Enkeltcellet RNAseq brystkræft (SCRBC)

Triple negativ brystkræft (TNBC) repræsenterer cirka 15-20% af alle brystkræfttilfælde. Dens funktioner er manglende ekspression af østrogenreceptor (ER), progesteronreceptor (PR) og human epidermal vækstfaktor-receptor 2 (Her2). TNBC udviser en biologisk aggressiv adfærd og en høj inter- og intra-tumor molekylær heterogenitet, som for nylig også er blevet fremhævet i enkeltcellede RNAseq (scRNAseq) undersøgelser. Patienter med TNBC har ofte mindre positive resultater end andre undertyper af brystkræft på grund af fraværet af specifikke terapeutiske mål.

Resultater af enkeltcellet RNA-sekventering (scRNAseq) i TNBC før og efter behandling med kemoterapi (NAC) blev for nylig rapporteret for en lille gruppe patienter. Genetiske ændringer undersøges også af Whole Exome Sequencing (WES).

Derudover bekræftede scRNAseq-analyse tilstedeværelsen af ​​en høj procentdel af M2-makrofager i TNBC og tumor-tilstødende væv. Disse makrofager er klinisk relevante og i stand til at forudsige resultatet i TNBC.

Baseret på ovenstående beviser antager vi, at molekylær karakterisering af vedvarende tumorceller, der er tilbage efter NAC og infiltrerende immunceller, for eksempel M2-makrofager, stærkt kunne bidrage til at identificere målrettede terapeutiske tilgange til denne sygdom.

Vi vil gennemføre et pilotstudie med et kombineret retrospektivt og prospektivt observationsdesign.

Kræftpatienter diagnosticeret med histologisk dokumenteret primær invasiv brystkræft med et stadium IIA til IIIB og vurderet på molekylært niveau og defineret som TNBC, vil være berettiget til at deltage i undersøgelsen. Endvidere vil kun patienter med en tumor >1,5 cm i størrelse komme i betragtning, hvilket er selektionskriteriet for administration af neoadjuverende terapi.