Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Pilotstudie av rask helgenomsekvensering av alvorlig syke pasienter i pediatrisk intensivbehandling i Belgia (rWGS_v3)

19. april 2022 oppdatert av: AIME LUMAKA, Centre Hospitalier Universitaire de Liege

Étude Pilote du Séquençage Rapide du génome Humain Des Patients sévèrement Malades Dans Les Soins Intensifs en pédiatrie

Prospektiv, multi-site, ikke-randomisert (enarms) studie for å evaluere gjennomførbarheten, utbyttet og den kliniske nytten av trio WGS hos 30 kritisk syke pasienter på neonatologiske intensivavdelinger (NICU) og pediatriske intensivavdelinger (PICU) i Belgia . Resultatene forventes å bli returnert innen 7 dager etter mottak av blodprøver i laboratoriet. Primært utfall vil bli evaluert etter klinisk tolkning, mens sekundært utfall vil bli evaluert fra den kliniske nytteundersøkelsen som skal fullføres av kliniske genetikere.

Studieoversikt

Status

Rekruttering

Forhold

Detaljert beskrivelse

Dette er en prospektiv, multi-site, ikke-randomisert (enarms) studie for å evaluere gjennomførbarheten, utbyttet og den kliniske nytten av trio WGS hos kritisk syke pasienter på neonatologiske intensivavdelinger (NICU) og pediatriske intensivavdelinger (PICU) i Belgia. Hver proband som svarer på våre kvalifikasjonskriterier vil motta en trio WGS.

Blodprøver fra registrerte probander og deres foreldre vil bli samlet inn og sendt til Laboratoire de Génétique Humaine, University of Liège, Liège, Belgia, som er et forskningsanlegg. Blodprøver vil bli lysert med Illumina Lysis Kit. Lysis-produktet vil bli brukt til bibliotekpreparering med Illumina DNA PCR-Free Prep, Tagmentation Library preparering kit og IDT® for Illumina® DNA/RNA Unique Dual Indexes Set A, Tagmentation. Samlede biblioteker vil bli sekvensert på en NovaSeq 6000. Sekvenseringsdata vil automatisk overføres til Cloud Space (BaseSpace Sequence Hub) der primær bioinformatisk analyse vil bli utført etter fullføring av sekvensering og dataoverføring. Annoterte variantanropsfiler for SNV-er og CNV-er vil bli analysert med Moon (Invitae) og interne bioinformatiske analyseløsninger. Klinisk tolkning vil bli utført av hovedutforsker.

WGS-resultater ble formidlet til barnelege. Den kliniske nytteundersøkelsen ble fylt ut av kliniske genetikere minst en måned etter returnering av sekvenseringsresultater.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

30

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

  • Navn: VINCENT BOURS, MD, PhD
  • Telefonnummer: +3243668144
  • E-post: vbours@uliege.be

Studiesteder

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

1 dag til 18 år (Barn, Voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Alle kritisk syke nyfødte av pediatriske pasienter innlagt på intensivavdelinger ved de deltakende institusjonene i løpet av studieperioden.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • minst to store misdannelser som involverer to forskjellige systemer

  • En spesifikk misdannelse som sterkt tyder på en genetisk etiologi, inkludert, men ikke begrenset til, noen av følgende abnormiteter:

    • Choanal atresi,
    • Coloboma,
    • Hirschsprungs sykdom,
    • Meconium ileus (unntatt ved prematuritet),
    • Agenese av corpus callosum eller Lissencephaly

  • En unormal laboratorietest som antyder en genetisk sykdom eller en kompleks metabolsk fenotype, inkludert men ikke begrenset til noen av følgende:

    • Konvensjonell unormal neonatal screening
    • Konjugert hyperbilirubinemi som ikke skyldes total foreldreernæring (TPN) kolestase
    • Hyperammonemi
    • Laktacidose skyldes ikke dårlig perfusjon
    • Refraktær eller alvorlig hypoglykemi

