Неинвазивное преимплантационное генетическое тестирование на анеуплоидии с использованием бесклеточной ДНК в отработанных культуральных средах (niPGT-A)
Неинвазивное преимплантационное генетическое тестирование на анеуплоидии (niPGT-A) — оценка анализа бесклеточной ДНК в отработанной культуральной среде
Анализ эмбриональной бесклеточной ДНК (вкДНК), присутствующей в отработанных культуральных средах (СКМ), представляет собой неинвазивную альтернативу преимплантационному генетическому тестированию на анеуплоидии (ПГТ-А), которая позволяет избежать технических проблем и ограничений биопсии. Первоначальные исследования, изучающие этот неинвазивный метод PGT-A (niPGT-A), сообщили о различной согласованности между вкДНК в SCM и образце трофэктодермы (~ 30–86%) и указали на вклад как внутренней клеточной массы, так и трофэктодермы во вкДНК. в СКМ.
Это исследование направлено на оценку использования среды для культивирования эмбрионов в качестве источника генетического материала для PGT-A и проверку протокола niPGT-A с использованием вкДНК в SCM.
Обзор исследования
Статус
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Многочисленные исследования продемонстрировали способность обнаруживать и амплифицировать вкДНК из SCM на разных стадиях эмбрионального развития с разной степенью успеха амплификации. Различия в аналитах, сроках сбора SCM и продолжительности культивирования эмбрионов в собранной среде, эффективности вспомогательного хетчинга (AH), методах амплификации всего генома, комплексных методах скрининга хромосом и платформах секвенирования следующего поколения (NGS), биоинформатическом анализе и стратегиях для выявление материнского загрязнения способствует максимальной эффективности niPGT-A.
Это исследование направлено на проверку неинвазивного метода PGT-A (niPGT-A) с использованием вкДНК, высвобождаемой из бластоцисты человека в SCM.
Будут набраны пациенты, проходящие лечение бесплодия с помощью PGT-A из-за вторичного бесплодия. На 6-й день после оплодотворения SCM будет собран перед биопсией бластоцисты. На этом этапе SCM обычно отбрасывается. Биопсия трофэктодермы и сбор образцов будут проводиться в соответствии со стандартной практикой лаборатории ЭКО для клинического PGT-A.
Будет проведено сравнение трех наборов для скрининга анеуплоидии, основанных на различных методах амплификации всего генома с последующей NGS на системе Ion GeneStudio™ S5 Prime (ThermoFisher Scientific). Соответствие между биоптатами вкДНК и трофэктодермы будет оцениваться примерно для 150 бластоцист с наиболее эффективным протоколом niPGT-A.
Выбор эмбриона(ов) для переноса будет основываться исключительно на результатах PGT-A клеток, взятых при биопсии. План и сроки лечения ЭКО + ПГТ-А пациента не будут изменены.
Тип исследования
Контакты и местонахождение
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Пациенты, проходящие лечение бесплодия с помощью PGT-A (протокол рекомбинантного антагониста ФСГ с двойным триггером)
- Вторичное бесплодие
- ИМТ 18- 35 кг/м2
- Сперма: свежая эякулированная сперма (воздержание: 2-3 дня)
- По крайней мере, одна бластоциста биопсирована на 6-й день.
Критерий исключения:
- Высокий уровень прогестерона в день триггера (>1,5 нг/мл)
- Витрифицированные ооциты
- Замороженная сперма
- Показания к PGT-SR и PGT-M
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Когорта
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Два типа образцов (TE и SCM) будут собраны для всех бластоцист, включенных в исследование.
|
PGT-A и niPGT-A будут выполняться с использованием анализа секвенирования нового поколения (NGS) для вариации числа копий хромосом (CNV).
Перенос эмбрионов будет зависеть исключительно от результатов PGT-A для биопсии трофэктодермы.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Общее соответствие между результатами для вкДНК при СКМ и биопсии трофэктодермы
Временное ограничение: 4 месяца
|
Общая степень согласованности плоидности: количество совпавших (эуплоид-эуплоид или анеуплоид-анеуплоид) результатов/общее количество образцов вкДНК с результатом
|
4 месяца
|
|
Несоответствие на хромосому между результатами для вкДНК в SCM и биопсии трофэктодермы
Временное ограничение: 4 месяца
|
Дискордантность на хромосому: количество ошибочно идентифицированных хромосомных ошибок/24*общее количество эмбрионов с результатом вкДНК
|
4 месяца
|
|
Конкордантность на хромосому между результатами для вкДНК в SCM и трофэктодерме
Временное ограничение: 4 месяца
|
Конкордантность хромосомных ошибок: количество правильно идентифицированных хромосомных ошибок/общее количество обнаруженных хромосомных ошибок
|
4 месяца
|
|
Чувствительность niPGT-A с использованием вкДНК в SCM
Временное ограничение: 4 месяца
|
Ложноотрицательный показатель: 1- (истинный эуплоидный результат/общее количество образцов с результатом)
|
4 месяца
|
|
Специфичность niPGT-A с использованием вкДНК при СКМ
Временное ограничение: 4 месяца
|
Ложноположительный результат: 1- (истинный анеуплоидный результат/общее количество образцов с результатом)
|
4 месяца
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Исход беременности у пациенток с переносом эмбриона - Частота имплантации
