El valor de la mNGS en el diagnóstico de la infección pulmonar

La infección pulmonar es un tipo común de infección respiratoria que puede derivar en múltiples complicaciones y es considerada la enfermedad infecciosa más importante a nivel mundial debido a su alta morbilidad y mortalidad. Las infecciones pulmonares, causadas por uno o más patógenos como bacterias, virus, hongos y parásitos, no son fácilmente distinguibles clínicamente y se encuentran entre las 10 principales causas de muerte en todo el mundo. Por lo tanto, la identificación temprana y precisa de la causa de la infección en pacientes con infección pulmonar es de gran importancia para el tratamiento posterior y la mejora del pronóstico. En la actualidad, los principales métodos tradicionales de diagnóstico de la infección pulmonar son el cultivo microbiano, la detección de antígenos y anticuerpos y la tecnología de detección de ácidos nucleicos por PCR. Aunque el cultivo microbiano es el estándar de oro para la identificación microbiana, se necesita mucho tiempo para detectar algunos virus y parásitos. La sensibilidad de la detección de antígenos y anticuerpos es pobre. El método de detección de ácido nucleico por PCR tiene una alta sensibilidad y especificidad, pero no puede detectar todos los patógenos que causan la infección pulmonar. Por lo tanto, es necesario desarrollar una nueva tecnología de detección rápida, conveniente y sensible para detectar el patógeno de la infección pulmonar. La secuenciación de próxima generación (NGS) tiene la ventaja de no hacer suposiciones ni depender del cultivo, puede detectar todos los patógenos en muestras clínicas sin sesgos y se ha utilizado ampliamente en una variedad de enfermedades infecciosas. Este estudio recopiló la información básica de pacientes con sospecha de infección pulmonar en la clínica y realizó la detección de mNGS y la detección de patógenos de rutina en diferentes muestras de líquido de lavado alveolar (BALF) y esputo, respectivamente, para evaluar la consistencia de la detección de mNGS y la detección de rutina y la tasa de detección positiva de patógenos, así como el valor de aplicación clínica de la detección de mNGS.

Este estudio analizó retrospectivamente a 50 pacientes hospitalizados en nuestro hospital desde enero de 2019 a octubre de 2019, cuyos síntomas, signos, indicadores de imagen e infecciones cumplían con los criterios diagnósticos de infección pulmonar, mientras se realizaba la detección etiológica de rutina de esputo y líquido de lavado alveolar pulmonar mNGS. .

Se recopilaron datos clínicos de pacientes relevantes, incluido el sexo, la edad, el tabaquismo, las manifestaciones clínicas, la duración de la estadía antes de la detección de mNGS, el uso de antibióticos antes de la detección de mNGS, los cambios en las imágenes, los exámenes de laboratorio y otra información básica. Los resultados se obtuvieron del líquido de lavado alveolar (BALF) de los participantes del estudio, del esputo para las pruebas tradicionales de patógenos (cultivo microbiano y técnicas de detección de ácido nucleico por PCR) y de las pruebas mNGS. Se compararon la tasa positiva de detección de patógenos y la consistencia de los resultados de detección de los dos métodos de detección.