  • En unormal respons på standardbehandling for en alvorlig underliggende tilstand

    • Betydelig hypotoni
    • Vedvarende anfall

  • Spedbarn med høyrisikostratifisering ved vurdering av en Brief Resolved Unexplained Event (BRUE) med noen av følgende funksjoner:

    • Tilbakevendende hendelser uten luftveisinfeksjon
    • Gjentatte anfall observert
    • Uforklarlig hjerte-lungeredning (HLR) er nødvendig
    • Betydelig unormal biokjemisk status, inkludert men ikke begrenset til elektrolytter, bikarbonat eller melkesyre, venøse blodgasser, glukose eller andre tester som tyder på en medfødt metabolismefeil
  • Betydelig unormalt elektrokardiogram (EKG), inkludert men ikke begrenset til mulige kanalopatier, arytmier, kardiomyopatier, myokarditt eller strukturell hjertesykdom

  • Positiv familiehistorie med:

    • Arytmi
    • BRUE på broren
    • Utviklingsforsinkelse / mental retardasjon
    • Medfødt stoffskiftefeil eller genetisk sykdom uten genetisk diagnose
    • Langt QT-syndrom (LQTS)
    • Plutselig uforklarlig død (inkludert uforklarlig bilulykke eller drukning) hos første- eller andregradsslektninger før 35 år, og spesielt som spedbarn.

Ekskluderingskriterier:

  • En infeksjon med normal respons på behandlingen
  • En bekreftet genetisk diagnose som forklarer sykdommen
  • Hypoksisk iskemisk encefalopati (HIE) med en tydelig utløsende hendelse
  • Isolert prematuritet
  • Isolert forbigående takypné hos nyfødte (TTN)
  • Isolert ukonjugert hyperbilirubinemi
  • Ikke-levedyktige nyfødte
  • Entitet av multifaktoriell årsak eller ukjent genetisk årsak, inkludert men ikke begrenset til noen av følgende: Sekvens av fostervannsbånd, isolert Pierre Robin-sekvens, Spina bifida

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Observasjonsmodeller: Bare etui
  • Tidsperspektiver: Potensielle

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Diagnostisk utbytte
Tidsramme: 7 dager
# molekylær diagnostikk / totalt antall probander i prosent
7 dager
Omløpstid
Tidsramme: En uke
Gjennomsnittlig tid (i timer) fra prøvemottak i laboratoriet til elektronisk signatur på testrapporten.
En uke

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Korrelasjon med klinisk diagnostikk
Tidsramme: en uke
Prosentandel av klinisk diagnostikk bekreftet av WGS-testingen
en uke
Veiledning til sykdomshåndtering
Tidsramme: En måned etter at resultatene er returnert
Prosentandel av pasienter der sykdomsbehandlingsplanen ble justert basert på resultatene av WGS
En måned etter at resultatene er returnert

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Centre Hospitalier Universitaire de Liege

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: AIME LUMAKA, MD, PhD, Centre Hospitalier Universitaire de Liege

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

8. februar 2021

Primær fullføring (Forventet)

1. desember 2022

Studiet fullført (Forventet)

1. desember 2022

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

14. april 2022

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

14. april 2022

Først lagt ut (Faktiske)

20. april 2022

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

26. april 2022

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

19. april 2022

Sist bekreftet

1. april 2022

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • 2020/143

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

Nei

IPD-planbeskrivelse

Avidentifisert og kurert variant og begrenset fenotypeinformasjon vil bli sendt til ClinVar. ClinVar er et fritt tilgjengelig, offentlig arkiv med rapporter om forholdet mellom menneskelige genomiske variasjoner og kliniske fenotyper som er vert for National Center for Biotechnology Information (NCBI) og finansiert av Intramural National Institutes of Health (NIH) finansiering. Ingen personlig helseinformasjon (PHI) eller informasjon som identifiserer deltakeren eller familien vil bli sendt inn.

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere