Værdien af ​​mNGS i diagnosticering af lungeinfektion

Lungeinfektion er en almindelig type luftvejsinfektion, der kan føre til flere komplikationer og anses for at være den vigtigste infektionssygdom på verdensplan på grund af dens høje sygelighed og dødelighed. Lungeinfektioner, forårsaget af en eller flere patogener såsom bakterier, vira, svampe og parasitter, er ikke let at skelne klinisk og er blandt de 10 bedste dødsårsager på verdensplan. Derfor er tidlig og præcis identifikation af infektionsårsagen for patienter med lungeinfektion af stor betydning for den efterfølgende behandling og forbedring af prognosen. På nuværende tidspunkt er de vigtigste traditionelle diagnostiske metoder til lungeinfektion mikrobiel kultur, antigen- og antistofdetektion og PCR-nukleinsyredetektionsteknologi. Selvom mikrobiel kultur er guldstandarden for mikrobiel identifikation, tager det lang tid at opdage nogle vira og parasitter. Følsomheden af ​​antigen- og antistofpåvisning er ringe. PCR-nukleinsyrepåvisningsmetoden har høj sensitivitet og specificitet, men den kan ikke påvise alle patogener, der forårsager lungeinfektion. Derfor er det nødvendigt at udvikle en hurtig, bekvem og følsom ny detektionsteknologi til at påvise patogenet af lungeinfektion. næste generations sekventering (NGS) har fordelen af ​​ingen antagelser og ingen afhængighed af kultur og kan påvise alle patogener i kliniske prøver uden bias, og er blevet brugt i vid udstrækning i en række infektionssygdomme. Denne undersøgelse indsamlede de grundlæggende oplysninger om patienter, der var mistænkt for lungeinfektion i klinikken, og udførte mNGS-detektion og rutinemæssig patogendetektion på forskellige prøver af henholdsvis alveolær lavagevæske (BALF) og sputum for at evaluere konsistensen af ​​mNGS-detektion og rutinepåvisning og positiv patogendetektionsrate, såvel som den kliniske anvendelsesværdi af mNGS-detektion.

Denne undersøgelse analyserede retrospektivt 50 patienter indlagt på vores hospital fra januar 2019 til oktober 2019, hvis symptomer, tegn, billeddannelse og infektionsindikatorer opfyldte de diagnostiske kriterier for lungeinfektion, mens rutinemæssig ætiologisk påvisning af sputum og pulmonal alveolær skyllevæske mNGS blev udført .

Kliniske data for relevante patienter blev indsamlet, herunder køn, alder, rygestatus, kliniske manifestationer, opholdstid før mNGS-detektion, antibiotikabrug før mNGS-detektion, billeddannelsesændringer, laboratorieundersøgelse og anden grundlæggende information. Resultater blev indsamlet fra undersøgelsesdeltageres alveolære skyllevæske (BALF), sputum til traditionelle patogentest (mikrobiel kultur og PCR-nukleinsyredetektionsteknikker) og mNGS-test. Den positive rate af patogendetektion og konsistensen af ​​detektionsresultaterne for de to detektionsmetoder blev sammenlignet.