Kísérleti tanulmány a súlyosan beteg betegek gyors teljes genomszekvenálásáról a gyermek intenzív ellátásban Belgiumban (rWGS_v3)
Étude Pilote du Séquençage Rapide du génome Humain Des Patients sévèrement Malades Dans Les Soins Intensifs en pédiatrie
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Részletes leírás
Ez egy prospektív, több helyszínre kiterjedő, nem randomizált (egyágú) vizsgálat a trió WGS megvalósíthatóságának, hozamának és klinikai hasznosságának értékelésére kritikus állapotú betegeknél az újszülöttgyógyászati intenzív osztályokon (NICU) és a gyermek intenzív osztályokon (PICU) Belgiumban. Minden alkalmassági kritériumunknak megfelelő proband trió WGS-t kap.
A beiratkozott probandáktól és szüleiktől származó vérmintákat összegyűjtik, és a Laboratoire de Génétique Humaine-hez, a Liège-i Egyetemhez (Liège, Belgium) szállítják, amely egy kutatóintézet. A vérmintákat az Illumina Lysis Kit segítségével lizálják. A lízisterméket az Illumina DNA PCR-mentes preparátummal, a címkézési könyvtár-előkészítő készlettel és az IDT® for Illumina® DNA/RNS Unique Dual Indexes Set A, Tagmentation eszközeivel a könyvtár-előkészítéshez használjuk. Az összevont könyvtárak NovaSeq 6000-en lesznek szekvenálva. A szekvenálási adatok automatikusan átkerülnek a Cloud Space-be (BaseSpace Sequence Hub), ahol az elsődleges bioinformatikai elemzést a szekvenálás és az adatátvitel befejezése után végzik el. Az SNV-k és CNV-k kommentált változat-hívó fájljait Moon (Invitae) és házon belüli bioinformatikai elemzési megoldásokkal elemezzük. A klinikai interpretációt a vizsgálatvezető végzi.
A WGS eredményeit közölték a gyermekorvossal. A klinikai hasznossági felmérést klinikai genetikusok töltötték ki legalább egy hónappal a szekvenálási eredmények visszaérkezése után.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Várható)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: AIME LUMAKA, MD, PhD
- Telefonszám: +3243664720
- E-mail: aime.lumaka@uliege.be
Tanulmányozza a kapcsolattartók biztonsági mentését
- Név: VINCENT BOURS, MD, PhD
- Telefonszám: +3243668144
- E-mail: vbours@uliege.be
Tanulmányi helyek
-
-
-
Liège, Belgium, 4000
- Toborzás
- Centre Hospitalier Régional de la Citadelle
-
Kapcsolatba lépni:
- Vincent Rigo, MD, PhD
- Telefonszám: +3243674585
- E-mail: vincent.rigo@chuliege.be
-
Kapcsolatba lépni:
- Serpil Alkan, MD
- E-mail: serpil.alkan@chuliege.be
-
Liège, Belgium, 4000
- Toborzás
- CHC Mont-Légia
-
Kapcsolatba lépni:
- André Mulder, MD
- E-mail: ANDRE.MULDER@CHC.BE
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
Egészséges önkénteseket fogad
Tanulmányozható nemek
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
Leírás
Bevételi kritériumok:
- legalább két jelentős fejlődési rendellenesség két különböző rendszert érint
Egy specifikus malformáció, amely erősen utal genetikai etiológiára, beleértve, de nem kizárólagosan, a következő rendellenességek bármelyikét:
- Choanal atresia,
- Coloboma,
- Hirschsprung-kór,
- Meconium ileus (kivéve koraszülöttség esetén),
- A corpus callosum vagy Lissencephaly genezise
Rendellenes laboratóriumi vizsgálat, amely genetikai betegségre vagy összetett metabolikus fenotípusra utal, beleértve, de nem kizárólagosan a következők bármelyikét:
- Hagyományos kóros újszülöttkori szűrés
