Az mNGS értéke a tüdőfertőzés diagnosztizálásában

A tüdőfertőzés a légúti fertőzés gyakori típusa, amely többféle szövődményhez vezethet, és magas morbiditása és mortalitása miatt világszerte a legfontosabb fertőző betegségnek számít. Az egy vagy több kórokozó, például baktériumok, vírusok, gombák és paraziták által okozott tüdőfertőzések klinikailag nem könnyen megkülönböztethetők, és világszerte a 10 leggyakoribb halálok közé tartoznak. Ezért a tüdőfertőzésben szenvedő betegek fertőzés okának korai és pontos azonosítása nagy jelentőséggel bír a későbbi kezelés és a prognózis javítása szempontjából. Jelenleg a tüdőfertőzés fő hagyományos diagnosztikai módszerei a mikrobatenyésztés, az antigén- és antitest-detektálás, valamint a PCR nukleinsav kimutatási technológia. Bár a mikrobiális tenyésztés a mikrobiális azonosítás aranystandardja, bizonyos vírusok és paraziták kimutatása sok időt vesz igénybe. Az antigén és antitest kimutatás érzékenysége gyenge. A PCR nukleinsav kimutatási módszer nagy szenzitivitással és specificitással rendelkezik, de nem képes minden tüdőfertőzést okozó kórokozót kimutatni. Ezért szükséges egy gyors, kényelmes és érzékeny új kimutatási technológia kidolgozása a tüdőfertőzés kórokozójának kimutatására. A következő generációs szekvenálás (NGS) előnye, hogy nincsenek feltételezések és nem függ a tenyészettől, és minden kórokozót képes kimutatni a klinikai mintákban torzítás nélkül, és széles körben alkalmazzák számos fertőző betegségben. Ez a tanulmány összegyűjtötte a klinikán tüdőfertőzésre gyanús betegek alapvető információit, és mNGS kimutatást és rutin kórokozó kimutatást végzett különböző alveoláris mosófolyadék (BALF) és köpet mintákon, hogy értékelje az mNGS kimutatás és a rutin kimutatás következetességét, valamint a pozitív kórokozó kimutatási arány, valamint az mNGS kimutatás klinikai alkalmazási értéke.

Ebben a tanulmányban retrospektív módon elemeztük a kórházunkban 2019 januárja és 2019 októbere között kórházban kezelt 50 beteget, akiknek tünetei, jelei, képalkotó és fertőzési mutatói megfeleltek a tüdőfertőzés diagnosztikai kritériumainak, miközben a köpet és a pulmonalis alveoláris mosófolyadék mNGS rutin etiológiai kimutatását végeztük. .

Összegyűjtöttük a releváns betegek klinikai adatait, beleértve a nemet, életkort, dohányzási állapotot, klinikai megnyilvánulásokat, az mNGS kimutatása előtti tartózkodás időtartamát, az mNGS kimutatása előtti antibiotikum-használatot, a képalkotó változásokat, a laboratóriumi vizsgálatokat és egyéb alapvető információkat. Az eredményeket a vizsgálatban résztvevők alveoláris mosófolyadékából (BALF), a hagyományos patogéntesztekhez (mikrobiális tenyészet és PCR nukleinsav kimutatási technikák) és mNGS tesztekhez használt köpetből gyűjtöttük össze. Összehasonlítottam a két kimutatási módszer pozitív kórokozó-detektálási arányát és kimutatási eredményeinek konzisztenciáját.