Ontdekking van oplosbare biomarkers voor alvleesklierkanker met behulp van innovatieve all-patient inclusive methodologie (PanEXPEL2)

Klinische en pathologische gegevens zullen prospectief worden verzameld om 2 subgroepen te verkrijgen: PDAC en niet-PDAC volgens de definitieve biopsiediagnose. Er zal een gecombineerde kwantitatieve analyse van de eiwitten en hun peptiden in CytoLyt® worden uitgevoerd. ROC-curven, AUC, sensitiviteit, specificiteit, positief voorspellende waarde en negatief voorspellende waarde geassocieerd met biomarkers zullen berekend worden om combinaties van diagnostische biomarkers te isoleren. Kandidaat-biomarkers zullen worden gevalideerd door middel van immunohistochemie en monitoring van meerdere reacties. Prognostische biomarkers zullen worden geëvalueerd door algemene overlevingscurven van 1 jaar en Cox-regressie te genereren.

Het huidige onderzoek, gemodelleerd naar de huidige praktijk, maakt gebruik van een nieuwe en holistische benadering - PANEXPEL-methodologie - om een ​​nieuw repertoire van biomarkers voor alvleesklierkanker vast te stellen. We zijn van plan een uitgebreide proteomische en metabolomische biomarkerhandtekening te bieden die meetbaar zal zijn in het bloed van de patiënt met behulp van gangbare klinische methoden. Het vertaalpotentieel "van benchside naar bed" is vooral groot vanwege de betrokkenheid van klinische teams. We verwachten een gecombineerde, robuuste eiwit/metaboliet biomarkerhandtekening voor te stellen die snel in de klinieken kan worden getest.

Noodzakelijke biologische bronnen: Biologische bronnen omvatten Cytolyt® en bloedmonsters, vergezeld van een ondertekende gratis en geïnformeerde toestemming voor elke betrokken patiënt.

1. CytoLyt®-vloeistof wordt eerst verwerkt door de afdeling Pathologie van de CHU voor routinematige PDAC-diagnose. In wezen worden de monsters gefilterd, weefselfragmenten en cellen worden bewaard voor analyse, terwijl de doorstroming wordt bewaard totdat de diagnose is bevestigd. Zodra dit is voltooid, worden de monsters overgebracht naar het laboratorium waar de eiwitten in de CytoLytR-vloeistof worden neergeslagen en vervolgens worden opgelost. De eiwitextracten worden bewaard bij -80°C in afwachting van proteomische analyse. De resterende vloeistofsupernatant van CytoLytR wordt ook bewaard bij -80 °C om te worden gebruikt voor metabolomics.
2. Van elke patiënt die een diagnostische biopsie heeft ondergaan, wordt bloed afgenomen. Droge buis voor serumanalyse 5 ml zal worden verzameld op het moment van opname tijdens de routinematige bloedtest (verplichte beoordeling pre-operatief of pre-chemotherapie). Het bloedmonster wordt gedurende 15 minuten bij 1500xg gecentrifugeerd, terwijl de resulterende sera in porties worden verdeeld (500 μl/aliquot; 4-5 porties per patiënt) en bij -80°C worden bewaard. Deze monsters worden opgeslagen in het Biologic Resources Centre (CRB Montpellier) met het label NF-S-96900 (AFNOR). De serummonsters zijn bedoeld voor de validatiefase (WP4) en zullen uitsluitend aan deze studie worden gewijd.