Pilotundersøgelse af hurtig helgenom-sekventering af svært syge patienter i pædiatrisk intensiv pleje i Belgien (rWGS_v3)
Étude Pilote du Séquençage Rapide du génome Humain Des Patients sévèrement Malades Dans Les Soins Intensifs en pédiatrie
Studieoversigt
Status
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Dette er en prospektiv, multi-site, ikke-randomiseret (enkeltarm) undersøgelse for at evaluere gennemførligheden, udbyttet og den kliniske nytte af trio WGS hos kritisk syge patienter på neonatologiske intensivafdelinger (NICU) og pædiatriske intensivafdelinger (PICU) i Belgien. Hver proband, der reagerer på vores berettigelseskriterier, vil modtage en trio WGS.
Blodprøver fra tilmeldte probander og deres forældre vil blive indsamlet og sendt til Laboratoire de Génétique Humaine, University of Liège, Liège, Belgien, som er en forskningsfacilitet. Blodprøver vil blive lyseret ved hjælp af Illumina Lysis Kit. Lysis-produkt vil blive brugt til biblioteksforberedelse med Illumina DNA PCR-frit præparation, tagmenteringsbiblioteksforberedelseskit og IDT® til Illumina® DNA/RNA Unique Dual Indexes Set A, Tagmentation. Poolede biblioteker vil blive sekventeret på en NovaSeq 6000. Sekvenseringsdata vil automatisk blive overført til Cloud Space (BaseSpace Sequence Hub), hvor primær bioinformatisk analyse vil blive udført efter afslutning af sekventering og dataoverførsel. Annoterede variantopkaldsfiler for SNV'er og CNV'er vil blive analyseret med Moon (Invitae) og in-house bioinformatiske analyseløsninger. Klinisk fortolkning vil blive udført af den primære investigator.
WGS resultater blev kommunikeret til børnelægen. Den kliniske nytteundersøgelse blev udfyldt af kliniske genetikere mindst en måned efter returnering af sekventeringsresultater.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: AIME LUMAKA, MD, PhD
- Telefonnummer: +3243664720
- E-mail: aime.lumaka@uliege.be
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: VINCENT BOURS, MD, PhD
- Telefonnummer: +3243668144
- E-mail: vbours@uliege.be
Studiesteder
-
-
-
Liège, Belgien, 4000
- Rekruttering
- Centre Hospitalier Regional de la Citadelle
-
Kontakt:
- Vincent Rigo, MD, PhD
- Telefonnummer: +3243674585
- E-mail: vincent.rigo@chuliege.be
-
Kontakt:
- Serpil Alkan, MD
- E-mail: serpil.alkan@chuliege.be
-
Liège, Belgien, 4000
- Rekruttering
- CHC Mont-Légia
-
Kontakt:
- André Mulder, MD
- E-mail: ANDRE.MULDER@CHC.BE
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- mindst to store misdannelser, der involverer to forskellige systemer
En specifik misdannelse, der i høj grad tyder på en genetisk ætiologi, herunder, men ikke begrænset til, nogen af følgende abnormiteter:
- Choanal atresi,
- Coloboma,
- Hirschsprungs sygdom,
- Meconium ileus (undtagen i tilfælde af præmaturitet),
- Agenese af corpus callosum eller Lissencephaly
En unormal laboratorietest, der tyder på en genetisk sygdom eller en kompleks metabolisk fænotype, herunder, men ikke begrænset til, nogen af følgende:
- Konventionel unormal neonatal screening
- Konjugeret hyperbilirubinæmi skyldes ikke total parental nutrition (TPN) kolestase
- Hyperammonæmi
- Laktacidose skyldes ikke dårlig perfusion
- Refraktær eller svær hypoglykæmi
En unormal reaktion på standardbehandling for en alvorlig underliggende tilstand
- Betydelig hypotoni
- Vedvarende anfald
Spædbarn med højrisiko-stratificering ved vurdering af en Brief Resolved Unexplained Event (BRUE) med nogen af følgende funktioner:
- Tilbagevendende hændelser uden luftvejsinfektion
- Tilbagevendende anfald observeret
- Uforklarlig hjerte-lunge-redning (HLR) påkrævet
- Væsentlig unormal biokemisk status, herunder men ikke begrænset til elektrolytter, bikarbonat eller mælkesyre, venøse blodgasser, glukose eller andre tests, der tyder på en medfødt metabolismefejl
- Signifikant unormalt elektrokardiogram (EKG), inklusive, men ikke begrænset til, mulige kanalopatier, arytmier, kardiomyopatier, myocarditis eller strukturel hjertesygdom
Positiv familiehistorie med:
- Arytmi
- BRUE på broderen
- Udviklingsforsinkelse / mental retardering
- Medfødt fejl i stofskiftet eller genetisk sygdom uden genetisk diagnose
- Langt QT-syndrom (LQTS)
- Pludselig uforklarlig død (herunder uforklarlig bilulykke eller drukning) hos første- eller andengradsslægtninge før 35 års alderen, og især som spædbarn.
Ekskluderingskriterier:
- En infektion med en normal reaktion på behandlingen
- En bekræftet genetisk diagnose, der forklarer sygdommen
- Hypoksisk iskæmisk encefalopati (HIE) med en tydelig udløsende begivenhed
- Isoleret præmaturitet
- Isoleret forbigående takypnø hos den nyfødte (TTN)
- Isoleret ukonjugeret hyperbilirubinæmi
- Ikke-levedygtige nyfødte
- Entitet af multifaktoriel årsag eller ukendt genetisk årsag, inklusive, men ikke begrænset til, nogen af følgende: Sekvens af fostervandsbånd, isoleret Pierre Robin-sekvens, Spina bifida
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kun etui
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Diagnostisk udbytte
Tidsramme: 7 dage
|
# molekylær diagnostisk / totalt antal probander i procent
|
7 dage
|
|
Omløbstid
Tidsramme: En uge
|
Den gennemsnitlige tid (i timer) fra prøvemodtagelse i laboratoriet til testrapportens elektroniske signatur.
|
En uge
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Korrelation med klinisk diagnostik
Tidsramme: en uge
|
Procentdel af klinisk diagnostik bekræftet af WGS-testen
|
en uge
|
|
Vejledning til sygdomshåndtering
Tidsramme: En måned efter, at resultaterne er returneret
|
Procentdel af patienter, hvor sygdomsbehandlingsplanen blev justeret baseret på resultaterne af WGS
|
En måned efter, at resultaterne er returneret
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: AIME LUMAKA, MD, PhD, Centre hospitalier universitaire de Liege
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Forventet)
Studieafslutning (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 2020/143
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Sjældne sygdomme
-
Istituto Ortopedico GaleazziAfsluttetSmerte | Søvn | Artroplastiske komplikationer | Hospitalsindlæggelse | RARItalien