Opdagelse af opløselige biomarkører for kræft i bugspytkirtlen ved hjælp af innovativ metode, der omfatter alle patienter (PanEXPEL2)

Kliniske og patologiske data vil blive indsamlet prospektivt for at opnå 2 undergrupper: PDAC og ikke-PDAC i henhold til den endelige biopsidiagnose. En kombineret kvantitativ analyse af proteinerne og deres peptider indeholdt i CytoLyt® vil blive udført. ROC-kurver, AUC, sensitivitet, specificitet, positiv prædiktiv værdi og negativ prædiktiv værdi forbundet med biomarkører vil blive beregnet for at isolere kombinationer af diagnostiske biomarkører. Kandidatbiomarkører vil blive valideret ved immunhistokemi og overvågning af flere reaktioner. Prognostiske biomarkører vil blive evalueret ved at generere 1-årige samlede overlevelseskurver og Cox-regression.

Den nuværende forskning, baseret på nuværende praksis, anvender en ny og holistisk tilgang - PANEXPEL-metoden - til at etablere et nyt repertoire af biomarkører for bugspytkirtelkræft. Vi har til hensigt at levere en omfattende proteomisk og metabolomisk biomarkørsignatur, der vil være målbar i patientens blod ved hjælp af almindelige kliniske metoder. Potentialet for oversættelse "fra benchside til sengekant" er særligt højt på grund af involvering af kliniske teams. Vi forventer at foreslå en kombineret, robust protein/metabolit biomarkør signatur, som hurtigt kan testes i klinikkerne.

Nødvendige biologiske ressourcer: Biologiske ressourcer vil omfatte Cytolyt® og blodprøver, ledsaget af et underskrevet gratis og informeret samtykke for hver inkluderet patient.

1. CytoLyt® væske vil først blive behandlet af patologiafdelingen i CHU til rutinemæssig PDAC-diagnose. I det væsentlige filtreres prøverne, vævsfragmenter og celler opbevares til analyse, mens flow-through holdes, indtil diagnosen er bekræftet. Når dette er afsluttet, vil prøverne blive overført til laboratoriet, hvor proteinerne fundet i CytoLytR-væsken vil blive udfældet og derefter solubiliseret. Proteinekstrakterne opbevares ved -80°C i afventning af proteomisk analyse. Den resterende CytoLytR-væskesupernatant opbevares også ved -80°C for at blive brugt til metabolomik.
2. Blodprøver vil blive indsamlet fra hver patient, der har gennemgået en diagnostisk biopsi. Tørt rør til serumanalyse 5 ml vil blive indsamlet på tidspunktet for inklusion under den rutinemæssige blodprøve (obligatorisk vurdering præoperativ eller præ-kemoterapi). Blodprøven centrifugeres ved 1500xg i 15 minutter, mens de resulterende sera uddeles i alikvoter (500 μl/alikvot; 4-5 alikvoter pr. patient) og opbevares ved -80°C. Disse prøver vil blive opbevaret på Biologic Resources Center (CRB Montpellier), der er mærket NF-S-96900 (AFNOR). Serumprøverne er beregnet til valideringsfasen (WP4) og vil udelukkende være dedikeret til denne undersøgelse.