Ikke-invasiv preimplantasjonsgenetisk testing for aneuploider ved bruk av cellefritt DNA i brukte kulturmedier (niPGT-A)
Ikke-invasiv preimplantasjonsgenetisk testing for aneuploidier (niPGT-A) - Evaluering av analysen av cellefritt DNA i brukt kulturmedium
Analyse av embryonalt cellefritt DNA (cfDNA) tilstede i det brukte kulturmediet (SCM) er et ikke-invasivt alternativ for preimplantasjons genetisk testing for aneuploidies (PGT-A) som unngår de tekniske utfordringene og begrensningene ved biopsi. Innledende studier som undersøkte denne ikke-invasive PGT-A (niPGT-A) metoden rapporterte variabel samsvar mellom cfDNA i SCM og trophectoderm prøven (~ 30% -86%) og indikerte et bidrag fra både den indre cellemassen og trophectoderm til cfDNA i SCM.
Denne studien tar sikte på å evaluere bruken av embryokulturmediet som en kilde til genetisk materiale for PGT-A og validere en niPGT-A-protokoll ved bruk av cfDNA i SCM.
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Flere studier har vist evnen til å oppdage og amplifisere cfDNA fra SCM, på forskjellige stadier av embryonal utvikling, med varierende grad av amplifikasjonssuksess. Forskjeller i analytter, tidspunkt for innsamling av SCM og varigheten av embryokultur i det innsamlede mediet, ytelse av assistert klekking (AH), helgenomamplifikasjonsmetoder, omfattende kromosomscreeningsmetoder og neste generasjons sekvenseringsplattformer (NGS), bioinformatiske analyser og strategier for identifisering av mors forurensning bidrar alle til den ultimate ytelsen til niPGT-A.
Denne studien tar sikte på å validere en ikke-invasiv PGT-A (niPGT-A) metode som bruker cfDNA frigjort fra den menneskelige blastocysten inn i SCM.
Pasienter som gjennomgår en fertilitetsbehandling med PGT-A på grunn av sekundær infertilitet vil bli rekruttert. På dag 6 etter befruktning vil SCM samles inn før blastocystbiopsi. SCM kasseres normalt på dette stadiet. Trophectoderm-biopsi og prøveinnsamling vil følge IVF-laboratoriets standardpraksis for klinisk PGT-A.
Tre aneuploidi-screeningssett, basert på forskjellige helgenom-amplifikasjonsmetoder fulgt av NGS på Ion GeneStudio™ S5 Prime System (ThermoFisher Scientific), vil bli sammenlignet. Overensstemmelsen mellom cfDNA og trophectoderm-biopsier vil bli evaluert for omtrent 150 blastocyster med den beste niPGT-A-protokollen.
Valg av embryo(e) for overføring vil være basert utelukkende på PGT-A-resultatet fra de biopsierte cellene. Pasientens IVF+PGT-A behandlingsplan og tidslinje vil ikke bli endret.
Studietype
Kontakter og plasseringer
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Pasienter som gjennomgår fertilitetsbehandling med PGT-A (rekombinant FSH-antagonistprotokoll med dobbel trigger)
- Sekundær infertilitet
- BMI 18- 35 kg/m2
- Sperm: fersk ejakulert sæd (abstinens: 2-3 dager)
- Minst én blastocyst biopsiert på dag 6
Ekskluderingskriterier:
- Høyt progesteron på utløserdagen (>1,5 ng/ml)
- Forglassede oocytter
- Frosne sædceller
- Indikasjoner for PGT-SR og PGT-M
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiver: Potensielle
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
To typer prøver (TE og SCM) vil bli samlet inn for alle blastocyster som er inkludert i studien
|
PGT-A og niPGT-A vil bli utført ved hjelp av neste generasjons sekvenseringsanalyse (NGS) for kromosomkopinummervariasjon (CNV).
Embryooverføringer vil utelukkende stole på resultatene av PGT-A for trophectoderm biopsier.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Generell samsvar mellom resultater for cfDNA i SCM og trophectoderm biopsier
Tidsramme: 4 måneder
|
Generell ploidikonkordanshastighet: antall matchede (euploid-euploid eller aneuploid-aneuploid) resultat/totalt antall cfDNA-prøver med et resultat
|
4 måneder
|
|
Uoverensstemmelse per kromosom mellom resultater for cfDNA i SCM og trophectoderm biopsier
Tidsramme: 4 måneder
|
Uoverensstemmelse per kromosom: antall feilidentifiserte kromosomfeil/24*totalt antall embryoer med cfDNA-resultat
|
4 måneder
|
|
Overensstemmelse per kromosom mellom resultater for cfDNA i SCM og trophectoderm
Tidsramme: 4 måneder
|
Kromosomfeilkonkordans: antall korrekt identifiserte kromosomfeil/totalt antall kromosomfeil oppdaget
|
4 måneder
|
|
Sensitivitet av niPGT-A ved bruk av cfDNA i SCM
Tidsramme: 4 måneder
|
Falsk negativ rate: 1- (ekte euploid resultat/totalt antall prøver med et resultat)
|
4 måneder
|
|
Spesifisitet av niPGT-A ved bruk av cfDNA i SCM
Tidsramme: 4 måneder
|
Falsk positiv rate: 1- (ekte aneuploid resultat/totalt antall prøver med resultat)
|
4 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Graviditetsutfall for pasienter som har en embryooverføring - Implantasjonshastighet
Tidsramme: 12 måneder
|
Implantasjonshastighet = antall svangerskapsposer observert ved ekkografisk screening ved 6 uker av svangerskapet / antall overførte embryoer
