Niet-invasieve pre-implantatie genetische tests voor aneuploïdieën met behulp van celvrij DNA in gebruikte kweekmedia (niPGT-A)
Niet-invasieve pre-implantatie genetische tests voor aneuploïdieën (niPGT-A) - Evaluatie van de analyse van celvrij DNA in gebruikt kweekmedium
Analyse van embryonaal celvrij DNA (cfDNA) aanwezig in de gebruikte kweekmedia (SCM) is een niet-invasief alternatief voor pre-implantatie genetisch testen op aneuploïdieën (PGT-A) dat de technische uitdagingen en beperkingen van biopsie vermijdt. Eerste studies die deze niet-invasieve PGT-A (niPGT-A) methode onderzochten, meldden een variabele concordantie tussen cfDNA in SCM en het trophectoderm-monster (~ 30%-86%) en wezen op een bijdrage van zowel de binnenste celmassa als het trophectoderm aan het cfDNA in SCM.
Deze studie heeft tot doel het gebruik van het embryocultuurmedium als bron van genetisch materiaal voor PGT-A te evalueren en een niPGT-A-protocol te valideren met behulp van cfDNA in SCM.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Meerdere onderzoeken hebben het vermogen aangetoond om cfDNA uit SCM te detecteren en te amplificeren, in verschillende stadia van embryonale ontwikkeling, met verschillende snelheden van amplificatiesucces. Verschillen in analyten, timing van SCM-verzameling en de duur van embryocultuur binnen het verzamelde medium, prestatie van assisted hatching (AH), amplificatiemethoden voor het gehele genoom, uitgebreide methoden voor chromosoomscreening en next generation sequencing (NGS)-platforms, bioinformatica-analyses en strategieën voor het identificeren van maternale besmetting dragen allemaal bij aan de uiteindelijke prestaties van niPGT-A.
Deze studie heeft tot doel een niet-invasieve PGT-A (niPGT-A) methode te valideren waarbij gebruik wordt gemaakt van cfDNA dat vrijkomt uit de menselijke blastocyst in de SCM.
Patiënten die een vruchtbaarheidsbehandeling met PGT-A ondergaan vanwege secundaire onvruchtbaarheid zullen worden geworven. Op dag 6 na de bevruchting wordt vóór de blastocystbiopsie SCM afgenomen. De SCM wordt in dit stadium normaal gesproken weggegooid. Trophectodermbiopsie en monsterafname volgen de standaardpraktijken van het IVF-laboratorium voor klinische PGT-A.
Drie screeningkits voor aneuploïdie, gebaseerd op verschillende amplificatiemethoden van het gehele genoom gevolgd door NGS op het Ion GeneStudio™ S5 Prime-systeem (ThermoFisher Scientific), zullen worden vergeleken. De concordantie tussen cfDNA- en trophectoderm-biopten zal worden geëvalueerd voor ongeveer 150 blastocysten met het best presterende niPGT-A-protocol.
Selectie van de embryo('s) voor terugplaatsing zal uitsluitend gebaseerd zijn op het PGT-A-resultaat van de biopsiecellen. Het IVF+PGT-A-behandelplan en de tijdlijn van de patiënt worden niet gewijzigd.
Studietype
Contacten en locaties
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Patiënten die een vruchtbaarheidsbehandeling ondergaan met PGT-A (Recombinant FSH-antagonistprotocol met dubbele trigger)
- Secundaire onvruchtbaarheid
- BMI 18-35 kg/m2
- Sperma: vers geëjaculeerd sperma (onthouding: 2-3 dagen)
- Ten minste één blastocystbiopsie op dag 6
Uitsluitingscriteria:
- Hoog progesteron op de dag van trigger (>1,5 ng/ml)
- Verglaasde eicellen
- Bevroren sperma
- Indicaties voor PGT-SR en PGT-M
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Cohort
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Er zullen twee soorten monsters (TE en SCM) worden verzameld voor alle blastocysten die in het onderzoek zijn opgenomen
|
PGT-A en niPGT-A zullen worden uitgevoerd met behulp van next generation sequencing (NGS) analyse voor chromosoomkopienummervariatie (CNV).
