Odkrycie rozpuszczalnych biomarkerów raka trzustki przy użyciu innowacyjnej metodologii obejmującej wszystkich pacjentów (PanEXPEL2)

Dane kliniczne i patologiczne zostaną zebrane prospektywnie w celu uzyskania 2 podgrup: PDAC i bez PDAC, zgodnie z ostateczną diagnozą biopsyjną. Przeprowadzona zostanie połączona analiza ilościowa białek i ich peptydów zawartych w CytoLyt®. Krzywe ROC, AUC, czułość, specyficzność, dodatnia wartość predykcyjna i ujemna wartość predykcyjna związane z biomarkerami zostaną obliczone w celu wyizolowania kombinacji diagnostycznych biomarkerów. Potencjalne biomarkery zostaną zweryfikowane za pomocą immunohistochemii i monitorowania wielu reakcji. Biomarkery prognostyczne zostaną ocenione poprzez wygenerowanie krzywych całkowitego przeżycia 1 roku i regresji Coxa.

Prezentowane badania, wzorowane na dotychczasowej praktyce, wykorzystują nowatorskie i holistyczne podejście - metodologię PANEXPEL - do ustalenia nowego repertuaru biomarkerów raka trzustki. Zamierzamy zapewnić kompleksową sygnaturę biomarkerów proteomicznych i metabolomicznych, które będą mierzalne we krwi pacjenta przy użyciu powszechnych metod klinicznych. Potencjał tłumaczenia „od stołu do łóżka” jest szczególnie wysoki ze względu na zaangażowanie zespołów klinicznych. Oczekujemy, że zaproponujemy połączoną, solidną sygnaturę biomarkera białkowego/metabolitu, którą można szybko przetestować w klinikach.

Niezbędne zasoby biologiczne: Zasoby biologiczne obejmują Cytolyt® i próbki krwi, którym towarzyszy podpisana dobrowolna i świadoma zgoda dla każdego objętego badaniem pacjenta.

1. Płyn CytoLyt® zostanie najpierw przetworzony przez Dział Patologii CHU w celu rutynowej diagnostyki PDAC. Zasadniczo próbki są filtrowane, fragmenty tkanek i komórki są przechowywane do analizy, podczas gdy przepływ jest utrzymywany do czasu potwierdzenia diagnozy. Po zakończeniu próbki zostaną przeniesione do laboratorium, gdzie białka znajdujące się w płynie CytoLytR zostaną wytrącone, a następnie rozpuszczone. Ekstrakty białkowe przechowuje się w -80°C do czasu analizy proteomicznej. Pozostały płynny supernatant CytoLytR jest również przechowywany w temperaturze -80°C do wykorzystania w badaniach metabolomicznych.
2. Od każdego pacjenta, u którego wykonano biopsję diagnostyczną, zostanie pobrana próbka krwi. Sucha probówka do analizy surowicy 5 ml zostanie pobrana w momencie włączenia podczas rutynowego badania krwi (obowiązkowa ocena przedoperacyjna lub przed chemioterapią). Próbkę krwi odwirowuje się przy 1500xg przez 15 minut, podczas gdy otrzymane surowice dzieli się na porcje (500 μl/podwielokrotność; 4-5 porcji na pacjenta) i przechowuje w temperaturze -80°C. Próbki te będą przechowywane w Centrum Zasobów Biologicznych (CRB Montpellier) oznaczonym jako NF-S-96900 (AFNOR). Próbki surowicy są przeznaczone do fazy walidacji (WP4) i będą przeznaczone wyłącznie do tego badania.