Icke-invasiv preimplantationsgenetisk testning för aneuploidier med användning av cellfritt DNA i förbrukade odlingsmedier (niPGT-A)
Icke-invasiv preimplantationsgenetisk testning för aneuploidier (niPGT-A) - Utvärdering av analysen av cellfritt DNA i använt kulturmedium
Analys av embryonalt cellfritt DNA (cfDNA) som finns i det använda odlingsmediet (SCM) är ett icke-invasivt alternativ för preimplantationsgenetisk testning för aneuploidier (PGT-A) som undviker de tekniska utmaningarna och begränsningarna av biopsi. Initiala studier som undersökte denna icke-invasiva PGT-A (niPGT-A) metod rapporterade variabel överensstämmelse mellan cfDNA i SCM och trophectoderm provet (~ 30%-86%) och indikerade ett bidrag från både den inre cellmassan och trophectoderm till cfDNA:t i SCM.
Denna studie syftar till att utvärdera användningen av embryoodlingsmediet som en källa till genetiskt material för PGT-A och validera ett niPGT-A-protokoll med cfDNA i SCM.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Flera studier har visat förmågan att detektera och amplifiera cfDNA från SCM, i olika stadier av embryonal utveckling, med varierande takt av amplifieringsframgång. Skillnader i analyter, tidpunkt för insamling av SCM och embryokulturens varaktighet inom det insamlade mediet, prestanda för assisterad kläckning (AH), helgenomförstärkningsmetoder, omfattande kromosomscreeningsmetoder och nästa generations sekvenseringsplattformar (NGS), bioinformatiska analyser och strategier för identifiering av maternell kontaminering bidrar alla till den ultimata prestandan av niPGT-A.
Denna studie syftar till att validera en icke-invasiv PGT-A (niPGT-A) metod som använder cfDNA frisatt från den mänskliga blastocysten till SCM.
Patienter som genomgår en fertilitetsbehandling med PGT-A på grund av sekundär infertilitet kommer att rekryteras. På dag 6 efter befruktningen kommer SCM att samlas in före blastocystbiopsi. SCM kasseras normalt i detta skede. Trophectoderm biopsi och provtagning kommer att följa IVF-laboratoriets standardpraxis för klinisk PGT-A.
Tre aneuploidiscreening-kit, som bygger på olika helgenom-amplifieringsmetoder följt av NGS på Ion GeneStudio™ S5 Prime System (ThermoFisher Scientific), kommer att jämföras. Överensstämmelsen mellan cfDNA och trophectoderm biopsier kommer att utvärderas för cirka 150 blastocyster med det bäst presterande niPGT-A-protokollet.
Urval av embryon för överföring kommer att baseras enbart på PGT-A-resultatet från de biopsierade cellerna. Patientens IVF+PGT-A behandlingsplan och tidslinje kommer inte att ändras.
Studietyp
Kontakter och platser
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Patienter som genomgår fertilitetsbehandling med PGT-A (rekombinant FSH-antagonistprotokoll med dubbel trigger)
- Sekundär infertilitet
- BMI 18- 35 kg/m2
- Spermier: färska ejakulerade spermier (abstinens: 2-3 dagar)
- Minst en blastocyst biopsierad dag 6
Exklusions kriterier:
- Högt progesteron på triggerdagen (>1,5 ng/ml)
- Förglasade oocyter
- Frysta spermier
- Indikationer för PGT-SR och PGT-M
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Blivande
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Två typer av prover (TE och SCM) kommer att samlas in för alla blastocyster som ingår i studien
|
PGT-A och niPGT-A kommer att utföras med hjälp av nästa generations sekvenseringsanalys (NGS) för kromosomkopietalsvariation (CNV).
Embryoöverföringar kommer enbart att förlita sig på resultaten av PGT-A för trophectoderm biopsier.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Allmän överensstämmelse mellan resultat för cfDNA i SCM och trophectoderm biopsier
Tidsram: 4 månader
|
Allmän ploidikonkordanshastighet: antal matchade (euploid-euploida eller aneuploid-aneuploida) resultat/totalt antal cfDNA-prover med ett resultat
|
4 månader
|
|
Diskordans per kromosom mellan resultat för cfDNA i SCM och trophectoderm biopsier
Tidsram: 4 månader
|
Diskordans per kromosom: antal felidentifierade kromosomfel/24*totalt antal embryon med cfDNA-resultat
|
4 månader
|
|
Överensstämmelse per kromosom mellan resultat för cfDNA i SCM och trophectoderm
Tidsram: 4 månader
|
Kromosomfelsöverensstämmelse: antal korrekt identifierade kromosomfel/totalt antal upptäckta kromosomfel
|
4 månader
|
|
Känslighet för niPGT-A med användning av cfDNA i SCM
Tidsram: 4 månader
|
Falsk negativ frekvens: 1- (sant euploid resultat/totalt antal prover med ett resultat)
|
4 månader
|
|
Specificitet för niPGT-A med användning av cfDNA i SCM
Tidsram: 4 månader
|
Falskt positiv frekvens: 1- (sant aneuploid resultat/totalt antal prover med resultat)
|
4 månader
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Graviditetsutfall för patienter med embryoöverföring - Implantationshastighet
Tidsram: 12 månader
|
Implantationshastighet = antal graviditetssäckar observerade vid ekografisk screening vid 6 graviditetsveckor / antal överförda embryon
