Il valore degli mNGS nella diagnosi dell'infezione polmonare

L’infezione polmonare è un tipo comune di infezione respiratoria che può portare a molteplici complicazioni ed è considerata la malattia infettiva più importante a livello mondiale a causa della sua elevata morbilità e mortalità. Le infezioni polmonari, causate da uno o più agenti patogeni come batteri, virus, funghi e parassiti, non sono facilmente distinguibili clinicamente e sono tra le prime 10 cause di morte nel mondo. Pertanto, l’identificazione precoce e accurata della causa dell’infezione nei pazienti con infezione polmonare è di grande importanza per il successivo trattamento e il miglioramento della prognosi. Attualmente, i principali metodi diagnostici tradizionali per l'infezione polmonare sono la coltura microbica, il rilevamento di antigeni e anticorpi e la tecnologia di rilevamento dell'acido nucleico PCR. Sebbene la coltura microbica sia il gold standard per l’identificazione microbica, è necessario molto tempo per rilevare alcuni virus e parassiti. La sensibilità del rilevamento dell'antigene e dell'anticorpo è scarsa. Il metodo di rilevamento dell'acido nucleico PCR ha un'elevata sensibilità e specificità, ma non è in grado di rilevare tutti gli agenti patogeni che causano infezioni polmonari. Pertanto, è necessario sviluppare una nuova tecnologia di rilevamento veloce, conveniente e sensibile per rilevare l’agente patogeno dell’infezione polmonare. il sequenziamento di nuova generazione (NGS) ha il vantaggio di non avere presupposti e di non dipendere dalla coltura e può rilevare tutti gli agenti patogeni nei campioni clinici senza errori ed è stato ampiamente utilizzato in una varietà di malattie infettive. Questo studio ha raccolto le informazioni di base dei pazienti sospettati di infezione polmonare in clinica e ha condotto il rilevamento mNGS e il rilevamento di routine dei patogeni su diversi campioni di fluido di lavaggio alveolare (BALF) ed espettorato, rispettivamente, per valutare la coerenza del rilevamento mNGS e del rilevamento di routine e il tasso di rilevamento positivo dei patogeni, nonché il valore dell'applicazione clinica del rilevamento mNGS.

Questo studio ha analizzato retrospettivamente 50 pazienti ricoverati nel nostro ospedale da gennaio 2019 a ottobre 2019, i cui sintomi, segni, imaging e indicatori di infezione soddisfacevano i criteri diagnostici per l'infezione polmonare, mentre veniva eseguito il rilevamento eziologico di routine dell'espettorato e del liquido di lavaggio alveolare polmonare mNGS .

Sono stati raccolti dati clinici dei pazienti rilevanti, tra cui sesso, età, abitudine al fumo, manifestazioni cliniche, durata della degenza prima del rilevamento del mNGS, uso di antibiotici prima del rilevamento del mNGS, cambiamenti nell'imaging, esami di laboratorio e altre informazioni di base. I risultati sono stati raccolti dal fluido di lavaggio alveolare (BALF) dei partecipanti allo studio, dall'espettorato per i test tradizionali sui patogeni (colture microbiche e tecniche di rilevamento dell'acido nucleico PCR) e dai test mNGS. Sono stati confrontati il ​​tasso positivo di rilevamento degli agenti patogeni e la coerenza dei risultati di rilevamento dei due metodi di rilevamento.