Om oral og tarmmikrobiota på intensivavdelingen: SARS-CoV-2 (COVID-19) infeksjonspåvirkning. (CO-MIC)

Tarmmikrobiota hos ICU-pasienter er sårt forvrengt, det er et betydelig tap av mangfold som kan forårsakes av en reduksjon av kommensale bakterier og en økning av patogener. Virulensen, smitteevnen og overførbarheten til det nye SARS-Coronavirus 2 er en grunn for oss til å finne strategier og terapier for å dempe epidemien. Tarmslimhinnen er sannsynligvis et mål for viruset, og det virker sannsynlig at avføring er en måte å overføres på. Det antar også at tarmmikrobiota er mer forvitret hos pasienter med en SARS-CoV-2-infeksjon, dessuten hvis de må legges inn på intensivavdeling. Av denne grunn ønsker denne studien å samle inn oral og rektal vattpinne fra pasienter innlagt på ICU for en alvorlig SARS-CoV-2-infeksjon og fra pasienter innlagt på ICU av en annen grunn som en SARS-CoV-2-infeksjon på dag 1, hver 7. dag og ved slutten av intensivoppholdet. Andre mål er å vite om denne forvrengte mikrobiotaen er en risikofaktor for dårlige utfall hos våre ICU-pasienter, om antibiotika og kunstig ernæring er for en risikofaktor for forvitret mikrobiota og til slutt om vi kan koble oral og rektal dysbiose for å bruke oral dysbiose til forutsi rektal dysbiose med tanke på hvor enkelt det er å samle oral prøve.