使用済み培養液中の無細胞 DNA を使用した異数性の非侵襲的着床前遺伝子検査 (niPGT-A)
2023年3月17日 更新者：ART Fertility Clinics LLC
異数性の非侵襲的着床前遺伝子検査 (niPGT-A) - 使用済み培養液中の無細胞 DNA 分析の評価
使用済み培養培地 (SCM) に存在する胚性無細胞 DNA (cfDNA) の分析は、生検の技術的な課題と制限を回避する、異数性の着床前遺伝子検査 (PGT-A) の非侵襲的な代替手段です。 この非侵襲的な PGT-A (niPGT-A) メソッドを調査する初期の研究では、SCM 中の cfDNA と栄養外胚葉サンプル (~ 30%-86%) の間の変数の一致が報告され、内部細胞塊と栄養外胚葉の両方から cfDNA への寄与が示されました。 SCMで。
この研究は、PGT-A の遺伝物質の供給源としての胚培養培地の使用を評価し、SCM で cfDNA を使用して niPGT-A プロトコルを検証することを目的としています。
調査の概要
詳細な説明
複数の研究により、胚発生のさまざまな段階で、さまざまな増幅成功率で、SCM から cfDNA を検出および増幅する能力が実証されています。 検体の違い、SCM 収集のタイミングと収集された培地内での胚培養の期間、補助孵化 (AH) のパフォーマンス、全ゲノム増幅法、包括的な染色体スクリーニング法と次世代シーケンシング (NGS) プラットフォーム、バイオインフォマティクス分析と戦略母体汚染を特定することはすべて、niPGT-A の究極のパフォーマンスに貢献します。
この研究は、ヒト胚盤胞から SCM に放出された cfDNA を利用した非侵襲的な PGT-A (niPGT-A) メソッドを検証することを目的としています。
二次不妊症のためにPGT-Aによる不妊治療を受けている患者が募集されます。 受精後 6 日目に、胚盤胞生検の前に SCM を採取します。 通常、SCM はこの段階で破棄されます。 栄養外胚葉生検およびサンプル収集は、IVF 検査室の臨床 PGT-A に関する標準的な慣行に従います。
Ion GeneStudio™ S5 Prime System (ThermoFisher Scientific) での NGS に続く、異なる全ゲノム増幅法に依存する 3 つの異数性スクリーニング キットを比較します。 cfDNA と栄養外胚葉生検の間の一致は、最高のパフォーマンスの niPGT-A プロトコルで約 150 の胚盤胞について評価されます。
移植のための胚の選択は、生検細胞からのPGT-Aの結果のみに基づいて行われます。 患者の IVF+PGT-A 治療計画とタイムラインは変更されません。
研究の種類
観察的
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究連絡先
- 名前：Souraya Jaroudi, PhD
- 電話番号：+971563115656
- メール：souraya.jaroudi@artfertilityclinics.com
研究連絡先のバックアップ
- 名前：Neelke DeMunck, PhD
- メール：neelke.demunck@artfertilityclinics.com
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年～46年 (大人)
健康ボランティアの受け入れ
はい
受講資格のある性別
女性
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
PGT-Aによる不妊治療を受け、適格基準を満たすカップルから生成された6日目の胚盤胞
説明
包含基準:
- PGT-A（デュアルトリガーによる組換えFSHアンタゴニストプロトコル）による不妊治療を受けている患者
- 二次不妊症
- BMI 18～35kg/m2
- 精子：新鮮な射精精子（禁欲：2～3日）
- 6日目に生検された少なくとも1つの胚盤胞
除外基準:
- トリガーの日に高プロゲステロン (>1.5ng/ml)
- ガラス化卵母細胞
- 凍結精子
- PGT-SR および PGT-M の適応症
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：コホート
- 時間の展望：見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
|---|---|
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研究に含まれるすべての胚盤胞について、2 種類のサンプル (TE および SCM) が収集されます。
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PGT-A および niPGT-A は、染色体コピー数変動 (CNV) の次世代シーケンシング (NGS) 分析を使用して実行されます。
胚移植は、栄養外胚葉生検の PGT-A の結果のみに依存します。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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SCM および栄養外胚葉生検における cfDNA の結果の一般的な一致
時間枠：4ヶ月
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一般的な倍数性一致率: 一致した (euploid-euploid または aneuloid-aneuploid) 結果の数/結果を含む cfDNA サンプルの総数
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4ヶ月
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SCM および栄養外胚葉生検における cfDNA の結果間の染色体ごとの不一致
時間枠：4ヶ月
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染色体ごとの不一致: 誤認された染色体エラーの数/24 * cfDNA 結果を含む胚の総数
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4ヶ月
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SCM と栄養外胚葉における cfDNA の結果間の染色体ごとの一致
時間枠：4ヶ月
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染色体エラーの一致: 正しく識別された染色体エラーの数/検出された染色体エラーの総数
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4ヶ月
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SCM で cfDNA を使用した niPGT-A の感度
時間枠：4ヶ月
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偽陰性率: 1- (真の正数体の結果/結果のあるサンプルの総数)
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4ヶ月
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SCM で cfDNA を使用した niPGT-A の特異性
時間枠：4ヶ月
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偽陽性率: 1- (真の異数性の結果/結果のあるサンプルの総数)
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4ヶ月
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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胚移植を受けた患者の妊娠転帰 - 着床率
時間枠：12ヶ月
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着床率 = 妊娠 6 週の超音波検査で観察された胎嚢の数 / 移植された胚の数
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12ヶ月
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胚移植を受けた患者の妊娠結果 - 生化学的妊娠率
時間枠：12ヶ月
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生化学的妊娠率 = > 15IUのβhCG検査で陽性だが、超音波検査で胎児の心拍/胎嚢がない
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12ヶ月
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胚移植を受けた患者の妊娠転帰 - 臨床妊娠率
時間枠：12ヶ月
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陽性βhCG検査および妊娠嚢または心拍の超音波確認によって定義される臨床妊娠率（%）
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12ヶ月
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胚移植を受けた患者の妊娠転帰 - 流産率
時間枠：12ヶ月
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流産率 (%) は、子宮外妊娠を含む 1 つまたは複数の胎嚢の超音波検査による可視化によって定義され、20 週前の自然流産を伴います
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12ヶ月
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胚移植を受けた患者の妊娠転帰 - 臨床妊娠率
時間枠：12ヶ月
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妊娠継続率（20週以降）
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12ヶ月
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胚移植を受けた患者の妊娠転帰 - 着床失敗率
時間枠：12ヶ月
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着床失敗 (%)
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12ヶ月
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
捜査官
- 主任研究者：Souraya Jaroudi、ART Fertility Clinics
出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- Shamonki MI, Jin H, Haimowitz Z, Liu L. Proof of concept: preimplantation genetic screening without embryo biopsy through analysis of cell-free DNA in spent embryo culture media. Fertil Steril. 2016 Nov;106(6):1312-1318. doi: 10.1016/j.fertnstert.2016.07.1112. Epub 2016 Aug 24.
