Encellet RNAseq brystkreft (SCRBC)

Trippel negativ brystkreft (TNBC) representerer omtrent 15-20 % av alle brystkrefttilfeller. Funksjonene er mangel på ekspresjon av østrogenreseptor (ER), progesteronreseptor (PR) og human epidermal vekstfaktorreseptor 2 (Her2). TNBC viser en biologisk aggressiv oppførsel og en høy inter- og intra-tumor molekylær heterogenitet som nylig har blitt fremhevet også i enkeltcelle RNAseq (scRNAseq) studier. Pasienter med TNBC har ofte mindre positive utfall enn andre undertyper av brystkreft, på grunn av fraværet av spesifikke terapeutiske mål.

Resultater av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNAseq) i TNBC før og etter behandling med kjemoterapi (NAC) ble nylig rapportert for en liten gruppe pasienter. Genetiske endringer blir også undersøkt av Whole Exome Sequencing (WES).

I tillegg bekreftet scRNAseq-analyse tilstedeværelsen av en høy prosentandel av M2-makrofager i TNBC og tumortilstøtende vev. Disse makrofagene er klinisk relevante og i stand til å forutsi utfall i TNBC.

Basert på bevisene ovenfor, antar vi at molekylær karakterisering av vedvarende tumorceller som er igjen etter NAC og infiltrerende immunceller, for eksempel M2-makrofager, kan sterkt bidra til å identifisere målrettede terapeutiske tilnærminger for denne sykdommen.

Vi vil gjennomføre en pilotstudie med et kombinert retrospektivt og prospektivt observasjonsdesign.

Kreftpasienter diagnostisert med histologisk bevist primær invasiv brystkreft med stadium IIA til IIIB og vurdert på molekylært nivå og definert som TNBC, vil være kvalifisert til å delta i studien. Videre vil kun pasienter med en svulst >1,5 cm i størrelse vurderes, som er seleksjonskriteriet for administrering av neoadjuvant terapi.