Pilotní studie rychlého sekvenování celého genomu těžce nemocných pacientů v pediatrické intenzivní péči v Belgii (rWGS_v3)
Étude Pilote du Séquençage Rapide du génome Humain Des Pacienti sévèrement Malades Dans Les Soins Intensifs en pédiatrie
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Toto je prospektivní, vícemístná, nerandomizovaná (jednoramenná) studie k vyhodnocení proveditelnosti, výtěžnosti a klinické užitečnosti trio WGS u kriticky nemocných pacientů na neonatologických jednotkách intenzivní péče (NICU) a dětských jednotkách intenzivní péče (PICU). v Belgii. Každý proband, který splní naše kritéria způsobilosti, obdrží trojici WGS.
Vzorky krve od zapsaných probandů a jejich rodičů budou odebrány a odeslány do Laboratoire de Génétique Humaine, University of Liège, Lutych, Belgie, což je výzkumné zařízení. Vzorky krve budou lyžovány pomocí soupravy Illumina Lysis Kit. Produkt lýzy bude použit pro přípravu knihovny s přípravou Illumina DNA PCR-Free Prep, soupravou pro přípravu knihovny Tagmentation a IDT® for Illumina® DNA/RNA Unique Dual Indexes Set A, Tagmentation. Sdružené knihovny budou sekvenovány na NovaSeq 6000. Sekvenační data budou automaticky přenesena do Cloud Space (BaseSpace Sequence Hub), kde bude po dokončení sekvenování a přenosu dat provedena primární bioinformatická analýza. Anotované soubory volání variant pro SNV a CNV budou analyzovány pomocí Moon (Invitae) a interních řešení bioinformatické analýzy. Klinickou interpretaci provede hlavní zkoušející.
Výsledky WGS byly sděleny pediatrovi. Průzkum klinické užitečnosti vyplnili kliničtí genetici nejméně měsíc po návratu výsledků sekvenování.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: AIME LUMAKA, MD, PhD
- Telefonní číslo: +3243664720
- E-mail: aime.lumaka@uliege.be
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: VINCENT BOURS, MD, PhD
- Telefonní číslo: +3243668144
- E-mail: vbours@uliege.be
Studijní místa
-
-
-
Liège, Belgie, 4000
- Nábor
- Centre Hospitalier Regional de la Citadelle
-
Kontakt:
- Vincent Rigo, MD, PhD
- Telefonní číslo: +3243674585
- E-mail: vincent.rigo@chuliege.be
-
Kontakt:
- Serpil Alkan, MD
- E-mail: serpil.alkan@chuliege.be
-
Liège, Belgie, 4000
- Nábor
- CHC Mont-Légia
-
Kontakt:
- André Mulder, MD
- E-mail: ANDRE.MULDER@CHC.BE
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- alespoň dvě hlavní malformace zahrnující dva různé systémy
Specifická malformace vysoce naznačující genetickou etiologii, včetně, ale bez omezení na kteroukoli z následujících abnormalit:
- Choanální atrézie,
- koloboma,
- Hirschsprungova choroba,
- Mekoniový ileus (kromě nedonošených),
- Ageneze corpus callosum nebo Lissencephaly
Abnormální laboratorní test naznačující genetické onemocnění nebo komplexní metabolický fenotyp, včetně, ale bez omezení na kterékoli z následujících:
- Konvenční abnormální novorozenecký screening
- Konjugovaná hyperbilirubinémie není způsobena cholestázou celkové rodičovské výživy (TPN).
- Hyperamonémie
- Laktátová acidóza není způsobena špatnou perfuzí
- Refrakterní nebo těžká hypoglykémie
Abnormální odpověď na standardní léčbu závažného základního onemocnění
- Výrazná hypotonie
- Přetrvávající záchvaty
Kojenec s vysoce rizikovou stratifikací na základě posouzení BRUE (Brick Resolved Unexplained Event) s některou z následujících funkcí:
- Opakující se příhody bez respirační infekce
- Byly pozorovány opakované záchvaty
- Je nutná nevysvětlitelná kardiopulmonální resuscitace (KPR).
- Významně abnormální biochemický stav, včetně, ale bez omezení, elektrolytů, hydrogenuhličitanu nebo kyseliny mléčné, plynů z žilní krve, glukózy nebo jiných testů naznačujících vrozenou poruchu metabolismu
- Významně abnormální elektrokardiogram (EKG), včetně, ale bez omezení na, možných kanálopatií, arytmií, kardiomyopatií, myokarditidy nebo strukturálního onemocnění srdce
Pozitivní rodinná anamnéza:
- Arytmie
- BRUE u bratra
- Opožděný vývoj / mentální retardace
- Vrozená chyba metabolismu nebo genetické onemocnění bez genetické diagnózy
- Syndrom dlouhého QT (LQTS)
- Náhlá nevysvětlitelná smrt (včetně nevysvětlitelné autonehody nebo utonutí) u příbuzných prvního nebo druhého stupně před dosažením věku 35 let, a zejména v kojeneckém věku.
Kritéria vyloučení:
- Infekce s normální odpovědí na léčbu
- Potvrzená genetická diagnóza vysvětlující nemoc
- Hypoxická ischemická encefalopatie (HIE) s jasnou vyvolávající událostí
- Izolovaná nedonošenost
- Izolovaná přechodná tachypnoe novorozence (TTN)
- Izolovaná nekonjugovaná hyperbilirubinémie
- Neživotaschopní novorozenci
- Entita multifaktoriální příčiny nebo neznámé genetické příčiny, včetně, ale bez omezení na kteroukoli z následujících: sekvence amniotických pruhů, izolovaná sekvence Pierre Robin, Spina bifida
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Pouze případ
- Časové perspektivy: Budoucí
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Diagnostický výnos
Časové okno: 7 dní
|
Počet molekulárně diagnostických / celkový počet probandů v procentech
|
7 dní
|
|
Doba obratu
Časové okno: Týden
|
Průměrná doba (v hodinách) od příjmu vzorku v laboratoři po elektronický podpis protokolu o zkoušce.
|
Týden
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Korelace s klinickou diagnostikou
Časové okno: týden
|
Procento klinické diagnostiky potvrzené testováním WGS
|
týden
|
|
Návod k léčbě nemocí
Časové okno: Měsíc po vrácení výsledků
|
Procento pacientů, u kterých byl plán managementu onemocnění upraven na základě výsledků WGS
|
Měsíc po vrácení výsledků
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: AIME LUMAKA, MD, PhD, Centre hospitalier universitaire de Liege
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 2020/143
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Vzácná onemocnění
-
Istituto Ortopedico GaleazziDokončenoBolest | Spát | Komplikace artroplastiky | Hospitalizace | RARItálie