Значение mNGS в диагностике легочной инфекции

Легочная инфекция является распространенным типом респираторной инфекции, которая может приводить к множественным осложнениям и считается наиболее важным инфекционным заболеванием во всем мире из-за высокой заболеваемости и смертности. Инфекции легких, вызванные одним или несколькими патогенами, такими как бактерии, вирусы, грибки и паразиты, трудно различимы клинически и входят в число 10 основных причин смерти во всем мире. Поэтому раннее и точное выявление причины инфекции у больных легочной инфекцией имеет большое значение для последующего лечения и улучшения прогноза. В настоящее время основными традиционными методами диагностики легочной инфекции являются посев микробов, выявление антигенов и антител, а также технология ПЦР-детектирования нуклеиновых кислот. Хотя микробная культура является золотым стандартом микробной идентификации, для обнаружения некоторых вирусов и паразитов требуется много времени. Чувствительность обнаружения антигенов и антител низкая. ПЦР-метод обнаружения нуклеиновых кислот обладает высокой чувствительностью и специфичностью, но не позволяет обнаружить все возбудители, вызывающие легочную инфекцию. Поэтому необходимо разработать новую быструю, удобную и чувствительную технологию обнаружения возбудителя легочной инфекции. Преимущество секвенирования следующего поколения (NGS) состоит в том, что оно не требует допущений и не зависит от культуры, позволяет без предвзятости обнаруживать все патогены в клинических образцах и широко используется при различных инфекционных заболеваниях. В этом исследовании была собрана основная информация о пациентах с подозрением на легочную инфекцию в клинике, а также проведено обнаружение mNGS и рутинное обнаружение патогенов в различных образцах жидкости альвеолярного лаважа (BALF) и мокроты, соответственно, для оценки последовательности обнаружения mNGS и рутинного выявления, а также положительный уровень обнаружения патогенов, а также ценность клинического применения обнаружения mNGS.

В этом исследовании ретроспективно проанализировано 50 пациентов, госпитализированных в нашу больницу с января 2019 г. по октябрь 2019 г., чьи симптомы, признаки, визуализация и показатели инфекции соответствовали диагностическим критериям легочной инфекции, при этом проводилось рутинное этиологическое выявление мокроты и жидкости легочного альвеолярного лаважа mNGS. .

Были собраны клинические данные соответствующих пациентов, включая пол, возраст, статус курения, клинические проявления, продолжительность пребывания до обнаружения mNGS, использование антибиотиков до обнаружения mNGS, изменения изображений, лабораторное обследование и другую базовую информацию. Результаты были собраны из жидкости альвеолярного лаважа участников исследования (BALF), мокроты для традиционных тестов на патогены (микробная культура и методы обнаружения нуклеиновых кислот ПЦР) и тестов mNGS. Сравнивались положительная частота обнаружения возбудителя и согласованность результатов обнаружения двух методов обнаружения.