Viral etiologi av alvorlig akutt luftveisinfeksjon hos kritisk syke pasientregister (VERIFY)

Data om belastningen, alvorlighetsgraden og etiologien til SARI blant kritisk syke pasienter vil forventes å være av stor verdi for å veilede prioriteringen av forebyggings- og kontrollinnsats18 og i utformingen av fremtidige intervensjonsstudier av antivirale midler og andre terapeutiske modaliteter.

Fordi influensa er en vanlig årsak til alvorlig luftveissykdom i Saudi-Arabia, selv om kun begrensede data er tilgjengelige om de mest alvorlig syke pasientene med influensa, vil vi gjennomføre overvåking av SARI kritisk syke pasienter og utføre typing og subtyping av influensavirus i BAL-prøver. Vi vil lagre prøver for fremtidig undersøkelse av disponerende risikofaktorer inkludert genetiske faktorer.

Multiplex PCR vil redusere kostnadene og tiden for å oppdage respiratoriske patogener. De siste årene har de fallende kostnadene ved Whole Genome Sequencing (WGS) teknologier vist seg å være et verdifullt verktøy for å forstå den økende trusselen fra nye patogener. Metagenomisk neste generasjons sekvensering (M-NGS) har transformativ effekt det siste tiåret for å undersøke og forstå komplekse mikrobielle samfunn. M-NGS er ganske enkelt å fange og bestemme alle nukleinsyrer i en prøve som gjorde det mulig å identifisere en blandet populasjon av mikroorganismer. Denne kraftige plattformen identifiserer samtidig genetikkmateriale til alle organismer uten forutsetninger for andre metoder som brukte spesifikke primere for å identifisere spesifikke mål.

Det primære målet med VERIFY-registeret er å undersøke de virologiske etiologiene til SARI blant mekanisk ventilerte kritisk syke pasienter i et geografisk representativt utvalg fra Saudi-Arabia for å oppnå et bedre estimat av viral patogenprevalens ved systematisk prøvetaking av nedre luftveier og bruk av serologi. blant kritisk syke pasienter i et geografisk representativt utvalg fra Saudi-Arabia. Bidrag fra virus kan være undervurdert på grunn av bruk av prøver fra øvre luftveier, og sen presentasjon av tilfeller til intensivavdelingen (da antigenet ikke lenger kan påvises). Derfor vil en systematisk tilnærming ved bruk av mini-BAL for å oppnå lavere luftveisprøver sannsynligvis gi bedre estimat.