Entdeckung löslicher Biomarker für Bauchspeicheldrüsenkrebs mit innovativer, alle Patienten einbeziehender Methodik (PanEXPEL2)

Klinische und pathologische Daten werden prospektiv gesammelt, um 2 Untergruppen zu erhalten: PDAC und Nicht-PDAC gemäß der endgültigen Biopsiediagnose. Es wird eine kombinierte quantitative Analyse der in CytoLyt® enthaltenen Proteine ​​und ihrer Peptide durchgeführt. ROC-Kurven, AUC, Sensitivität, Spezifität, positiver Vorhersagewert und negativer Vorhersagewert in Verbindung mit Biomarkern werden berechnet, um Kombinationen von diagnostischen Biomarkern zu isolieren. Kandidaten-Biomarker werden durch Immunhistochemie und Überwachung mehrerer Reaktionen validiert. Prognostische Biomarker werden durch die Erstellung von 1-Jahres-Gesamtüberlebenskurven und Cox-Regression evaluiert.

Die vorliegende Forschung, die der aktuellen Praxis nachempfunden ist, wendet einen neuartigen und ganzheitlichen Ansatz – die PANEXPEL-Methodik – an, um ein neues Repertoire an Biomarkern für Bauchspeicheldrüsenkrebs zu etablieren. Wir beabsichtigen, eine umfassende Biomarker-Signatur für Proteomik und Metabolomik bereitzustellen, die mit gängigen klinischen Methoden im Blut des Patienten messbar sein wird. Das Translationspotential „from benchside to bedside“ ist durch die Einbindung klinischer Teams besonders hoch. Wir erwarten, eine kombinierte, robuste Protein-/Metaboliten-Biomarker-Signatur vorzuschlagen, die schnell in Kliniken getestet werden kann.

Notwendige biologische Ressourcen: Zu den biologischen Ressourcen gehören Cytolyt® und Blutproben, begleitet von einer unterschriebenen freien und informierten Einwilligung für jeden eingeschlossenen Patienten.

1. CytoLyt®-Flüssigkeit wird zunächst von der Pathologieabteilung der CHU für die routinemäßige PDAC-Diagnose verarbeitet. Im Wesentlichen werden die Proben gefiltert, Gewebefragmente und Zellen werden zur Analyse aufbewahrt, während der Durchfluss aufrechterhalten wird, bis die Diagnose bestätigt ist. Sobald dies abgeschlossen ist, werden die Proben ins Labor gebracht, wo die in der CytoLytR-Flüssigkeit gefundenen Proteine ​​ausgefällt und dann solubilisiert werden. Die Proteinextrakte werden bis zur proteomischen Analyse bei –80°C gelagert. Der verbleibende CytoLytR-Flüssigkeitsüberstand wird ebenfalls bei –80 °C gelagert, um für die Metabolomik verwendet zu werden.
2. Von jedem Patienten, der sich einer diagnostischen Biopsie unterzogen hat, wird eine Blutprobe entnommen. Trockenröhrchen für die Serumanalyse 5 ml werden zum Zeitpunkt der Aufnahme während der routinemäßigen Blutuntersuchung entnommen (obligatorische Bewertung vor der Operation oder vor der Chemotherapie). Die Blutprobe wird 15 Minuten lang bei 1500 × g zentrifugiert, während die resultierenden Seren aliquotiert werden (500 &mgr;l/Aliquot; 4–5 Aliquots pro Patient) und bei –80°C gelagert werden. Diese Proben werden im Zentrum für biologische Ressourcen (CRB Montpellier) mit der Bezeichnung NF-S-96900 (AFNOR) gelagert. Die Serumproben sind für die Validierungsphase (WP4) bestimmt und werden ausschließlich dieser Studie gewidmet.