Embryotransfers zijn uitsluitend afhankelijk van de resultaten van PGT-A voor trophectodermbiopten.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Algemene overeenstemming tussen resultaten voor cfDNA in SCM- en trophectoderm-biopten
Tijdsspanne: 4 maanden
|
Concordantiepercentage algemene ploïdie: aantal overeenkomende (euploïde-euploïde of aneuploïde-aneuploïde) resultaat/totaal aantal cfDNA-monsters met een resultaat
|
4 maanden
|
|
Discordantie per chromosoom tussen resultaten voor cfDNA in SCM en trophectoderm biopsieën
Tijdsspanne: 4 maanden
|
Discordantie per chromosoom: aantal verkeerd geïdentificeerde chromosomale fouten/24*totaal aantal embryo's met cfDNA resultaat
|
4 maanden
|
|
Concordantie per chromosoom tussen resultaten voor cfDNA in SCM en trophectoderm
Tijdsspanne: 4 maanden
|
Concordantie chromosoomfout: aantal correct geïdentificeerde chromosomale fouten/totaal aantal gedetecteerde chromosomale fouten
|
4 maanden
|
|
Gevoeligheid van niPGT-A met behulp van cfDNA in SCM
Tijdsspanne: 4 maanden
|
Percentage fout-negatieven: 1- (echt euploïde resultaat/totaal aantal monsters met een resultaat)
|
4 maanden
|
|
Specificiteit van niPGT-A met behulp van cfDNA in SCM
Tijdsspanne: 4 maanden
|
Percentage fout-positieven: 1- (echt aneuploïde resultaat/totaal aantal monsters met een resultaat)
|
4 maanden
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Zwangerschapsuitkomst voor patiënten met een embryotransfer - Implantatiepercentage
Tijdsspanne: 12 maanden
|
Implantatiesnelheid = aantal zwangerschapszakjes waargenomen bij echografische screening na 6 weken zwangerschap / aantal teruggeplaatste embryo's
|
12 maanden
|
|
Zwangerschapsuitkomst voor patiënten met een embryotransfer - Biochemisch zwangerschapspercentage
Tijdsspanne: 12 maanden
|
Biochemisch zwangerschapspercentage = positieve βhCG-test van > 15 IE maar geen foetale hartslag/zwangerschapszak bij echografisch onderzoek
|
12 maanden
|
|
Zwangerschapsuitkomst voor patiënten met een embryotransfer - Klinisch zwangerschapspercentage
Tijdsspanne: 12 maanden
|
Klinisch zwangerschapspercentage (%) gedefinieerd door positieve βhCG-test en echografische bevestiging van zwangerschapszak of hartslag
|
12 maanden
|
|
Zwangerschapsuitkomst voor patiënten met een embryotransfer - Miskraampercentage
Tijdsspanne: 12 maanden
|
Miskraampercentage (%) gedefinieerd door echografische visualisatie van een of meer zwangerschapszakjes, inclusief buitenbaarmoederlijke zwangerschappen, met spontaan zwangerschapsverlies vóór 20 weken
|
12 maanden
|
|
Zwangerschapsuitkomst voor patiënten met een embryotransfer - Klinisch zwangerschapspercentage
Tijdsspanne: 12 maanden
|
Percentage doorgaande zwangerschap (langer dan 20 weken)
|
12 maanden
|
|
Zwangerschapsuitkomst voor patiënten met een embryotransfer - Percentage mislukte implantaties
Tijdsspanne: 12 maanden
|
Implantatie mislukt (%)
|
12 maanden
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Souraya Jaroudi, ART Fertility Clinics
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Shamonki MI, Jin H, Haimowitz Z, Liu L. Proof of concept: preimplantation genetic screening without embryo biopsy through analysis of cell-free DNA in spent embryo culture media. Fertil Steril. 2016 Nov;106(6):1312-1318. doi: 10.1016/j.fertnstert.2016.07.1112. Epub 2016 Aug 24.
