprøve (obligatorisk vurdering preoperativ eller pre-kjemoterapi). Blodprøven sentrifugeres ved 1500xg i 15 minutter mens de resulterende sera deles opp (500 μl/alikvot; 4-5 alikvoter per pasient) og lagres ved -80°C. Disse prøvene vil bli lagret på Biologic Resources Center (CRB Montpellier) som er merket NF-S-96900 (AFNOR). Serumprøvene er ment for valideringsfasen (WP4) og vil utelukkende være dedikert til denne studien.