Descubrimiento de biomarcadores solubles para el cáncer de páncreas utilizando una metodología innovadora que incluye a todos los pacientes (PanEXPEL2)

Los datos clínicos y patológicos se recogerán prospectivamente para obtener 2 subgrupos: PDAC y no PDAC según el diagnóstico final de la biopsia. Se realizará un análisis cuantitativo combinado de las proteínas y sus péptidos contenidos en CytoLyt®. Se calcularán curvas ROC, AUC, sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo y valor predictivo negativo asociados a biomarcadores para aislar combinaciones de biomarcadores de diagnóstico. Los biomarcadores candidatos se validarán mediante inmunohistoquímica y monitorización de reacciones múltiples. Los biomarcadores pronósticos se evaluarán mediante la generación de curvas de supervivencia global de 1 año y regresión de Cox.

La presente investigación, basada en la práctica actual, emplea un enfoque novedoso y holístico, la metodología PANEXPEL, para establecer un nuevo repertorio de biomarcadores para el cáncer de páncreas. Tenemos la intención de proporcionar una firma completa de biomarcadores proteómicos y metabolómicos que se pueda medir en la sangre del paciente utilizando métodos clínicos comunes. El potencial de traducción "del lado del banco al lado de la cama" es especialmente alto debido a la participación de los equipos clínicos. Esperamos proponer una firma de biomarcador de proteína/metabolito robusta y combinada que pueda probarse rápidamente en las clínicas.

Recursos biológicos necesarios: Los recursos biológicos incluirán Cytolyt® y Muestras de Sangre, acompañados de un Consentimiento Libre e Informado firmado por cada paciente incluido.

1. El fluido CytoLyt® será procesado primero por el Departamento de Patología de la CHU para el diagnóstico rutinario de PDAC. En esencia, las muestras se filtran, los fragmentos de tejido y las células se guardan para su análisis, mientras que el flujo continuo se mantiene hasta que se confirma el diagnóstico. Una vez que esto se complete, las muestras se transferirán al laboratorio donde las proteínas que se encuentran en el líquido CytoLytR se precipitarán y luego se solubilizarán. Los extractos de proteína se almacenan a -80°C en espera del análisis proteómico. El sobrenadante de líquido CytoLytR restante también se almacena a -80 °C para su uso en metabolómica.
2. Se recolectará una muestra de sangre de cada paciente que se sometió a una biopsia diagnóstica. Tubo seco para análisis de suero Se recogerán 5 ml en el momento de la inclusión durante el análisis de sangre de rutina (evaluación obligatoria preoperatoria o prequimioterapia). La muestra de sangre se centrifuga a 1500xg durante 15 minutos mientras que los sueros resultantes se dividen en alícuotas (500 μl/alícuota; 4-5 alícuotas por paciente) y se almacenan a -80 °C. Estas muestras se almacenarán en el Centro de Recursos Biológicos (CRB Montpellier) que tiene la etiqueta NF-S-96900 (AFNOR). Las muestras de suero están destinadas a la fase de validación (WP4) y se dedicarán exclusivamente a este estudio.