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- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT04711239
Test génétique préimplantatoire non invasif pour les aneuploïdies utilisant de l'ADN acellulaire dans des milieux de culture usés (niPGT-A)
Test génétique préimplantatoire non invasif pour les aneuploïdies (niPGT-A) - Évaluation de l'analyse de l'ADN acellulaire dans un milieu de culture usé
L'analyse de l'ADN acellulaire embryonnaire (cfDNA) présent dans les milieux de culture usés (SCM) est une alternative non invasive pour les tests génétiques préimplantatoires pour les aneuploïdies (PGT-A) qui évite les défis techniques et les limites de la biopsie. Les premières études portant sur cette méthode PGT-A non invasive (niPGT-A) ont rapporté une concordance variable entre le cfDNA dans le SCM et l'échantillon de trophectoderme (~ 30 % à 86 %) et ont indiqué une contribution de la masse cellulaire interne et du trophectoderme au cfDNA dans SCM.
Cette étude vise à évaluer l'utilisation du milieu de culture embryonnaire comme source de matériel génétique pour le PGT-A et à valider un protocole niPGT-A utilisant le cfDNA dans le SCM.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Plusieurs études ont démontré la capacité de détecter et d'amplifier le cfDNA à partir de SCM, à différents stades du développement embryonnaire, avec des taux variables de succès d'amplification. Différences dans les analytes, le moment de la collecte de SCM et la durée de la culture d'embryons dans le milieu collecté, les performances de l'éclosion assistée (AH), les méthodes d'amplification du génome entier, les méthodes complètes de dépistage des chromosomes et les plateformes de séquençage de nouvelle génération (NGS), les analyses bioinformatiques et les stratégies de l'identification de la contamination maternelle contribue à la performance ultime du niPGT-A.
Cette étude vise à valider une méthode PGT-A non invasive (niPGT-A) utilisant le cfDNA libéré du blastocyste humain dans le SCM.
Des patients subissant un traitement de fertilité avec PGT-A en raison d'une infertilité secondaire seront recrutés. Au jour 6 après la fécondation, le SCM sera prélevé avant la biopsie du blastocyste. Le SCM est normalement rejeté à ce stade. La biopsie du trophectoderme et la collecte d'échantillons suivront les pratiques standard du laboratoire de FIV pour le PGT-A clinique.
Trois kits de dépistage de l'aneuploïdie, reposant sur différentes méthodes d'amplification du génome entier suivies par NGS sur le système Ion GeneStudio™ S5 Prime (ThermoFisher Scientific), seront comparés. La concordance entre le cfDNA et les biopsies de trophectoderme sera évaluée pour environ 150 blastocystes avec le protocole niPGT-A le plus performant.
La sélection du ou des embryons à transférer sera basée uniquement sur le résultat PGT-A des cellules biopsiées. Le plan et le calendrier de traitement FIV+PGT-A du patient ne seront pas modifiés.
Type d'étude
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Souraya Jaroudi, PhD
- Numéro de téléphone: +971563115656
- E-mail: souraya.jaroudi@artfertilityclinics.com
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Neelke DeMunck, PhD
- E-mail: neelke.demunck@artfertilityclinics.com
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Patients sous traitement de fertilité avec PGT-A (protocole antagoniste FSH recombinant avec double déclencheur)
- Infertilité secondaire
- IMC 18- 35 kg/m2
- Sperme : sperme frais éjaculé (abstinence : 2-3 jours)
- Au moins un blastocyste biopsié au jour 6
Critère d'exclusion:
- Progestérone élevée le jour du déclenchement (> 1,5 ng/ml)
- Ovocytes vitrifiés
- Sperme congelé
- Indications du PGT-SR et du PGT-M
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
---|---|
Deux types d'échantillons (TE et SCM) seront prélevés pour tous les blastocystes inclus dans l'étude
|
PGT-A et niPGT-A seront effectués à l'aide d'une analyse de séquençage de nouvelle génération (NGS) pour la variation du nombre de copies chromosomiques (CNV).
Les transferts d'embryons reposeront uniquement sur les résultats de PGT-A pour les biopsies de trophectoderme.
