Värdet av mNGS vid diagnos av lunginfektion

Lunginfektion är en vanlig typ av luftvägsinfektion som kan leda till flera komplikationer och anses vara den viktigaste infektionssjukdomen i världen på grund av dess höga sjuklighet och dödlighet. Lunginfektioner, orsakade av en eller flera patogener som bakterier, virus, svampar och parasiter, är inte lätt att urskilja kliniskt och är bland de tio främsta dödsorsakerna i världen. Därför är tidig och noggrann identifiering av infektionsorsaken för patienter med lunginfektion av stor betydelse för efterföljande behandling och förbättring av prognos. För närvarande är de huvudsakliga traditionella diagnostiska metoderna för lunginfektion mikrobiell odling, antigen- och antikroppsdetektion och PCR-nukleinsyradetektionsteknologi. Även om mikrobiell kultur är guldstandarden för mikrobiell identifiering, tar det lång tid att upptäcka vissa virus och parasiter. Känsligheten för antigen- och antikroppsdetektion är dålig. PCR-nukleinsyradetekteringsmetod har hög sensitivitet och specificitet, men den kan inte detektera alla patogener som orsakar lunginfektion. Därför är det nödvändigt att utveckla en snabb, bekväm och känslig ny detektionsteknik för att upptäcka patogenen för lunginfektion. nästa generations sekvensering (NGS) har fördelen av inga antaganden och inget beroende av odling, och kan upptäcka alla patogener i kliniska prover utan partiskhet, och har använts i stor utsträckning i en mängd olika infektionssjukdomar. Denna studie samlade in grundläggande information om patienter som misstänks för lunginfektion på kliniken, och genomförde mNGS-detektering och rutinmässig patogendetektion på olika prover av alveolär sköljvätska (BALF) respektive sputum för att utvärdera konsistensen av mNGS-detektering och rutindetektion och positiv patogendetekteringshastighet, såväl som det kliniska tillämpningsvärdet för mNGS-detektion.

Denna studie analyserade retrospektivt 50 patienter inlagda på sjukhus på vårt sjukhus från januari 2019 till oktober 2019, vars symtom, tecken, avbildning och infektionsindikatorer uppfyllde de diagnostiska kriterierna för lunginfektion, medan rutinmässig etiologisk upptäckt av sputum och pulmonell alveolär sköljvätska mNGS utfördes .

Kliniska data från relevanta patienter samlades in, inklusive kön, ålder, rökstatus, kliniska manifestationer, vistelsetid före mNGS-detektering, antibiotikaanvändning före mNGS-detektion, bildförändringar, laboratorieundersökning och annan grundläggande information. Resultaten samlades in från studiedeltagarnas alveolära sköljvätska (BALF), sputum för traditionella patogentester (mikrobiella odlingar och PCR-nukleinsyradetektionstekniker) och mNGS-tester. Den positiva frekvensen av patogendetektering och konsekvensen av detektionsresultaten för de två detektionsmetoderna jämfördes.