Descoberta de biomarcadores solúveis para câncer de pâncreas usando metodologia inovadora e inclusiva para todos os pacientes (PanEXPEL2)

Dados clínicos e patológicos serão coletados prospectivamente para obtenção de 2 subgrupos: PDAC e não-PDAC de acordo com o diagnóstico final da biópsia. Será realizada uma análise quantitativa combinada das proteínas e seus peptídeos contidos no CytoLyt®. Curvas ROC, AUC, sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo associados aos biomarcadores serão calculados para isolar combinações de biomarcadores diagnósticos. Os biomarcadores candidatos serão validados por imuno-histoquímica e monitoramento de reações múltiplas. Os biomarcadores prognósticos serão avaliados por meio da geração de curvas de sobrevida global de 1 ano e regressão de Cox.

A presente pesquisa, modelada na prática atual, emprega uma abordagem nova e holística - metodologia PANEXPEL - para estabelecer um novo repertório de biomarcadores para câncer pancreático. Pretendemos fornecer uma assinatura abrangente de biomarcadores proteômicos e metabolômicos que serão mensuráveis ​​no sangue do paciente usando métodos clínicos comuns. O potencial de tradução "da bancada para a beira do leito" é especialmente alto devido ao envolvimento das equipes clínicas. Esperamos propor uma assinatura de biomarcador de proteína/metabólito robusta e combinada que possa ser testada rapidamente nas clínicas.

Recursos biológicos necessários: Os recursos biológicos incluirão Cytolyt® e Amostras de Sangue, acompanhados de Termo de Consentimento Livre e Esclarecido assinado para cada paciente incluído.

1. O fluido CytoLyt® será primeiro processado pelo Departamento de Patologia do CHU para o diagnóstico de rotina do PDAC. Em essência, as amostras são filtradas, fragmentos de tecidos e células são mantidos para análise enquanto o fluxo é mantido até que o diagnóstico seja confirmado. Assim que isso for concluído, as amostras serão transferidas para o laboratório onde as proteínas encontradas no fluido CytoLytR serão precipitadas e solubilizadas. Os extratos de proteína são armazenados a -80°C enquanto se aguarda a análise proteômica. O sobrenadante do fluido CytoLytR restante também é armazenado a -80°C para ser usado para metabolômica.
2. Será coletada amostra de sangue de cada paciente submetido à biópsia diagnóstica. Tubo seco para análise de soro 5 ml será coletado no momento da inclusão durante o exame de sangue de rotina (avaliação obrigatória pré-operatória ou pré-quimioterapia). A amostra de sangue é centrifugada a 1500xg por 15 minutos enquanto os soros resultantes são aliquotados (500μl/alíquota; 4-5 alíquotas por paciente) e armazenados a -80°C. Essas amostras serão armazenadas no Centro de Recursos Biológicos (CRB Montpellier) rotulado como NF-S-96900 (AFNOR). As amostras de soro destinam-se à fase de validação (WP4) e serão exclusivamente dedicadas a este estudo.