- ICH GCP
- 미국 임상 시험 레지스트리
- 임상시험 NCT04711239
사용된 배양 배지에서 무세포 DNA를 사용한 이수배체에 대한 비침습적 착상 전 유전자 검사 (niPGT-A)
이수성(niPGT-A)에 대한 비침습적 착상 전 유전자 검사 - 사용된 배양 배지에서 무세포 DNA 분석 평가
사용된 배양 배지(SCM)에 존재하는 배아 무세포 DNA(cfDNA) 분석은 생검의 기술적 문제와 한계를 피하는 이수성(PGT-A)에 대한 착상 전 유전자 검사를 위한 비침습적 대안입니다. 이 비침습적 PGT-A(niPGT-A) 방법을 조사한 초기 연구에서는 SCM의 cfDNA와 영양외배엽 샘플(~ 30%-86%) 사이의 가변적 일치성을 보고했으며 내부 세포 덩어리와 영양외배엽 모두에서 cfDNA에 대한 기여도를 나타냈습니다. SCM에서.
이 연구는 PGT-A의 유전 물질 공급원으로서 배아 배양 배지의 사용을 평가하고 SCM에서 cfDNA를 사용하여 niPGT-A 프로토콜을 검증하는 것을 목표로 합니다.
연구 개요
상세 설명
여러 연구에서 배아 발달의 여러 단계에서 다양한 증폭 성공률로 SCM에서 cfDNA를 검출하고 증폭하는 능력이 입증되었습니다. 분석 물질의 차이, SCM 수집 시기 및 수집된 배지 내 배아 배양 기간, 보조 부화(AH) 성능, 전체 게놈 증폭 방법, 포괄적인 염색체 스크리닝 방법 및 차세대 시퀀싱(NGS) 플랫폼, 생물정보학적 분석 및 전략 산모 오염 식별은 모두 niPGT-A의 궁극적인 성능에 기여합니다.
이 연구는 인간 배반포에서 SCM으로 방출된 cfDNA를 활용하는 비침습 PGT-A(niPGT-A) 방법을 검증하는 것을 목표로 합니다.
2차 불임으로 인해 PGT-A로 불임 치료를 받는 환자를 모집합니다. 수정 후 6일째에 배반포 생검 전에 SCM을 수집합니다. SCM은 일반적으로 이 단계에서 폐기됩니다. Trophectoderm 생검 및 샘플 수집은 임상 PGT-A에 대한 IVF 실험실의 표준 관행을 따를 것입니다.
Ion GeneStudio™ S5 Prime System(ThermoFisher Scientific)에서 NGS가 뒤따르는 다양한 전체 게놈 증폭 방법에 의존하는 세 가지 이수성 스크리닝 키트를 비교할 것입니다. cfDNA와 영양외배엽 생검 사이의 일치성은 최고 성능의 niPGT-A 프로토콜을 사용하여 약 150개의 배반포에 대해 평가됩니다.
이식할 배아의 선택은 생검 세포의 PGT-A 결과만을 기반으로 합니다. 환자의 IVF+PGT-A 치료 계획 및 일정은 변경되지 않습니다.
연구 유형
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Souraya Jaroudi, PhD
- 전화번호: +971563115656
- 이메일: souraya.jaroudi@artfertilityclinics.com
연구 연락처 백업
- 이름: Neelke DeMunck, PhD
- 이메일: neelke.demunck@artfertilityclinics.com
참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- PGT-A(Recombinant FSH antagonist protocol with dual trigger)로 불임 치료를 받는 환자
- 이차성 불임
- BMI 18~35kg/m2
- 정자: 신선한 사정된 정자(절제: 2~3일)
- 6일째에 적어도 하나의 배반포 생검
제외 기준:
- 유발 당일 높은 프로게스테론(>1.5ng/ml)
- 유리화된 난모세포
- 냉동 정자
- PGT-SR 및 PGT-M에 대한 적응증
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 보병대
- 시간 관점: 유망한
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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연구에 포함된 모든 배반포에 대해 두 가지 유형의 샘플(TE 및 SCM)이 수집됩니다.
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PGT-A 및 niPGT-A는 염색체 복제 수 변이(CNV)에 대한 차세대 시퀀싱(NGS) 분석을 사용하여 수행됩니다.
