Význam mNGS v diagnostice plicní infekce

Plicní infekce je běžný typ respirační infekce, která může vést k mnoha komplikacím a je celosvětově považována za nejvýznamnější infekční onemocnění kvůli své vysoké morbiditě a mortalitě. Plicní infekce způsobené jedním nebo více patogeny, jako jsou bakterie, viry, houby a paraziti, nejsou klinicky snadno rozlišitelné a patří mezi 10 nejčastějších příčin úmrtí na celém světě. Včasná a přesná identifikace původce infekce u pacientů s plicní infekcí má proto velký význam pro následnou léčbu a zlepšení prognózy. V současnosti jsou hlavními tradičními diagnostickými metodami plicní infekce mikrobiální kultivace, detekce antigenů a protilátek a technologie detekce nukleových kyselin PCR. Přestože je mikrobiální kultivace zlatým standardem pro identifikaci mikroorganismů, trvá dlouho, než se podaří detekovat některé viry a parazity. Citlivost detekce antigenu a protilátek je špatná. Metoda detekce nukleových kyselin PCR má vysokou senzitivitu a specificitu, ale nedokáže detekovat všechny patogeny způsobující plicní infekci. Proto je nutné vyvinout rychlou, pohodlnou a citlivou novou technologii detekce k detekci patogenu plicní infekce. sekvenování nové generace (NGS) má výhodu v tom, že neexistují žádné předpoklady a není závislá na kultivaci, a dokáže detekovat všechny patogeny v klinických vzorcích bez zkreslení a je široce používána u různých infekčních onemocnění. Tato studie shromáždila základní informace o pacientech s podezřením na plicní infekci na klinice a provedla detekci mNGS a rutinní detekci patogenů na různých vzorcích tekutiny z alveolární laváže (BALF) a sputa, aby se vyhodnotila konzistence detekce mNGS a rutinní detekce a míra pozitivní detekce patogenu, stejně jako klinická aplikační hodnota detekce mNGS.

Tato studie retrospektivně analyzovala 50 pacientů hospitalizovaných v naší nemocnici od ledna 2019 do října 2019, jejichž symptomy, známky, zobrazovací a infekční indikátory splňovaly diagnostická kritéria pro plicní infekci, přičemž byla provedena rutinní etiologická detekce sputa a plicní alveolární lavážní tekutiny mNGS. .

Byla shromážděna klinická data relevantních pacientů, včetně pohlaví, věku, kuřáckého stavu, klinických projevů, délky pobytu před detekcí mNGS, užívání antibiotik před detekcí mNGS, změn zobrazení, laboratorního vyšetření a dalších základních informací. Výsledky byly shromážděny z alveolární lavážní tekutiny (BALF) účastníků studie, sputa pro tradiční testy patogenů (mikrobiální kultivace a techniky detekce nukleových kyselin PCR) a testy mNGS. Byla porovnána pozitivní míra detekce patogenů a konzistence výsledků detekce obou detekčních metod.