|
12 månader
|
|
Graviditetsutfall för patienter som har en embryoöverföring - Biokemisk graviditetsfrekvens
Tidsram: 12 månader
|
Biokemisk graviditetsfrekvens = positivt βhCG-test på > 15IU men inget fosterhjärtslag / graviditetspåse vid ultraljudsundersökning
|
12 månader
|
|
Graviditetsutfall för patienter som har en embryoöverföring - Klinisk graviditetsfrekvens
Tidsram: 12 månader
|
Klinisk graviditetsfrekvens (%) definierad av positivt βhCG-test och ultraljudsbekräftelse av graviditetssäck eller hjärtslag
|
12 månader
|
|
Graviditetsutfall för patienter som har en embryoöverföring - Antal missfall
Tidsram: 12 månader
|
Missfallsfrekvens (%) definieras av ultraljudsvisualisering av en eller flera graviditetssäckar, inklusive ektopiska graviditeter, med spontan graviditetsförlust före 20 veckor
|
12 månader
|
|
Graviditetsutfall för patienter som har en embryoöverföring - Klinisk graviditetsfrekvens
Tidsram: 12 månader
|
Pågående graviditetsfrekvens (över 20 veckor)
|
12 månader
|
|
Graviditetsutfall för patienter som har en embryoöverföring - Frekvens för implantationsfel
Tidsram: 12 månader
|
Implantationsfel (%)
|
12 månader
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Utredare
- Huvudutredare: Souraya Jaroudi, ART Fertility Clinics
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Shamonki MI, Jin H, Haimowitz Z, Liu L. Proof of concept: preimplantation genetic screening without embryo biopsy through analysis of cell-free DNA in spent embryo culture media. Fertil Steril. 2016 Nov;106(6):1312-1318. doi: 10.1016/j.fertnstert.2016.07.1112. Epub 2016 Aug 24.
- Feichtinger M, Vaccari E, Carli L, Wallner E, Madel U, Figl K, Palini S, Feichtinger W. Non-invasive preimplantation genetic screening using array comparative genomic hybridization on spent culture media: a proof-of-concept pilot study. Reprod Biomed Online. 2017 Jun;34(6):583-589. doi: 10.1016/j.rbmo.2017.03.015. Epub 2017 Mar 28.
- Rubio C, Navarro-Sanchez L, Garcia-Pascual CM, Ocali O, Cimadomo D, Venier W, Barroso G, Kopcow L, Bahceci M, Kulmann MIR, Lopez L, De la Fuente E, Navarro R, Valbuena D, Sakkas D, Rienzi L, Simon C. Multicenter prospective study of concordance between embryonic cell-free DNA and trophectoderm biopsies from 1301 human blastocysts. Am J Obstet Gynecol. 2020 Nov;223(5):751.e1-751.e13. doi: 10.1016/j.ajog.2020.04.035. Epub 2020 May 26.
- Fang R, Yang W, Zhao X, Xiong F, Guo C, Xiao J, Chen L, Song X, Wang H, Chen J, Xiao X, Yao B, Cai LY. Chromosome screening using culture medium of embryos fertilised in vitro: a pilot clinical study. J Transl Med. 2019 Mar 8;17(1):73. doi: 10.1186/s12967-019-1827-1.
- Huang L, Bogale B, Tang Y, Lu S, Xie XS, Racowsky C. Noninvasive preimplantation genetic testing for aneuploidy in spent medium may be more reliable than trophectoderm biopsy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 9;116(28):14105-14112. doi: 10.1073/pnas.1907472116. Epub 2019 Jun 24.
- Capalbo A, Romanelli V, Patassini C, Poli M, Girardi L, Giancani A, Stoppa M, Cimadomo D, Ubaldi FM, Rienzi L. Diagnostic efficacy of blastocoel fluid and spent media as sources of DNA for preimplantation genetic testing in standard clinical conditions. Fertil Steril. 2018 Oct;110(5):870-879.e5. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.05.031. Erratum In: Fertil Steril. 2019 Jan;111(1):194.
- Ho JR, Arrach N, Rhodes-Long K, Ahmady A, Ingles S, Chung K, Bendikson KA, Paulson RJ, McGinnis LK. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos. Fertil Steril. 2018 Aug;110(3):467-475.e2. doi: 10.1016/j.fertnstert.2018.03.036. Epub 2018 Jun 28.
- Kuznyetsov V, Madjunkova S, Antes R, Abramov R, Motamedi G, Ibarrientos Z, Librach C. Evaluation of a novel non-invasive preimplantation genetic screening approach. PLoS One. 2018 May 10;13(5):e0197262. doi: 10.1371/journal.pone.0197262. eCollection 2018.
- Vera-Rodriguez M, Diez-Juan A, Jimenez-Almazan J, Martinez S, Navarro R, Peinado V, Mercader A, Meseguer M, Blesa D, Moreno I, Valbuena D, Rubio C, Simon C. Origin and composition of cell-free DNA in spent medium from human embryo culture during preimplantation development. Hum Reprod. 2018 Apr 1;33(4):745-756. doi: 10.1093/humrep/dey028.
- Xu J, Fang R, Chen L, Chen D, Xiao JP, Yang W, Wang H, Song X, Ma T, Bo S, Shi C, Ren J, Huang L, Cai LY, Yao B, Xie XS, Lu S. Noninvasive chromosome screening of human embryos by genome sequencing of embryo culture medium for in vitro fertilization. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11907-11912. doi: 10.1073/pnas.1613294113. Epub 2016 Sep 29.
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Faktisk)
Avslutad studie (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 2010-ABU-011-SJ
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .