肺感染症の診断における mNGS の価値

肺感染症は、複数の合併症を引き起こす可能性がある一般的な種類の呼吸器感染症であり、罹患率と死亡率が高いため、世界中で最も重要な感染症とみなされています。 細菌、ウイルス、真菌、寄生虫などの 1 つまたは複数の病原体によって引き起こされる肺感染症は、臨床的に区別するのが難しく、世界の死因の上位 10 位に入っています。 したがって、肺感染症患者の感染原因を早期かつ正確に特定することは、その後の治療と予後の改善にとって非常に重要です。 現在、肺感染症の主な従来の診断方法は、微生物培養、抗原および抗体の検出、および PCR 核酸検出技術です。 微生物培養は微生物同定のゴールドスタンダードですが、一部のウイルスや寄生虫の検出には長い時間がかかります。 抗原および抗体の検出感度は低いです。 PCR核酸検出法は高い感度と特異性を持っていますが、肺感染症を引き起こすすべての病原体を検出できるわけではありません。 したがって、肺感染症の病原体を検出するための、迅速、便利、かつ高感度の新しい検出技術を開発する必要がある。 次世代シーケンス（NGS）は、仮定や培養に依存しないという利点があり、臨床サンプル中のすべての病原体を偏りなく検出でき、さまざまな感染症に広く使用されています。 この研究では、臨床で肺感染症が疑われる患者の基本情報を収集し、肺胞洗浄液 (BALF) と喀痰の異なるサンプルに対してそれぞれ mNGS 検出とルーチン病原体検出を実施し、mNGS 検出とルーチン検出の一貫性を評価し、陽性病原体検出率、および mNGS 検出の臨床応用価値。

この研究では、2019年1月から2019年10月までに当院に入院し、症状、徴候、画像診断および感染指標が肺感染症の診断基準を満たし、喀痰および肺胞洗浄液mNGSの日常的な病因検出が行われた50人の患者を遡及的に分析した。 。

性別、年齢、喫煙状況、臨床症状、mNGS 検出前の入院期間、mNGS 検出前の抗生物質の使用、画像変化、臨床検査およびその他の基本情報を含む、関連する患者の臨床データが収集されました。 結果は、研究参加者の肺胞洗浄液（BALF）、従来の病原体検査（微生物培養および PCR 核酸検出技術）の喀痰、および mNGS 検査から収集されました。 病原体検出の陽性率と 2 つの検出方法の検出結果の一貫性を比較しました。