Scoperta di biomarcatori solubili per il cancro al pancreas utilizzando una metodologia innovativa inclusiva di tutti i pazienti (PanEXPEL2)

I dati clinici e patologici saranno raccolti in modo prospettico per ottenere 2 sottogruppi: PDAC e non-PDAC secondo la diagnosi bioptica finale. Verrà eseguita un'analisi quantitativa combinata delle proteine ​​e dei loro peptidi contenuti in CytoLyt®. Curve ROC, AUC, sensibilità, specificità, valore predittivo positivo e valore predittivo negativo associati ai biomarcatori saranno calcolati per isolare combinazioni di biomarcatori diagnostici. I biomarcatori candidati saranno convalidati mediante immunoistochimica e monitoraggio di reazioni multiple. I biomarcatori prognostici saranno valutati generando curve di sopravvivenza globale a 1 anno e regressione di Cox.

La presente ricerca, modellata sulla pratica corrente, impiega un approccio nuovo e olistico - la metodologia PANEXPEL - per stabilire un nuovo repertorio di biomarcatori per il cancro del pancreas. Intendiamo fornire una firma completa del biomarcatore proteomico e metabolomico che sarà misurabile nel sangue del paziente utilizzando metodi clinici comuni. Il potenziale per la traduzione "dal banco al letto" è particolarmente elevato grazie al coinvolgimento dei team clinici. Prevediamo di proporre una firma di biomarcatore proteina/metabolita combinata e robusta che possa essere rapidamente testata nelle cliniche.

Risorse biologiche necessarie: le risorse biologiche includeranno Cytolyt® e campioni di sangue, accompagnati da un consenso libero e informato firmato per ciascun paziente incluso.

1. Il fluido CytoLyt® verrà prima elaborato dal Dipartimento di Patologia del CHU per la diagnosi di routine del PDAC. In sostanza, i campioni vengono filtrati, i frammenti di tessuto e le cellule vengono conservati per l'analisi mentre il flusso continuo viene mantenuto fino alla conferma della diagnosi. Una volta completato, i campioni saranno trasferiti al laboratorio dove le proteine ​​trovate nel fluido CytoLytR saranno precipitate e quindi solubilizzate. Gli estratti proteici vengono conservati a -80°C in attesa dell'analisi proteomica. Anche il restante supernatante del fluido CytoLytR viene conservato a -80°C per essere utilizzato per la metabolomica.
2. Verrà prelevato un campione di sangue da ciascun paziente sottoposto a biopsia diagnostica. Tubo secco per l'analisi del siero 5 ml verrà raccolto al momento dell'inclusione durante l'esame del sangue di routine (valutazione preoperatoria obbligatoria o pre-chemioterapia). Il campione di sangue viene centrifugato a 1500xg per 15 minuti mentre i sieri risultanti vengono aliquotati (500μl/aliquota; 4-5 aliquote per paziente) e conservati a -80°C. Questi campioni saranno conservati presso il Centro risorse biologiche (CRB Montpellier) etichettato NF-S-96900 (AFNOR). I campioni di siero sono destinati alla fase di validazione (WP4) e saranno dedicati esclusivamente a questo studio.