|
12 måneder
|
|
Graviditetsutfall for pasienter som har en embryooverføring - Biokjemisk graviditetsrate
Tidsramme: 12 måneder
|
Biokjemisk graviditetsrate = positiv βhCG-test på > 15IU men ingen føtal hjerterytme / svangerskapssekk ved ultralydundersøkelse
|
12 måneder
|
|
Graviditetsutfall for pasienter som har en embryooverføring - Klinisk graviditetsrate
Tidsramme: 12 måneder
|
Klinisk graviditetsrate (%) definert ved positiv βhCG-test og ultralydbekreftelse av svangerskapssekk eller hjerteslag
|
12 måneder
|
|
Graviditetsutfall for pasienter som har en embryooverføring - Abortrate
Tidsramme: 12 måneder
|
Abortrate (%) definert ved ultrasonografisk visualisering av en eller flere svangerskapsposer, inkludert ektopiske graviditeter, med spontant tap av svangerskapet før 20 uker
|
12 måneder
|
|
Graviditetsutfall for pasienter som har en embryooverføring - Klinisk graviditetsrate
Tidsramme: 12 måneder
|
Pågående graviditetsrate (utover 20 uker)
|
12 måneder
|
|
Graviditetsutfall for pasienter som har en embryooverføring - Implantasjonssviktfrekvens
Tidsramme: 12 måneder
|
Implantasjonsfeil (%)
|
12 måneder
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Souraya Jaroudi, ART Fertility Clinics
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Shamonki MI, Jin H, Haimowitz Z, Liu L. Proof of concept: preimplantation genetic screening without embryo biopsy through analysis of cell-free DNA in spent embryo culture media. Fertil Steril. 2016 Nov;106(6):1312-1318. doi: 10.1016/j.fertnstert.2016.07.1112. Epub 2016 Aug 24.
- Feichtinger M, Vaccari E, Carli L, Wallner E, Madel U, Figl K, Palini S, Feichtinger W. Non-invasive preimplantation genetic screening using array comparative genomic hybridization on spent culture media: a proof-of-concept pilot study. Reprod Biomed Online. 2017 Jun;34(6):583-589. doi: 10.1016/j.rbmo.2017.03.015. Epub 2017 Mar 28.
- Rubio C, Navarro-Sanchez L, Garcia-Pascual CM, Ocali O, Cimadomo D, Venier W, Barroso G, Kopcow L, Bahceci M, Kulmann MIR, Lopez L, De la Fuente E, Navarro R, Valbuena D, Sakkas D, Rienzi L, Simon C. Multicenter prospective study of concordance between embryonic cell-free DNA and trophectoderm biopsies from 1301 human blastocysts. Am J Obstet Gynecol. 2020 Nov;223(5):751.e1-751.e13. doi: 10.1016/j.ajog.2020.04.035. Epub 2020 May 26.
- Fang R, Yang W, Zhao X, Xiong F, Guo C, Xiao J, Chen L, Song X, Wang H, Chen J, Xiao X, Yao B, Cai LY. Chromosome screening using culture medium of embryos fertilised in vitro: a pilot clinical study. J Transl Med. 2019 Mar 8;17(1):73. doi: 10.1186/s12967-019-1827-1.
- Huang L, Bogale B, Tang Y, Lu S, Xie XS, Racowsky C. Noninvasive preimplantation genetic testing for aneuploidy in spent medium may be more reliable than trophectoderm biopsy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 9;116(28):14105-14112. doi: 10.1073/pnas.1907472116. Epub 2019 Jun 24.
- Capalbo A, Romanelli V, Patassini C, Poli M, Girardi L, Giancani A, Stoppa M, Cimadomo D, Ubaldi FM, Rienzi L. Diagnostic efficacy of blastocoel fluid and spent media as sources of DNA for preimplantation genetic testing in standard clinical conditions. Fertil Steril. 2018 Oct;110(5):870-879.e5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.05.031. Erratum In: Fertil Steril. 2019 Jan;111(1):194.
- Ho JR, Arrach N, Rhodes-Long K, Ahmady A, Ingles S, Chung K, Bendikson KA, Paulson RJ, McGinnis LK. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos. Fertil Steril. 2018 Aug;110(3):467-475.e2. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.03.036. Epub 2018 Jun 28.
- Kuznyetsov V, Madjunkova S, Antes R, Abramov R, Motamedi G, Ibarrientos Z, Librach C. Evaluation of a novel non-invasive preimplantation genetic screening approach. PLoS One. 2018 May 10;13(5):e0197262. doi: 10.1371/journal.pone.0197262. eCollection 2018.
- Vera-Rodriguez M, Diez-Juan A, Jimenez-Almazan J, Martinez S, Navarro R, Peinado V, Mercader A, Meseguer M, Blesa D, Moreno I, Valbuena D, Rubio C, Simon C. Origin and composition of cell-free DNA in spent medium from human embryo culture during preimplantation development. Hum Reprod. 2018 Apr 1;33(4):745-756. doi: 10.1093/humrep/dey028.
- Xu J, Fang R, Chen L, Chen D, Xiao JP, Yang W, Wang H, Song X, Ma T, Bo S, Shi C, Ren J, Huang L, Cai LY, Yao B, Xie XS, Lu S. Noninvasive chromosome screening of human embryos by genome sequencing of embryo culture medium for in vitro fertilization. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11907-11912. doi: 10.1073/pnas.1613294113. Epub 2016 Sep 29.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 2010-ABU-011-SJ
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
produkt produsert i og eksportert fra USA
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .