Открытие растворимых биомаркеров рака поджелудочной железы с использованием инновационной методологии, охватывающей всех пациентов (PanEXPEL2)

Клинические и патологические данные будут собираться проспективно для получения 2 подгрупп: PDAC и не-PDAC в соответствии с окончательным диагнозом биопсии. Будет проведен комбинированный количественный анализ белков и их пептидов, содержащихся в CytoLyt®. Кривые ROC, AUC, чувствительность, специфичность, положительная прогностическая ценность и отрицательная прогностическая ценность, связанные с биомаркерами, будут рассчитаны для выделения комбинаций диагностических биомаркеров. Биомаркеры-кандидаты будут проверены с помощью иммуногистохимии и мониторинга множественных реакций. Прогностические биомаркеры будут оцениваться путем создания 1-летних кривых общей выживаемости и регрессии Кокса.

Настоящее исследование, основанное на современной практике, использует новый целостный подход — методологию PANEXPEL — для создания нового репертуара биомаркеров рака поджелудочной железы. Мы намерены предоставить комплексную характеристику протеомных и метаболомных биомаркеров, которую можно будет измерить в крови пациента с использованием обычных клинических методов. Потенциал перевода «от стационарного к прикроватному» особенно высок благодаря привлечению клинических бригад. Мы рассчитываем предложить комбинированную надежную сигнатуру биомаркеров белков/метаболитов, которую можно будет быстро протестировать в клиниках.

Необходимые биологические ресурсы: Биологические ресурсы будут включать Cytolyt® и Образцы крови, сопровождаемые подписанным Свободным и информированным согласием для каждого включенного пациента.

1. Жидкость CytoLyt® сначала будет обрабатываться в отделении патологии CHU для рутинной диагностики PDAC. По сути, образцы фильтруются, фрагменты тканей и клетки оставляются для анализа, а проток сохраняется до подтверждения диагноза. Как только это будет завершено, образцы будут переданы в лабораторию, где белки, обнаруженные в жидкости CytoLytR, будут осаждены, а затем солюбилизированы. Белковые экстракты хранят при температуре -80°C до проведения протеомного анализа. Оставшийся супернатант жидкости CytoLytR также хранят при температуре -80°C для использования в метаболомике.
2. Образец крови будет взят у каждого пациента, прошедшего диагностическую биопсию. Сухая пробирка для анализа сыворотки 5 мл будет собрана во время включения во время обычного анализа крови (обязательная оценка перед операцией или перед химиотерапией). Образец крови центрифугируют при 1500×g в течение 15 минут, в то время как полученную сыворотку делят на аликвоты (500 мкл/аликвота; 4-5 аликвот на пациента) и хранят при -80°C. Эти образцы будут храниться в Центре биологических ресурсов (CRB Montpellier) с маркировкой NF-S-96900 (AFNOR). Образцы сыворотки предназначены для фазы валидации (WP4) и будут предназначены исключительно для этого исследования.