배아 이식은 영양외배엽 생검에 대한 PGT-A 결과에만 의존합니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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SCM 및 영양외배엽 생검에서 cfDNA에 대한 결과 간의 일반적인 일치
기간: 4개월
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일반 계략 일치율: 일치하는(정배수체-정배수체 또는 이배수체-이배수체) 결과의 수/결과가 있는 총 cfDNA 샘플 수
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4개월
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SCM 및 영양외배엽 생검에서 cfDNA에 대한 결과 사이의 염색체별 불일치
기간: 4개월
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염색체별 불일치: 오인된 염색체 오류 수/24*cfDNA 결과가 있는 총 배아 수
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4개월
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SCM과 영양외배엽의 cfDNA 결과 간 염색체별 일치도
기간: 4개월
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염색체 오류 일치: 정확하게 식별된 염색체 오류의 수/검출된 염색체 오류의 총 수
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4개월
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SCM에서 cfDNA를 사용한 niPGT-A의 감도
기간: 4개월
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위음성률: 1-(진 정배수체 결과/결과가 있는 총 샘플 수)
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4개월
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SCM에서 cfDNA를 사용한 niPGT-A의 특이성
기간: 4개월
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위양성률: 1-(진 이배수체 결과/결과가 있는 총 샘플 수)
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4개월
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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배아 이식 환자의 임신 결과 - 이식률
기간: 12 개월
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착상률 = 임신 6주 초음파 검사에서 관찰된 임신낭 수 / 이식된 배아 수
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12 개월
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배아 이식 환자의 임신 결과 - 생화학적 임신율
기간: 12 개월
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생화학적 임신율 = > 15IU의 양성 βhCG 검사이지만 초음파 검사에서 태아 심장박동/임신낭 없음
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12 개월
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배아 이식 환자의 임신 결과 - 임상 임신율
기간: 12 개월
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양성 βhCG 검사 및 임신낭 또는 심장 박동의 초음파 확인으로 정의되는 임상 임신율(%)
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12 개월
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배아 이식 환자의 임신 결과 - 유산율
기간: 12 개월
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자궁외 임신을 포함하여 20주 이전에 자발적인 임신 손실이 있는 하나 이상의 임신낭의 초음파 시각화로 정의된 유산률(%)
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12 개월
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배아 이식 환자의 임신 결과 - 임상 임신율
기간: 12 개월
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임신 진행률(20주 초과)
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12 개월
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배아 이식 환자의 임신 결과 - 착상 실패율
기간: 12 개월
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이식 실패(%)
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12 개월
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Souraya Jaroudi, ART Fertility Clinics
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Shamonki MI, Jin H, Haimowitz Z, Liu L. Proof of concept: preimplantation genetic screening without embryo biopsy through analysis of cell-free DNA in spent embryo culture media. Fertil Steril. 2016 Nov;106(6):1312-1318. doi: 10.1016/j.fertnstert.2016.07.1112. Epub 2016 Aug 24.
- Feichtinger M, Vaccari E, Carli L, Wallner E, Madel U, Figl K, Palini S, Feichtinger W. Non-invasive preimplantation genetic screening using array comparative genomic hybridization on spent culture media: a proof-of-concept pilot study. Reprod Biomed Online. 2017 Jun;34(6):583-589. doi: 10.1016/j.rbmo.2017.03.015. Epub 2017 Mar 28.
- Rubio C, Navarro-Sanchez L, Garcia-Pascual CM, Ocali O, Cimadomo D, Venier W, Barroso G, Kopcow L, Bahceci M, Kulmann MIR, Lopez L, De la Fuente E, Navarro R, Valbuena D, Sakkas D, Rienzi L, Simon C. Multicenter prospective study of concordance between embryonic cell-free DNA and trophectoderm biopsies from 1301 human blastocysts. Am J Obstet Gynecol. 2020 Nov;223(5):751.e1-751.e13. doi: 10.1016/j.ajog.2020.04.035. Epub 2020 May 26.
- Fang R, Yang W, Zhao X, Xiong F, Guo C, Xiao J, Chen L, Song X, Wang H, Chen J, Xiao X, Yao B, Cai LY. Chromosome screening using culture medium of embryos fertilised in vitro: a pilot clinical study. J Transl Med. 2019 Mar 8;17(1):73. doi: 10.1186/s12967-019-1827-1.
- Huang L, Bogale B, Tang Y, Lu S, Xie XS, Racowsky C. Noninvasive preimplantation genetic testing for aneuploidy in spent medium may be more reliable than trophectoderm biopsy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 9;116(28):14105-14112. doi: 10.1073/pnas.1907472116. Epub 2019 Jun 24.
- Capalbo A, Romanelli V, Patassini C, Poli M, Girardi L, Giancani A, Stoppa M, Cimadomo D, Ubaldi FM, Rienzi L. Diagnostic efficacy of blastocoel fluid and spent media as sources of DNA for preimplantation genetic testing in standard clinical conditions. Fertil Steril. 2018 Oct;110(5):870-879.e5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.05.031. Erratum In: Fertil Steril. 2019 Jan;111(1):194.
- Ho JR, Arrach N, Rhodes-Long K, Ahmady A, Ingles S, Chung K, Bendikson KA, Paulson RJ, McGinnis LK. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos. Fertil Steril. 2018 Aug;110(3):467-475.e2. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.03.036. Epub 2018 Jun 28.
- Kuznyetsov V, Madjunkova S, Antes R, Abramov R, Motamedi G, Ibarrientos Z, Librach C. Evaluation of a novel non-invasive preimplantation genetic screening approach. PLoS One. 2018 May 10;13(5):e0197262. doi: 10.1371/journal.pone.0197262. eCollection 2018.
- Vera-Rodriguez M, Diez-Juan A, Jimenez-Almazan J, Martinez S, Navarro R, Peinado V, Mercader A, Meseguer M, Blesa D, Moreno I, Valbuena D, Rubio C, Simon C. Origin and composition of cell-free DNA in spent medium from human embryo culture during preimplantation development. Hum Reprod. 2018 Apr 1;33(4):745-756. doi: 10.1093/humrep/dey028.
- Xu J, Fang R, Chen L, Chen D, Xiao JP, Yang W, Wang H, Song X, Ma T, Bo S, Shi C, Ren J, Huang L, Cai LY, Yao B, Xie XS, Lu S. Noninvasive chromosome screening of human embryos by genome sequencing of embryo culture medium for in vitro fertilization. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11907-11912. doi: 10.1073/pnas.1613294113. Epub 2016 Sep 29.
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