Encellig RNAseq bröstcancer (SCRBC)

Trippelnegativ bröstcancer (TNBC) representerar cirka 15-20 % av alla bröstcancerfall. Dess egenskaper är brist på uttryck av östrogenreceptor (ER), progesteronreceptor (PR) och human epidermal tillväxtfaktorreceptor 2 (Her2). TNBC uppvisar ett biologiskt aggressivt beteende och en hög inter- och intratumörmolekylär heterogenitet, vilket nyligen också har belysts i encells RNAseq (scRNAseq) studier. Patienter med TNBC har ofta mindre positiva resultat än andra subtyper av bröstcancer, på grund av frånvaron av specifika terapeutiska mål.

Resultat av encellig RNA-sekvensering (scRNAseq) i TNBC före och efter behandling med kemoterapi (NAC) rapporterades nyligen för en liten grupp patienter. Genetiska förändringar undersöks också av Whole Exome Sequencing (WES).

Dessutom bekräftade scRNAseq-analys närvaron av en hög andel M2-makrofager i TNBC och tumörangränsande vävnad. Dessa makrofager är kliniskt relevanta och kan förutsäga resultatet i TNBC.

Baserat på ovanstående bevis antar vi att molekylär karakterisering av ihållande tumörceller som finns kvar efter NAC och infiltrerande immunceller, till exempel M2-makrofager, starkt kan bidra till att identifiera riktade terapeutiska metoder för denna sjukdom.

Vi kommer att genomföra en pilotstudie med en kombinerad retrospektiv och prospektiv observationsdesign.

Cancerpatienter som diagnostiserats med histologiskt bevisad primär invasiv bröstcancer med ett stadium IIA till IIIB och bedöms på molekylär nivå och definieras som TNBC, kommer att vara berättigade att delta i studien. Vidare kommer endast patienter med en tumör >1,5 cm i storlek att beaktas, vilket är urvalskriteriet för administrering av neoadjuvant terapi.