- Feichtinger M, Vaccari E, Carli L, Wallner E, Madel U, Figl K, Palini S, Feichtinger W. Non-invasive preimplantation genetic screening using array comparative genomic hybridization on spent culture media: a proof-of-concept pilot study. Reprod Biomed Online. 2017 Jun;34(6):583-589. doi: 10.1016/j.rbmo.2017.03.015. Epub 2017 Mar 28.
- Rubio C, Navarro-Sanchez L, Garcia-Pascual CM, Ocali O, Cimadomo D, Venier W, Barroso G, Kopcow L, Bahceci M, Kulmann MIR, Lopez L, De la Fuente E, Navarro R, Valbuena D, Sakkas D, Rienzi L, Simon C. Multicenter prospective study of concordance between embryonic cell-free DNA and trophectoderm biopsies from 1301 human blastocysts. Am J Obstet Gynecol. 2020 Nov;223(5):751.e1-751.e13. doi: 10.1016/j.ajog.2020.04.035. Epub 2020 May 26.
- Fang R, Yang W, Zhao X, Xiong F, Guo C, Xiao J, Chen L, Song X, Wang H, Chen J, Xiao X, Yao B, Cai LY. Chromosome screening using culture medium of embryos fertilised in vitro: a pilot clinical study. J Transl Med. 2019 Mar 8;17(1):73. doi: 10.1186/s12967-019-1827-1.
- Huang L, Bogale B, Tang Y, Lu S, Xie XS, Racowsky C. Noninvasive preimplantation genetic testing for aneuploidy in spent medium may be more reliable than trophectoderm biopsy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 9;116(28):14105-14112. doi: 10.1073/pnas.1907472116. Epub 2019 Jun 24.
- Capalbo A, Romanelli V, Patassini C, Poli M, Girardi L, Giancani A, Stoppa M, Cimadomo D, Ubaldi FM, Rienzi L. Diagnostic efficacy of blastocoel fluid and spent media as sources of DNA for preimplantation genetic testing in standard clinical conditions. Fertil Steril. 2018 Oct;110(5):870-879.e5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.05.031. Erratum In: Fertil Steril. 2019 Jan;111(1):194.
- Ho JR, Arrach N, Rhodes-Long K, Ahmady A, Ingles S, Chung K, Bendikson KA, Paulson RJ, McGinnis LK. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos. Fertil Steril. 2018 Aug;110(3):467-475.e2. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.03.036. Epub 2018 Jun 28.
- Kuznyetsov V, Madjunkova S, Antes R, Abramov R, Motamedi G, Ibarrientos Z, Librach C. Evaluation of a novel non-invasive preimplantation genetic screening approach. PLoS One. 2018 May 10;13(5):e0197262. doi: 10.1371/journal.pone.0197262. eCollection 2018.
- Vera-Rodriguez M, Diez-Juan A, Jimenez-Almazan J, Martinez S, Navarro R, Peinado V, Mercader A, Meseguer M, Blesa D, Moreno I, Valbuena D, Rubio C, Simon C. Origin and composition of cell-free DNA in spent medium from human embryo culture during preimplantation development. Hum Reprod. 2018 Apr 1;33(4):745-756. doi: 10.1093/humrep/dey028.
- Xu J, Fang R, Chen L, Chen D, Xiao JP, Yang W, Wang H, Song X, Ma T, Bo S, Shi C, Ren J, Huang L, Cai LY, Yao B, Xie XS, Lu S. Noninvasive chromosome screening of human embryos by genome sequencing of embryo culture medium for in vitro fertilization. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11907-11912. doi: 10.1073/pnas.1613294113. Epub 2016 Sep 29.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 2010-ABU-011-SJ
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .