Upptäckt av lösliga biomarkörer för bukspottkörtelcancer med hjälp av innovativ metodik för alla patienter (PanEXPEL2)

Kliniska och patologiska data kommer att samlas in prospektivt för att erhålla 2 undergrupper: PDAC och icke-PDAC enligt den slutliga biopsidiagnosen. En kombinerad kvantitativ analys av proteinerna och deras peptider som ingår i CytoLyt® kommer att utföras. ROC-kurvor, AUC, sensitivitet, specificitet, positivt prediktivt värde och negativt prediktivt värde associerade med biomarkörer kommer att beräknas för att isolera kombinationer av diagnostiska biomarkörer. Kandidatbiomarkörer kommer att valideras genom immunhistokemi och övervakning av flera reaktioner. Prognostiska biomarkörer kommer att utvärderas genom att generera 1-åriga totala överlevnadskurvor och Cox-regression.

Den nuvarande forskningen, som bygger på nuvarande praxis, använder en ny och holistisk metod - PANEXPEL-metodologi - för att etablera en ny repertoar av biomarkörer för pankreascancer. Vi har för avsikt att tillhandahålla en omfattande proteomisk och metabolomisk biomarkörsignatur som kommer att vara mätbar i patientens blod med vanliga kliniska metoder. Potentialen för översättning "från bänk till säng" är särskilt stor på grund av involveringen av kliniska team. Vi förväntar oss att föreslå en kombinerad, robust protein/metabolit biomarkörsignatur som snabbt kan testas på klinikerna.

Nödvändiga biologiska resurser: Biologiska resurser kommer att inkludera Cytolyt® och blodprover, åtföljda av ett undertecknat fritt och informerat samtycke för varje inkluderad patient.

1. CytoLyt®-vätska kommer först att behandlas av patologiavdelningen vid CHU för rutinmässig PDAC-diagnos. I huvudsak filtreras proverna, vävnadsfragment och celler hålls för analys medan genomflödet hålls tills diagnosen bekräftas. När detta är klart kommer proverna att överföras till labbet där proteinerna som finns i CytoLytR-vätskan kommer att fällas ut och sedan solubiliseras. Proteinextrakten lagras vid -80°C i avvaktan på proteomisk analys. Den återstående CytoLytR-vätskesupernatanten förvaras också vid -80°C för att användas för metabolomik.
2. Blodprov kommer att samlas in från varje patient som genomgick diagnostisk biopsi. Torrt rör för serumanalys 5 ml kommer att samlas in vid tidpunkten för inkludering under det rutinmässiga blodprovet (obligatorisk bedömning preoperativ eller pre-kemoterapi). Blodprovet centrifugeras vid 1500xg i 15 minuter medan de resulterande serumen alikvoteras (500μl/alikvot; 4-5 alikvoter per patient) och förvaras vid -80°C. Dessa prover kommer att lagras på Biologic Resources Center (CRB Montpellier) som är märkt NF-S-96900 (AFNOR). Serumproverna är avsedda för valideringsfasen (WP4) och kommer uteslutande att ägnas åt denna studie.