Verdien av mNGS i diagnose av lungeinfeksjon

Lungeinfeksjon er en vanlig type luftveisinfeksjon som kan føre til flere komplikasjoner og regnes som den viktigste infeksjonssykdommen på verdensbasis på grunn av dens høye sykelighet og dødelighet. Lungeinfeksjoner, forårsaket av en eller flere patogener som bakterier, virus, sopp og parasitter, er ikke lett å skille klinisk og er blant de 10 beste dødsårsakene på verdensbasis. Derfor er tidlig og nøyaktig identifisering av infeksjonsårsak for pasienter med lungeinfeksjon av stor betydning for etterfølgende behandling og bedring av prognose. For tiden er de viktigste tradisjonelle diagnostiske metodene for lungeinfeksjon mikrobiell kultur, antigen- og antistoffdeteksjon og PCR-nukleinsyredeteksjonsteknologi. Selv om mikrobiell kultur er gullstandarden for mikrobiell identifikasjon, tar det lang tid å oppdage noen virus og parasitter. Følsomheten til antigen- og antistoffdeteksjon er dårlig. PCR-nukleinsyredeteksjonsmetoden har høy sensitivitet og spesifisitet, men den kan ikke oppdage alle patogener som forårsaker lungeinfeksjon. Derfor er det nødvendig å utvikle en rask, praktisk og sensitiv ny deteksjonsteknologi for å oppdage patogenet til lungeinfeksjon. neste generasjons sekvensering (NGS) har fordelen av ingen antagelser og ingen avhengighet av kultur, og kan oppdage alle patogener i kliniske prøver uten skjevhet, og har blitt mye brukt i en rekke infeksjonssykdommer. Denne studien samlet inn grunnleggende informasjon om pasienter mistenkt for lungeinfeksjon i klinikken, og utførte mNGS-deteksjon og rutinemessig patogendeteksjon på forskjellige prøver av henholdsvis alveolar lavage fluid (BALF) og sputum for å evaluere konsistensen av mNGS-deteksjon og rutinedeteksjon og positiv patogendeteksjonsrate, samt den kliniske bruksverdien av mNGS-deteksjon.

Denne studien analyserte retrospektivt 50 pasienter innlagt på sykehuset vårt fra januar 2019 til oktober 2019, hvis symptomer, tegn, bildediagnostikk og infeksjonsindikatorer oppfylte de diagnostiske kriteriene for lungeinfeksjon, mens rutinemessig etiologisk påvisning av sputum og pulmonal alveolær skyllevæske mNGS ble utført. .

Kliniske data fra relevante pasienter ble samlet inn, inkludert kjønn, alder, røykestatus, kliniske manifestasjoner, liggetid før mNGS-deteksjon, antibiotikabruk før mNGS-deteksjon, bildeendringer, laboratorieundersøkelse og annen grunnleggende informasjon. Resultatene ble samlet inn fra studiedeltakernes alveolære skyllevæske (BALF), sputum for tradisjonelle patogentester (mikrobiell kultur og PCR-nukleinsyredeteksjonsteknikker) og mNGS-tester. Den positive hastigheten på patogendeteksjon og konsistensen av deteksjonsresultatene til de to deteksjonsmetodene ble sammenlignet.