- Konjugált hiperbilirubinémia, amely nem a teljes szülői táplálkozás (TPN) cholestasis következménye
- Hyperammonemia
- A tejsavas acidózis nem a rossz perfúzió miatt
- Refrakter vagy súlyos hipoglikémia
Rendellenes válasz egy fő alapbetegség szokásos kezelésére
- Jelentős hipotónia
- Tartós rohamok
Csecsemő, aki magas kockázatú rétegzettséggel rendelkezik egy rövid, megoldatlan megmagyarázhatatlan esemény (BRUE) értékelése során, és az alábbi jellemzők bármelyikével rendelkezik:
- Ismétlődő események légúti fertőzés nélkül
- Ismétlődő rohamok figyelhetők meg
- Megmagyarázhatatlan kardiopulmonális újraélesztés (CPR) szükséges
- Jelentősen rendellenes biokémiai állapot, beleértve, de nem kizárólagosan az elektrolitokat, a bikarbonátot vagy a tejsavat, a vénás vérgázokat, a glükózt vagy más, veleszületett anyagcsere-hibára utaló teszteket
- Jelentősen kóros elektrokardiogram (EKG), beleértve, de nem kizárólagosan az esetleges csatornapátiákat, arrhythmiákat, kardiomiopátiákat, szívizomgyulladást vagy strukturális szívbetegséget
Pozitív családi anamnézis:
- Szívritmuszavar
- BRUE a testvérnél
- Fejlődési késés/mentális retardáció
- Veleszületett anyagcsere-hiba vagy genetikai betegség genetikai diagnózis nélkül
- Hosszú QT-szindróma (LQTS)
- Hirtelen, megmagyarázhatatlan haláleset (beleértve a megmagyarázhatatlan autóbalesetet vagy fulladást is) első vagy másodfokú rokonoknál 35 éves kor előtt, különösen csecsemőkorban.
Kizárási kritériumok:
- Fertőzés, amely a kezelésre normálisan reagál
- Megerősített genetikai diagnózis, amely megmagyarázza a betegséget
- Hypoxiás ischaemiás encephalopathia (HIE), egyértelműen kiváltó eseménnyel
- Izolált koraszülöttség
- Újszülött izolált átmeneti tachypneája (TTN)
- Izolált, nem konjugált hiperbilirubinémia
- Életképtelen újszülöttek
- Többtényezős ok vagy ismeretlen genetikai ok entitása, beleértve, de nem kizárólagosan, a következők bármelyikét: magzatvíz sávok szekvenciája, izolált Pierre Robin szekvencia, Spina bifida
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
- Megfigyelési modellek: Csak esetre
- Időperspektívák: Leendő
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Diagnosztikai hozam
Időkeret: 7 nap
|
Molekuláris diagnosztika / próbák összes száma százalékban
|
7 nap
|
|
Átfutási idő
Időkeret: Egy hét
|
A minta laboratóriumi átvételétől a vizsgálati jegyzőkönyv elektronikus aláírásáig eltelt átlagos idő (órában).
|
Egy hét
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Összefüggés a klinikai diagnosztikával
Időkeret: egy hét
|
A WGS-teszttel megerősített klinikai diagnosztika százalékos aránya
|
egy hét
|
|
Útmutató a betegség kezeléséhez
Időkeret: Egy hónappal az eredmények visszaadása után
|
Azon betegek százalékos aránya, akiknél a betegségkezelési tervet a WGS eredményei alapján módosították
|
Egy hónappal az eredmények visszaadása után
|
Együttműködők és nyomozók
Nyomozók
- Kutatásvezető: AIME LUMAKA, MD, PhD, Centre Hospitalier Universitaire de Liege
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Elsődleges befejezés (Várható)
A tanulmány befejezése (Várható)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
Kulcsszavak
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 2020/143
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
IPD terv leírása
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .