- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT04711239
Test genetici preimpianto non invasivi per aneuploidie utilizzando DNA privo di cellule in terreni di coltura esauriti (niPGT-A)
Test genetico preimpianto non invasivo per le aneuploidie (niPGT-A) - Valutazione dell'analisi del DNA libero in terreno di coltura esaurito
L'analisi del DNA privo di cellule embrionali (cfDNA) presente nei terreni di coltura esauriti (SCM) è un'alternativa non invasiva per i test genetici preimpianto per le aneuploidie (PGT-A) che evita le sfide tecniche e le limitazioni della biopsia. Gli studi iniziali che hanno indagato su questo metodo PGT-A non invasivo (niPGT-A) hanno riportato una concordanza variabile tra il cfDNA in SCM e il campione di trofectoderma (~ 30% -86%) e hanno indicato un contributo sia della massa cellulare interna che del trofectoderma al cfDNA in Scm.
Questo studio mira a valutare l'uso del mezzo di coltura dell'embrione come fonte di materiale genetico per PGT-A e convalidare un protocollo niPGT-A utilizzando cfDNA in SCM.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Numerosi studi hanno dimostrato la capacità di rilevare e amplificare il cfDNA da SCM, in diverse fasi dello sviluppo embrionale, con tassi variabili di successo dell'amplificazione. Differenze negli analiti, tempistica della raccolta di SCM e durata della coltura dell'embrione all'interno del mezzo raccolto, prestazioni della schiusa assistita (AH), metodi di amplificazione dell'intero genoma, metodi completi di screening dei cromosomi e piattaforme di sequenziamento di nuova generazione (NGS), analisi e strategie bioinformatiche per l'identificazione della contaminazione materna contribuisce alle prestazioni finali di niPGT-A.
Questo studio mira a convalidare un metodo PGT-A (niPGT-A) non invasivo che utilizza il cfDNA rilasciato dalla blastocisti umana nell'SCM.
Saranno reclutati pazienti sottoposti a trattamento di fertilità con PGT-A a causa di infertilità secondaria. Il giorno 6 dopo la fecondazione, SCM sarà raccolto prima della biopsia della blastocisti. L'SCM viene normalmente scartato in questa fase. La biopsia del trophectoderm e la raccolta del campione seguiranno le pratiche standard del laboratorio di fecondazione in vitro per la PGT-A clinica.
Verranno confrontati tre kit di screening dell'aneuploidia, basati su diversi metodi di amplificazione dell'intero genoma seguiti da NGS su Ion GeneStudio™ S5 Prime System (ThermoFisher Scientific). La concordanza tra cfDNA e biopsie del trofectoderma sarà valutata per circa 150 blastocisti con il protocollo niPGT-A più performante.
La selezione degli embrioni per il trasferimento si baserà esclusivamente sul risultato PGT-A delle cellule sottoposte a biopsia. Il piano di trattamento IVF+PGT-A del paziente e la tempistica non verranno modificati.
Tipo di studio
Contatti e Sedi
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Pazienti sottoposte a trattamento di fertilità con PGT-A (protocollo antagonista dell'FSH ricombinante con doppio trigger)
- Infertilità secondaria
- IMC 18-35 kg/m2
- Sperma: sperma fresco eiaculato (astinenza: 2-3 giorni)
- Almeno una biopsia di blastocisti il giorno 6
Criteri di esclusione:
- Progesterone alto il giorno del trigger (>1,5 ng/ml)
- Ovociti vetrificati
- Sperma congelato
- Indicazioni per PGT-SR e PGT-M
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Prospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
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Verranno raccolti due tipi di campioni (TE e SCM) per tutte le blastocisti incluse nello studio
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PGT-A e niPGT-A saranno eseguiti utilizzando l'analisi di sequenziamento di nuova generazione (NGS) per la variazione del numero di copie del cromosoma (CNV).
I trasferimenti di embrioni si baseranno esclusivamente sui risultati del PGT-A per le biopsie del trofectoderma.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Concordanza generale tra i risultati per il cfDNA nelle biopsie di SCM e trofectoderma
Lasso di tempo: 4 mesi
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Tasso generale di concordanza della ploidia: numero di risultati corrispondenti (euploide-euploide o aneuploide-aneuploide)/numero totale di campioni di cfDNA con un risultato
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4 mesi
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Discordanza per cromosoma tra i risultati per cfDNA nelle biopsie SCM e trofectoderm
Lasso di tempo: 4 mesi
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Discordanza per cromosoma: numero di errori cromosomici erroneamente identificati/24*numero totale di embrioni con risultato cfDNA
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4 mesi
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Concordanza per cromosoma tra i risultati per cfDNA in SCM e trofectoderma
Lasso di tempo: 4 mesi
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Concordanza errori cromosomici: numero di errori cromosomici identificati correttamente/numero totale di errori cromosomici rilevati
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4 mesi
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Sensibilità di niPGT-A utilizzando cfDNA in SCM
Lasso di tempo: 4 mesi
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Tasso di falsi negativi: 1- (vero risultato euploide/numero totale di campioni con un risultato)
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4 mesi
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Specificità di niPGT-A utilizzando cfDNA in SCM
Lasso di tempo: 4 mesi
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Percentuale di falsi positivi: 1- (vero risultato aneuploide/numero totale di campioni con un risultato)
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4 mesi
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Esito della gravidanza per pazienti che hanno un trasferimento di embrioni - Tasso di impianto
Lasso di tempo: 12 mesi
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Tasso di impianto = numero di sacchi gestazionali osservati allo screening ecografico a 6 settimane di gravidanza / numero di embrioni trasferiti
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12 mesi
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Esito della gravidanza per pazienti che hanno un trasferimento di embrioni - Tasso di gravidanza biochimica
Lasso di tempo: 12 mesi
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Tasso di gravidanza biochimica = test βhCG positivo > 15 UI ma nessun battito cardiaco fetale / sacco gestazionale all'esame ecografico
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12 mesi
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Esito della gravidanza per pazienti che hanno un trasferimento di embrioni - Tasso di gravidanza clinica
Lasso di tempo: 12 mesi
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Tasso di gravidanza clinica (%) definito dal test βhCG positivo e dalla conferma ecografica del sacco gestazionale o del battito cardiaco
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12 mesi
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Esito della gravidanza per pazienti che hanno un trasferimento di embrioni - Tasso di aborto spontaneo
Lasso di tempo: 12 mesi
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Tasso di aborto spontaneo (%) definito dalla visualizzazione ecografica di uno o più sacchi gestazionali, comprese le gravidanze ectopiche, con aborto spontaneo prima delle 20 settimane
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12 mesi
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Esito della gravidanza per pazienti che hanno un trasferimento di embrioni - Tasso di gravidanza clinica
Lasso di tempo: 12 mesi
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Tasso di gravidanza in corso (oltre 20 settimane)
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12 mesi
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Esito della gravidanza per pazienti che hanno un trasferimento di embrioni - Tasso di fallimento dell'impianto
Lasso di tempo: 12 mesi
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Fallimento dell'impianto (%)
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12 mesi
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Investigatore principale: Souraya Jaroudi, ART Fertility Clinics
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Shamonki MI, Jin H, Haimowitz Z, Liu L. Proof of concept: preimplantation genetic screening without embryo biopsy through analysis of cell-free DNA in spent embryo culture media. Fertil Steril. 2016 Nov;106(6):1312-1318. doi: 10.1016/j.fertnstert.2016.07.1112. Epub 2016 Aug 24.
- Feichtinger M, Vaccari E, Carli L, Wallner E, Madel U, Figl K, Palini S, Feichtinger W. Non-invasive preimplantation genetic screening using array comparative genomic hybridization on spent culture media: a proof-of-concept pilot study. Reprod Biomed Online. 2017 Jun;34(6):583-589. doi: 10.1016/j.rbmo.2017.03.015. Epub 2017 Mar 28.
- Rubio C, Navarro-Sanchez L, Garcia-Pascual CM, Ocali O, Cimadomo D, Venier W, Barroso G, Kopcow L, Bahceci M, Kulmann MIR, Lopez L, De la Fuente E, Navarro R, Valbuena D, Sakkas D, Rienzi L, Simon C. Multicenter prospective study of concordance between embryonic cell-free DNA and trophectoderm biopsies from 1301 human blastocysts. Am J Obstet Gynecol. 2020 Nov;223(5):751.e1-751.e13. doi: 10.1016/j.ajog.2020.04.035. Epub 2020 May 26.
- Fang R, Yang W, Zhao X, Xiong F, Guo C, Xiao J, Chen L, Song X, Wang H, Chen J, Xiao X, Yao B, Cai LY. Chromosome screening using culture medium of embryos fertilised in vitro: a pilot clinical study. J Transl Med. 2019 Mar 8;17(1):73. doi: 10.1186/s12967-019-1827-1.
- Huang L, Bogale B, Tang Y, Lu S, Xie XS, Racowsky C. Noninvasive preimplantation genetic testing for aneuploidy in spent medium may be more reliable than trophectoderm biopsy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 9;116(28):14105-14112. doi: 10.1073/pnas.1907472116. Epub 2019 Jun 24.
- Capalbo A, Romanelli V, Patassini C, Poli M, Girardi L, Giancani A, Stoppa M, Cimadomo D, Ubaldi FM, Rienzi L. Diagnostic efficacy of blastocoel fluid and spent media as sources of DNA for preimplantation genetic testing in standard clinical conditions. Fertil Steril. 2018 Oct;110(5):870-879.e5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.05.031. Erratum In: Fertil Steril. 2019 Jan;111(1):194.
- Ho JR, Arrach N, Rhodes-Long K, Ahmady A, Ingles S, Chung K, Bendikson KA, Paulson RJ, McGinnis LK. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos. Fertil Steril. 2018 Aug;110(3):467-475.e2. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.03.036. Epub 2018 Jun 28.
- Kuznyetsov V, Madjunkova S, Antes R, Abramov R, Motamedi G, Ibarrientos Z, Librach C. Evaluation of a novel non-invasive preimplantation genetic screening approach. PLoS One. 2018 May 10;13(5):e0197262. doi: 10.1371/journal.pone.0197262. eCollection 2018.
- Vera-Rodriguez M, Diez-Juan A, Jimenez-Almazan J, Martinez S, Navarro R, Peinado V, Mercader A, Meseguer M, Blesa D, Moreno I, Valbuena D, Rubio C, Simon C. Origin and composition of cell-free DNA in spent medium from human embryo culture during preimplantation development. Hum Reprod. 2018 Apr 1;33(4):745-756. doi: 10.1093/humrep/dey028.
- Xu J, Fang R, Chen L, Chen D, Xiao JP, Yang W, Wang H, Song X, Ma T, Bo S, Shi C, Ren J, Huang L, Cai LY, Yao B, Xie XS, Lu S. Noninvasive chromosome screening of human embryos by genome sequencing of embryo culture medium for in vitro fertilization. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11907-11912. doi: 10.1073/pnas.1613294113. Epub 2016 Sep 29.
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- 2010-ABU-011-SJ
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