O valor do mNGS no diagnóstico de infecção pulmonar

A infecção pulmonar é um tipo comum de infecção respiratória que pode levar a múltiplas complicações e é considerada a doença infecciosa mais importante do mundo devido à sua alta morbidade e mortalidade. As infecções pulmonares, causadas por um ou mais patógenos, como bactérias, vírus, fungos e parasitas, não são facilmente distinguíveis clinicamente e estão entre as 10 principais causas de morte em todo o mundo. Portanto, a identificação precoce e precisa da causa da infecção em pacientes com infecção pulmonar é de grande importância para o tratamento subsequente e melhoria do prognóstico. Atualmente, os principais métodos tradicionais de diagnóstico de infecção pulmonar são a cultura microbiana, a detecção de antígenos e anticorpos e a tecnologia de detecção de ácido nucleico por PCR. Embora a cultura microbiana seja o padrão ouro para a identificação microbiana, leva muito tempo para detectar alguns vírus e parasitas. A sensibilidade da detecção de antígenos e anticorpos é baixa. O método de detecção de ácido nucleico por PCR tem alta sensibilidade e especificidade, mas não consegue detectar todos os patógenos que causam infecção pulmonar. Portanto, é necessário desenvolver uma nova tecnologia de detecção rápida, conveniente e sensível para detectar o patógeno da infecção pulmonar. o sequenciamento de próxima geração (NGS) tem a vantagem de não ter suposições e não depender de cultura, e pode detectar todos os patógenos em amostras clínicas sem preconceitos, e tem sido amplamente utilizado em uma variedade de doenças infecciosas. Este estudo coletou as informações básicas de pacientes com suspeita de infecção pulmonar na clínica e conduziu a detecção de mNGS e a detecção de patógenos de rotina em diferentes amostras de líquido de lavagem alveolar (LBA) e escarro, respectivamente, para avaliar a consistência da detecção de mNGS e da detecção de rotina e o taxa de detecção positiva de patógenos, bem como o valor de aplicação clínica da detecção de mNGS.

Este estudo analisou retrospectivamente 50 pacientes internados em nosso hospital de janeiro de 2019 a outubro de 2019, cujos sintomas, sinais, exames de imagem e indicadores de infecção atendiam aos critérios diagnósticos de infecção pulmonar, enquanto a detecção etiológica de rotina de escarro e líquido de lavagem alveolar pulmonar mNGS foi realizada .

Foram coletados dados clínicos de pacientes relevantes, incluindo sexo, idade, tabagismo, manifestações clínicas, tempo de internação antes da detecção de mNGS, uso de antibióticos antes da detecção de mNGS, alterações de imagem, exames laboratoriais e outras informações básicas. Os resultados foram coletados do líquido de lavagem alveolar (BALF) dos participantes do estudo, escarro para testes tradicionais de patógenos (cultura microbiana e técnicas de detecção de ácido nucleico por PCR) e testes mNGS. A taxa positiva de detecção de patógenos e a consistência dos resultados de detecção dos dois métodos de detecção foram comparadas.