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
---|---|---|
Concordance générale entre les résultats pour le cfDNA dans le SCM et les biopsies de trophectoderme
Délai: 4 mois
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Taux de concordance générale de la ploïdie : nombre de résultats appariés (euploïde-euploïde ou aneuploïde-aneuploïde)/nombre total d'échantillons de cfDNA avec un résultat
|
4 mois
|
Discordance par chromosome entre les résultats pour le cfDNA dans le SCM et les biopsies de trophectoderme
Délai: 4 mois
|
Discordance par chromosome : nombre d'erreurs chromosomiques mal identifiées/24*nombre total d'embryons avec résultat cfDNA
|
4 mois
|
Concordance par chromosome entre les résultats pour le cfDNA dans le SCM et le trophectoderme
Délai: 4 mois
|
Concordance des erreurs chromosomiques : nombre d'erreurs chromosomiques correctement identifiées/nombre total d'erreurs chromosomiques détectées
|
4 mois
|
Sensibilité de niPGT-A utilisant cfDNA dans SCM
Délai: 4 mois
|
Taux de faux négatifs : 1- (vrai résultat euploïde/nombre total d'échantillons avec un résultat)
|
4 mois
|
Spécificité de niPGT-A utilisant cfDNA dans SCM
Délai: 4 mois
|
Taux de faux positifs : 1- (résultat aneuploïde vrai/nombre total d'échantillons avec un résultat)
|
4 mois
|
Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
---|---|---|
Issue de grossesse pour les patientes ayant un transfert d'embryon - Taux d'implantation
Délai: 12 mois
|
Taux d'implantation = nombre de sacs gestationnels observés lors du dépistage échographique à 6 semaines de grossesse / nombre d'embryons transférés
|
12 mois
|
Issue de grossesse pour les patientes ayant un transfert d'embryon - Taux de grossesse biochimique
Délai: 12 mois
|
Taux de grossesse biochimique = test βhCG positif de > 15 UI mais pas de rythme cardiaque fœtal / sac gestationnel à l'échographie
|
12 mois
|
Issue de grossesse pour les patientes ayant un transfert d'embryon - Taux de grossesse clinique
Délai: 12 mois
|
Taux de grossesse clinique (%) défini par un test βhCG positif et une confirmation échographique du sac gestationnel ou du rythme cardiaque
|
12 mois
|
Issue de grossesse pour les patientes ayant un transfert d'embryon - Taux de fausses couches
Délai: 12 mois
|
Taux de fausses couches (%) défini par la visualisation échographique d'un ou plusieurs sacs gestationnels, y compris les grossesses extra-utérines, avec fausse couche spontanée avant 20 semaines
|
12 mois
|
Issue de grossesse pour les patientes ayant un transfert d'embryon - Taux de grossesse clinique
Délai: 12 mois
|
Taux de grossesse en cours (au-delà de 20 semaines)
|
12 mois
|
Issue de grossesse pour les patientes ayant un transfert d'embryon - Taux d'échec d'implantation
Délai: 12 mois
|
Échec d'implantation (%)
|
12 mois
|
Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Souraya Jaroudi, ART Fertility Clinics
Publications et liens utiles
Publications générales
- Shamonki MI, Jin H, Haimowitz Z, Liu L. Proof of concept: preimplantation genetic screening without embryo biopsy through analysis of cell-free DNA in spent embryo culture media. Fertil Steril. 2016 Nov;106(6):1312-1318. doi: 10.1016/j.fertnstert.2016.07.1112. Epub 2016 Aug 24.
- Feichtinger M, Vaccari E, Carli L, Wallner E, Madel U, Figl K, Palini S, Feichtinger W. Non-invasive preimplantation genetic screening using array comparative genomic hybridization on spent culture media: a proof-of-concept pilot study. Reprod Biomed Online. 2017 Jun;34(6):583-589. doi: 10.1016/j.rbmo.2017.03.015. Epub 2017 Mar 28.
- Rubio C, Navarro-Sanchez L, Garcia-Pascual CM, Ocali O, Cimadomo D, Venier W, Barroso G, Kopcow L, Bahceci M, Kulmann MIR, Lopez L, De la Fuente E, Navarro R, Valbuena D, Sakkas D, Rienzi L, Simon C. Multicenter prospective study of concordance between embryonic cell-free DNA and trophectoderm biopsies from 1301 human blastocysts. Am J Obstet Gynecol. 2020 Nov;223(5):751.e1-751.e13. doi: 10.1016/j.ajog.2020.04.035. Epub 2020 May 26.
- Fang R, Yang W, Zhao X, Xiong F, Guo C, Xiao J, Chen L, Song X, Wang H, Chen J, Xiao X, Yao B, Cai LY. Chromosome screening using culture medium of embryos fertilised in vitro: a pilot clinical study. J Transl Med. 2019 Mar 8;17(1):73. doi: 10.1186/s12967-019-1827-1.
- Huang L, Bogale B, Tang Y, Lu S, Xie XS, Racowsky C. Noninvasive preimplantation genetic testing for aneuploidy in spent medium may be more reliable than trophectoderm biopsy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 9;116(28):14105-14112. doi: 10.1073/pnas.1907472116. Epub 2019 Jun 24.
- Capalbo A, Romanelli V, Patassini C, Poli M, Girardi L, Giancani A, Stoppa M, Cimadomo D, Ubaldi FM, Rienzi L. Diagnostic efficacy of blastocoel fluid and spent media as sources of DNA for preimplantation genetic testing in standard clinical conditions. Fertil Steril. 2018 Oct;110(5):870-879.e5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.05.031. Erratum In: Fertil Steril. 2019 Jan;111(1):194.
- Ho JR, Arrach N, Rhodes-Long K, Ahmady A, Ingles S, Chung K, Bendikson KA, Paulson RJ, McGinnis LK. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos. Fertil Steril. 2018 Aug;110(3):467-475.e2. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.03.036. Epub 2018 Jun 28.
- Kuznyetsov V, Madjunkova S, Antes R, Abramov R, Motamedi G, Ibarrientos Z, Librach C. Evaluation of a novel non-invasive preimplantation genetic screening approach. PLoS One. 2018 May 10;13(5):e0197262. doi: 10.1371/journal.pone.0197262. eCollection 2018.
- Vera-Rodriguez M, Diez-Juan A, Jimenez-Almazan J, Martinez S, Navarro R, Peinado V, Mercader A, Meseguer M, Blesa D, Moreno I, Valbuena D, Rubio C, Simon C. Origin and composition of cell-free DNA in spent medium from human embryo culture during preimplantation development. Hum Reprod. 2018 Apr 1;33(4):745-756. doi: 10.1093/humrep/dey028.
- Xu J, Fang R, Chen L, Chen D, Xiao JP, Yang W, Wang H, Song X, Ma T, Bo S, Shi C, Ren J, Huang L, Cai LY, Yao B, Xie XS, Lu S. Noninvasive chromosome screening of human embryos by genome sequencing of embryo culture medium for in vitro fertilization. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11907-11912. doi: 10.1073/pnas.1613294113. Epub 2016 Sep 29.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 2010-ABU-011-SJ
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
produit fabriqué et exporté des États-Unis.
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