Wartość mNGS w diagnostyce infekcji płuc

Infekcja płuc jest częstym rodzajem infekcji dróg oddechowych, która może prowadzić do wielu powikłań i jest uważana za najważniejszą chorobę zakaźną na świecie ze względu na wysoką zachorowalność i śmiertelność. Infekcje płuc wywołane przez jeden lub więcej patogenów, takich jak bakterie, wirusy, grzyby i pasożyty, nie są łatwe do rozróżnienia klinicznego i należą do 10 głównych przyczyn zgonów na świecie. Dlatego wczesne i dokładne rozpoznanie przyczyny zakażenia u pacjentów z infekcją płuc ma ogromne znaczenie dla dalszego leczenia i poprawy rokowania. Obecnie głównymi tradycyjnymi metodami diagnostycznymi infekcji płuc są hodowla drobnoustrojów, wykrywanie antygenów i przeciwciał oraz technologia wykrywania kwasów nukleinowych metodą PCR. Chociaż hodowla drobnoustrojów jest złotym standardem w identyfikacji drobnoustrojów, wykrycie niektórych wirusów i pasożytów zajmuje dużo czasu. Czułość wykrywania antygenów i przeciwciał jest niska. Metoda wykrywania kwasów nukleinowych metodą PCR charakteryzuje się wysoką czułością i swoistością, jednak nie pozwala wykryć wszystkich patogenów wywołujących infekcję płuc. Dlatego konieczne jest opracowanie szybkiej, wygodnej i czułej nowej technologii wykrywania patogenu infekcji płuc. Zaletą sekwencjonowania nowej generacji (NGS) jest brak założeń i zależność od kultury, a także możliwość bezstronnego wykrywania wszystkich patogenów w próbkach klinicznych. Jest ono szeroko stosowane w leczeniu różnych chorób zakaźnych. W badaniu tym zebrano podstawowe informacje od pacjentów podejrzanych o infekcję płuc w klinice oraz przeprowadzono wykrywanie mNGS i rutynowe wykrywanie patogenu w różnych próbkach, odpowiednio płynu z płukania pęcherzykowego (BALF) i plwociny, aby ocenić spójność wykrywania mNGS i rutynowego wykrywania oraz dodatni współczynnik wykrywalności patogenu, a także wartość zastosowania klinicznego wykrywania mNGS.

W badaniu retrospektywnie przeanalizowano 50 pacjentów hospitalizowanych w naszym szpitalu od stycznia 2019 r. do października 2019 r., których objawy, objawy przedmiotowe, obrazowanie i wskaźniki zakażenia spełniały kryteria diagnostyczne zakażenia płuc, podczas gdy wykonano rutynowe badanie etiologiczne plwociny i płynu z płukania pęcherzyków płucnych mNGS .

Zebrano dane kliniczne odpowiednich pacjentów, w tym płeć, wiek, palenie tytoniu, objawy kliniczne, długość pobytu przed wykryciem mNGS, stosowanie antybiotyków przed wykryciem mNGS, zmiany w badaniach obrazowych, badania laboratoryjne i inne podstawowe informacje. Wyniki zebrano z płynu z płukania pęcherzyków płucnych (BALF) uczestników badania, plwociny do tradycyjnych testów na patogeny (techniki hodowli drobnoustrojów i wykrywania kwasów nukleinowych PCR) oraz testów mNGS. Porównano dodatni współczynnik wykrywania patogenu i zgodność wyników wykrywania obu metod wykrywania.