Eziologia virale dell'infezione respiratoria acuta grave nel registro dei pazienti critici (VERIFY)

Si prevede che i dati sul peso, sulla gravità e sull’eziologia della SARI tra i pazienti critici saranno di grande valore nel guidare la definizione delle priorità degli sforzi di prevenzione e controllo18 e nella progettazione di futuri studi di intervento sugli antivirali e altre modalità terapeutiche.

Poiché l’influenza è una causa comune di gravi malattie respiratorie in Arabia Saudita, sebbene siano disponibili solo dati limitati sui pazienti più gravemente affetti da influenza, condurremo una sorveglianza nei pazienti critici SARI ed eseguiremo la tipizzazione e la sottotipizzazione dei virus influenzali nei campioni BAL. Conserveremo i campioni per l'esame futuro dei fattori di rischio predisponenti, compresi i fattori genetici.

La PCR multiplex ridurrà i costi e i tempi necessari per rilevare gli agenti patogeni respiratori. Negli ultimi anni, la riduzione dei costi delle tecnologie Whole Genome Sequencing (WGS) si è rivelata uno strumento prezioso per comprendere la crescente minaccia dei patogeni emergenti. Il sequenziamento metagenomico di nuova generazione (M-NGS) ha avuto un effetto trasformativo nell'ultimo decennio per studiare e comprendere comunità microbiche complesse. M-NGS sta semplicemente catturando e determinando tutti gli acidi nucleici in un campione che ha permesso di identificare una popolazione mista di microrganismi. Questa potente piattaforma identifica simultaneamente i materiali genetici di qualsiasi organismo imparziale rispetto ad altri metodi che utilizzavano primer specifici per identificare bersagli specifici.

L'obiettivo primario del registro VERIFY è quello di esaminare le eziologie virologiche della SARI tra pazienti critici ventilati meccanicamente in un campione geografico rappresentativo dell'Arabia Saudita al fine di ottenere una stima migliore della prevalenza dei patogeni virali mediante campionamento sistematico del tratto respiratorio inferiore e uso della sierologia tra i pazienti critici in un campione geografico rappresentativo dell’Arabia Saudita. Il contributo dei virus può essere sottostimato a causa dell'uso esclusivo di campioni del tratto respiratorio superiore e della presentazione tardiva dei casi in terapia intensiva (momento in cui l'antigene non è più rilevabile). Pertanto un approccio sistematico che utilizza il mini-BAL per ottenere campioni delle vie respiratorie inferiori produrrà probabilmente una stima migliore.