- Feichtinger M, Vaccari E, Carli L, Wallner E, Madel U, Figl K, Palini S, Feichtinger W. Non-invasive preimplantation genetic screening using array comparative genomic hybridization on spent culture media: a proof-of-concept pilot study. Reprod Biomed Online. 2017 Jun;34(6):583-589. doi: 10.1016/j.rbmo.2017.03.015. Epub 2017 Mar 28.
- Rubio C, Navarro-Sanchez L, Garcia-Pascual CM, Ocali O, Cimadomo D, Venier W, Barroso G, Kopcow L, Bahceci M, Kulmann MIR, Lopez L, De la Fuente E, Navarro R, Valbuena D, Sakkas D, Rienzi L, Simon C. Multicenter prospective study of concordance between embryonic cell-free DNA and trophectoderm biopsies from 1301 human blastocysts. Am J Obstet Gynecol. 2020 Nov;223(5):751.e1-751.e13. doi: 10.1016/j.ajog.2020.04.035. Epub 2020 May 26.
- Fang R, Yang W, Zhao X, Xiong F, Guo C, Xiao J, Chen L, Song X, Wang H, Chen J, Xiao X, Yao B, Cai LY. Chromosome screening using culture medium of embryos fertilised in vitro: a pilot clinical study. J Transl Med. 2019 Mar 8;17(1):73. doi: 10.1186/s12967-019-1827-1.
- Huang L, Bogale B, Tang Y, Lu S, Xie XS, Racowsky C. Noninvasive preimplantation genetic testing for aneuploidy in spent medium may be more reliable than trophectoderm biopsy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 9;116(28):14105-14112. doi: 10.1073/pnas.1907472116. Epub 2019 Jun 24.
- Capalbo A, Romanelli V, Patassini C, Poli M, Girardi L, Giancani A, Stoppa M, Cimadomo D, Ubaldi FM, Rienzi L. Diagnostic efficacy of blastocoel fluid and spent media as sources of DNA for preimplantation genetic testing in standard clinical conditions. Fertil Steril. 2018 Oct;110(5):870-879.e5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.05.031. Erratum In: Fertil Steril. 2019 Jan;111(1):194.
- Ho JR, Arrach N, Rhodes-Long K, Ahmady A, Ingles S, Chung K, Bendikson KA, Paulson RJ, McGinnis LK. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos. Fertil Steril. 2018 Aug;110(3):467-475.e2. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.03.036. Epub 2018 Jun 28.
- Kuznyetsov V, Madjunkova S, Antes R, Abramov R, Motamedi G, Ibarrientos Z, Librach C. Evaluation of a novel non-invasive preimplantation genetic screening approach. PLoS One. 2018 May 10;13(5):e0197262. doi: 10.1371/journal.pone.0197262. eCollection 2018.
- Vera-Rodriguez M, Diez-Juan A, Jimenez-Almazan J, Martinez S, Navarro R, Peinado V, Mercader A, Meseguer M, Blesa D, Moreno I, Valbuena D, Rubio C, Simon C. Origin and composition of cell-free DNA in spent medium from human embryo culture during preimplantation development. Hum Reprod. 2018 Apr 1;33(4):745-756. doi: 10.1093/humrep/dey028.
- Xu J, Fang R, Chen L, Chen D, Xiao JP, Yang W, Wang H, Song X, Ma T, Bo S, Shi C, Ren J, Huang L, Cai LY, Yao B, Xie XS, Lu S. Noninvasive chromosome screening of human embryos by genome sequencing of embryo culture medium for in vitro fertilization. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11907-11912. doi: 10.1073/pnas.1613294113. Epub 2016 Sep 29.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2021年10月15日
一次修了 (実際)
2021年10月15日
研究の完了 (実際)
2021年10月15日
試験登録日
最初に提出
2021年1月8日
QC基準を満たした最初の提出物
2021年1月12日
最初の投稿 (実際)
2021年1月15日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2023年3月20日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2023年3月17日
最終確認日
2023年3月1日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
PGT-A / niPGT-Aの臨床試験
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Igenomix完了
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Igenomix募集
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King's College LondonGuy's and St Thomas' NHS Foundation Trust募集