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Частота имплантации = количество плодных яиц, обнаруженных при эхографическом скрининге на 6 неделе беременности / количество перенесенных эмбрионов
|
12 месяцев
|
|
Исход беременности у пациенток с переносом эмбриона - Частота биохимической беременности
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Частота биохимической беременности = положительный тест на βhCG> 15 МЕ, но отсутствие сердцебиения плода / плодного яйца при ультразвуковом исследовании
|
12 месяцев
|
|
Исход беременности у пациенток с переносом эмбриона - Частота клинической беременности
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Частота клинической беременности (%), определяемая положительным тестом на βhCG и ультразвуковым подтверждением плодного яйца или сердцебиения
|
12 месяцев
|
|
Исход беременности у пациенток с переносом эмбриона - Частота выкидышей
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Частота выкидышей (%), определяемая с помощью ультразвуковой визуализации одного или нескольких плодных мешков, включая внематочную беременность, со спонтанной потерей беременности до 20 недель
|
12 месяцев
|
|
Исход беременности у пациенток с переносом эмбриона - Частота клинической беременности
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Частота продолжающихся беременностей (после 20 недель)
|
12 месяцев
|
|
Исход беременности у пациенток с переносом эмбриона - Частота неудач имплантации
Временное ограничение: 12 месяцев
|
Отказ имплантации (%)
|
12 месяцев
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Souraya Jaroudi, ART Fertility Clinics
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Shamonki MI, Jin H, Haimowitz Z, Liu L. Proof of concept: preimplantation genetic screening without embryo biopsy through analysis of cell-free DNA in spent embryo culture media. Fertil Steril. 2016 Nov;106(6):1312-1318. doi: 10.1016/j.fertnstert.2016.07.1112. Epub 2016 Aug 24.
- Feichtinger M, Vaccari E, Carli L, Wallner E, Madel U, Figl K, Palini S, Feichtinger W. Non-invasive preimplantation genetic screening using array comparative genomic hybridization on spent culture media: a proof-of-concept pilot study. Reprod Biomed Online. 2017 Jun;34(6):583-589. doi: 10.1016/j.rbmo.2017.03.015. Epub 2017 Mar 28.
- Rubio C, Navarro-Sanchez L, Garcia-Pascual CM, Ocali O, Cimadomo D, Venier W, Barroso G, Kopcow L, Bahceci M, Kulmann MIR, Lopez L, De la Fuente E, Navarro R, Valbuena D, Sakkas D, Rienzi L, Simon C. Multicenter prospective study of concordance between embryonic cell-free DNA and trophectoderm biopsies from 1301 human blastocysts. Am J Obstet Gynecol. 2020 Nov;223(5):751.e1-751.e13. doi: 10.1016/j.ajog.2020.04.035. Epub 2020 May 26.
- Fang R, Yang W, Zhao X, Xiong F, Guo C, Xiao J, Chen L, Song X, Wang H, Chen J, Xiao X, Yao B, Cai LY. Chromosome screening using culture medium of embryos fertilised in vitro: a pilot clinical study. J Transl Med. 2019 Mar 8;17(1):73. doi: 10.1186/s12967-019-1827-1.
- Huang L, Bogale B, Tang Y, Lu S, Xie XS, Racowsky C. Noninvasive preimplantation genetic testing for aneuploidy in spent medium may be more reliable than trophectoderm biopsy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 9;116(28):14105-14112. doi: 10.1073/pnas.1907472116. Epub 2019 Jun 24.
- Capalbo A, Romanelli V, Patassini C, Poli M, Girardi L, Giancani A, Stoppa M, Cimadomo D, Ubaldi FM, Rienzi L. Diagnostic efficacy of blastocoel fluid and spent media as sources of DNA for preimplantation genetic testing in standard clinical conditions. Fertil Steril. 2018 Oct;110(5):870-879.e5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.05.031. Erratum In: Fertil Steril. 2019 Jan;111(1):194.
- Ho JR, Arrach N, Rhodes-Long K, Ahmady A, Ingles S, Chung K, Bendikson KA, Paulson RJ, McGinnis LK. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos. Fertil Steril. 2018 Aug;110(3):467-475.e2. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.03.036. Epub 2018 Jun 28.
- Kuznyetsov V, Madjunkova S, Antes R, Abramov R, Motamedi G, Ibarrientos Z, Librach C. Evaluation of a novel non-invasive preimplantation genetic screening approach. PLoS One. 2018 May 10;13(5):e0197262. doi: 10.1371/journal.pone.0197262. eCollection 2018.
- Vera-Rodriguez M, Diez-Juan A, Jimenez-Almazan J, Martinez S, Navarro R, Peinado V, Mercader A, Meseguer M, Blesa D, Moreno I, Valbuena D, Rubio C, Simon C. Origin and composition of cell-free DNA in spent medium from human embryo culture during preimplantation development. Hum Reprod. 2018 Apr 1;33(4):745-756. doi: 10.1093/humrep/dey028.
- Xu J, Fang R, Chen L, Chen D, Xiao JP, Yang W, Wang H, Song X, Ma T, Bo S, Shi C, Ren J, Huang L, Cai LY, Yao B, Xie XS, Lu S. Noninvasive chromosome screening of human embryos by genome sequencing of embryo culture medium for in vitro fertilization. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11907-11912. doi: 10.1073/pnas.1613294113. Epub 2016 Sep 29.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 2010-ABU-011-SJ
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .